CCL5、CCR5和MIF基因多态性与结核病易感性研究

发布时间：2017-09-17 20:33

  本文关键词：CCL5、CCR5和MIF基因多态性与结核病易感性研究

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【摘要】：目的探讨趋化因子5(CCL5)、趋化因子受体5(CCR5)和巨噬细胞迁徙抑制因子(MIF)基因多态性与中国汉族人群结核病(tuberculosis,TB)易感性的关系。方法本研究采用病例对照研究方法,选取2014年2月至2015年4月首都医科大学附属北京胸科医院收治的428例结核病患者作为病例组;选取387名健康志愿者作为对照组。采集研究对象静脉血,使用竞争性等位基因特异性PCR方法(Kompetitive Allele Specific PCR,KASP)检测其CCL5启动子区rs2280788和rs2107538基因型,CCR5启动子区rs1799987,MIF rs2070767。使用R语言计算各基因位点Hardy-Weinberg平衡评估样本群体代表性,计算病例组和对照组的基因型及等位基因频率,并对其分布情况进行比较,分析各基因多态性与TB患病的相关性。应用Haploview4.2软件构建CCL5基因单倍型,构建形成基因双倍体,并分析其与结核病易感性相关性。使用多因子降维法分析各基因位点之间交互作用及logistic回归。结果CCL5启动子区rs2280788基因位点CC、CG、GG基因型及等位基因C、G的频次和频率病例组分别为:77%(330/428)、22%(94/428)、1%(4/428)和88%(754/856)、12%(102/856);对照组分别为:76%(295/387)、22%(87/387)、1%(5/387)和87%(677/774)、13%(97/774),两组之间基因型分布和等位基因分布差异均无统计学意义(χ2值分别为0.28和0.0923,P值均0.05)。CCL5启动子区rs2107538基因位点CC、CT、TT基因型及等位基因C、T的频次和频率病例组分别为:42%(178/428)、46%(196/428)、13%(54/428)和64%(552/856)、36%(304/856);对照组分别为:36%(139/387)、51%(197/387)、13%(51/387)和61%(475/774)、39%(299/774),两组之间基因型分布和等位基因分布差异均无统计学意义(χ2值分别为2.831和1.5627,P值均0.05)。CCR5启动子区rs1799987基因AA、AG、GG基因型及等位基因A、G的频次和频率病例组分别为:18%(77/428)、57%(245/428)、25%(106/428)和47%(399/856)、53%(457/856);对照组分别为:16%(67/387)、51%(197/387)、33%(128/387)和41%(321/774)、59%(453/774),两组之间基因型分布和等位基因分布差异均有统计学意义(χ2值分别为6.8545和4.1475,P值均0.05)。携带该位点基因型GG和等位基因G可降低TB患病风险[OR(95%CI)值分别为:0.68(0.50~0.91)、0.78(0.64~0.94)]。MIF的rs2070767基因位点CC、CT、TT基因型及等位基因C、T的频次和频率病例组分别为:38%(162/428)、50%(216/428)、12%(50/428)和63%(540/856)、37%(316/856);对照组分别为:42%(162/387)、47%(180/387)、12%(50/387)和65%(504/774)、35%(270/774),两组之间基因型分布和等位基因分布差异均无统计学意义(χ2值分别为1.477和0.6434,P值均0.05)。对CCL5基因构建的单倍型及双倍体分析,发现由rs2280788和rs2107538位点构成的G-C单倍型与结核病易感性显著相关(OR=4.13,95%CI:1.35-16.85),CG-CC组成的双倍型与结核病易感性显著相关(OR=12.07,95%CI:1.8-513.99)。分析各基因位点之间MDR交互作用,rs1799987位点有统计学意义。logistic回归模型中发现rs1799987及AA相对于AG更易患病,而GG相较于AG也更易患病。结论在本研究中未发现CCL5启动子区rs2280788、rs2107538和MIF启动子区rs2070767基因多态性与结核病患病相关。携带CCR5启动子区rs1799987基因位点基因型GG和等位基因G可降低TB患病风险。CCL5基因rs2280788和rs2107538多态性位点构建的单倍型G-C可能是结核病发病的危险因素,构建形成的双倍体CG-CC是结核病发病的危险因素。MDR交互作用和logistic回归分析均发现rs1799987与结核病发病相关。
【关键词】：趋化因子类 多态性 单核苷酸 结核病 疾病易感性
【学位授予单位】：北京市结核病胸部肿瘤研究所
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R52
【目录】：

• 中英文缩略词对照表5-7
• 中文摘要7-9
• 英文摘要9-11
• 前言11-16
• 材料与方法16-26
• 结果26-34
• 讨论34-40
• 实验结论40-41
• 参考文献41-51
• 文献综述 CCR5及配体基因多态性与结核病易感性研究进展51-66
• 参考文献59-66
• 攻读学位期间发表论文情况66-67
• 致谢67-68
• 个人简历68

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前3条

1 张建武;邢志伟;李欣;孙志平;孙红梅;贾建雷;;CCL3和CCL4基因多态性与肺结核易感性的关系[J];山东医药;2014年40期

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本文编号：871188