中国西南地区主要地方绵羊Cytb基因遗传多样性及系统进化的研究

发布时间：2017-09-18 23:29

  本文关键词：中国西南地区主要地方绵羊Cytb基因遗传多样性及系统进化的研究

  更多相关文章： 绵羊 细胞色素b基因(Cytb) 遗传多样性 群体结构 演进历史

【摘要】：目前对我国西南地区绵羊(Ovis areis)群体研究的报道较少,为探究我国西南地区绵羊遗传多样性、群体结构和演进历史,本研究利用Oligo 6.0软件设计引物对8个地方绵羊群体和2个引入品种群体183只线粒体细胞色素b(cytochrome,Cytb)基因全长进行测序,并利用MEGA 5.2、Dna SP 5、Phylip 3.695和Network 4.0等软件对其群体进行分析。其研究结果表明,所发现的153个多态位点共确定了62种单倍型;10个绵羊群体的平均单倍型多样度为0.792;平均核苷酸多样度为0.002 43;平均核苷酸差异数为5.054。10个群体的核苷酸多样度(nucleotide diversity,Pi)差异较大,变化范围为0.001 28~0.006 55,核苷酸多样度最大和最小的群体分别为以贵德黑裘皮羊(0.006 55)和昭通绵羊(0.001 28);单倍型多样度(haplotype diversity,Hd)最高和最低的群体分别是西藏羊(0.924)和腾冲绵羊(0.582),结果说明,云南3个绵羊群体的遗传多样性水平较低,其他几个绵羊群体的遗传多样性水平较高。分子方差分析(analysis of molecular variance,AMOVA)分析结果说明,10个绵羊群体间的遗传变异为13%,而87%为群体内的遗传变异,两者比例悬殊,说明所选10个绵羊群体间的变异绝大部分来自群体内。通过构建系统进化树和网络系统分析显示本研究中绵羊群体至少可以分为3个支系,但是西南群体以支系A和支系B为主。本研究结果为制定我国西南地区绵羊保种方案以及合理利用等提供理论参考。
【作者单位】： 全国畜牧总站畜禽遗传资源保存利用中心;洛阳市洛瑞牧业有限公司;云南农业大学动物科技学院;
【关键词】： 绵羊 细胞色素b基因(Cytb) 遗传多样性 群体结构 演进历史
【基金】：物种资源保护畜禽种质资源保护项目资金(No.农财发[2014]35号)
【分类号】：S826
【正文快照】： 650201线粒体DNA(mitochondrial DNA,mt DNA)具有分子量小、突变率高、进化速度快和无组织特异性等优点。突变率高或任何突变都可能会影响线粒体内部不同核酸区域的进化速率,这就适用于不同水平的进化分析,从而也使mt DNA标记成为研究家畜遗传多样性及演进历史有力的工具(Zede

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本文编号：878177