鸡importin β1基因的克隆及生物信息学分析

发布时间：2017-09-22 03:11

  本文关键词：鸡importin β1基因的克隆及生物信息学分析

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【摘要】：[目的]对鸡importin β1基因进行克隆和生物信息学分析。[方法]根据Gen Bank公布的鸡importin β1基因序列(XM_015299473)设计合成特异性引物,通过RT-PCR从DF-1细胞中扩增importin β1基因CDS区并进行克隆和测序,利用生物信息学工具对其理化性质、二级结构和系统进化树进行分析。[结果]鸡importin β1基因CDS全长2 268bp,共编码755个氨基酸,该蛋白等电点为4.61,相对分子质量84.15 k Da,分子式为C3712H5901N979O1152S46。蛋白质二级结构预测显示,鸡importin β1蛋白含有丰富的二级结构,以α-螺旋为主(占64.90%)。importin β1基因同源性及系统进化树分析结果表明鸡与鹌鹑的亲缘关系最近。[结论]鸡importin β1基因的克隆和生物信息学分析为进一步研究其功能奠定了基础。
【作者单位】： 贵州大学动物科学学院;贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室;
【关键词】： 鸡importin β基因 克隆 生物信息学
【基金】：国家自然科学基金项目(“新城疫病毒M蛋白细胞核定位的分子机制及功能研究”,No.31502074) 贵州省省校合作计划项目(“贵州省三穗鸭源新城疫病毒监测及其防控体系研究”,黔科合LH字[2014]7669号) 贵州省科学技术基金项目(“以新城疫病毒为载体的新型鸭疫里默氏杆菌疫苗的研制及免疫保护效力研究”,黔科合J字[2015]2054号) 贵州大学引进人才科研项目(“三穗鸭源新城疫病毒SS-1株反向遗传操作平台的建立及其初步应用”,贵大人基合字[2014]10号)
【分类号】：S831
【正文快照】： importinβ蛋白是一类在真核生物中广泛分布的核质转运受体蛋白,到目前为止,在人类细胞中发现importinβ家族成员超过20个,而在酵母细胞中大约有14个成员[1]。importinβ1蛋白属于importinβ家族重要成员之一,其在细胞的基因转录、细胞周期调控及增殖分化等过程中发挥着重要作

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