金针菇凝集素基因Fv-mJRL1的生物信息学分析及其共表达

发布时间：2017-09-16 14:06

  本文关键词：金针菇凝集素基因Fv-mJRL1的生物信息学分析及其共表达

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【摘要】：Jacalin凝集素(jacalin-related lectins,JRLs)是一类含有一个或多个JRL结构域的蛋白质,参与生物或非生物环境刺激应答.本研究基于金针菇(Flammulina velutipes)基因组数据,注释筛选到其中一个JRL基因Fv-mJRL1,对其基因结构、蛋白质性质进行了生物信息学分析,并利用其上游调控序列进一步预测到该基因潜在的转录因子Fv-Mbp1.通过实时荧光定量PCR分析得知,无论是在不同栽培基质培养的金针菇菌丝还是在金针菇各发育时期的组织中,Fv-mJRL1基因与潜在的转录因子基因Fv-Mbp1之间都存在极强的共表达规律.生物信息学及实时荧光定量PCR分析为筛选挖掘基因潜在的转录因子提供便利,后期仍需利用下游分子实验进行更为精确的验证.
【作者单位】： 福建农林大学生命科学学院菌物研究中心;
【关键词】： jacalin凝集素 子实体形成 潜在转录因子 皮尔森相关系数
【基金】：国家重点基础研究发展计划(973计划)(2014CB138302)
【分类号】：S646.15
【正文快照】： 金针菇营养丰富且味道鲜美,具有很高的食用和药用价值,是我国和东南亚地区重要的商业性栽培食用菌.金针菇属低温结实性食用菌,菌丝生长适宜温度为20~23℃,原基形成适宜温度为3~18℃[1].菌丝营养生长结束之后,需要低温处理刺激原基形成,但这种低温刺激影响金针菇结实的分子机理，

本文编号：863480