玉米新型氧甲基转移酶基因的全基因组鉴定、进化与表达研究

发布时间：2017-09-25 22:12

  本文关键词：玉米新型氧甲基转移酶基因的全基因组鉴定、进化与表达研究

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【摘要】：利用生物信息学分析方法挖掘玉米(Zea mays)不同组织间差异表达的基因,揭示玉米生长发育过程的分子机理,本研究从NCBI数据库中下载获得玉米自交系Mo17和B73根和芽的转录组数据,发现了5个在根中高表达的氧甲基转移酶(O-methyltransferase,OMT)基因,在B73全基因组中鉴定到另外的23个拷贝。对玉米的28个氧甲基转移酶基因的结构、保守模体以及进化分析表明,其不同于咖啡酸氧甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferase,COMT)基因和咖啡酰辅酶A氧甲基转移酶(caffeoyl coenzyme A 3-O-methyltransferase,CCo AOMT)基因,是一类新型的氧甲基转移酶基因家族。这类基因家族含有5个进化分支,其中有两个进化分支分别包含苯并VA嗪类基因7(benzoxazinless 7,Bx7)和Bx10,参与苯并VA嗪类物质的生物合成,表明该类基因在玉米的抗病虫反应中发挥着重要作用。染色体结构与进化分析表明,这类新型氧甲基转移酶基因家族的扩增大多是通过串联重复和片段复制来实现的。对这些基因在玉米的巢式关联定位(nested association mapping,NAM)群体亲本中的表达模式分析表明,其表达模式十分复杂。该研究结果为进一步了解COMT基因的生物学功能及其利用提供了理论依据和参考,并对研究该基因家族的催化机制及其表达调控模式具有重要的指导意义。
【作者单位】： 浙江大学生命科学学院;浙江大学农业与生物技术学院;
【关键词】： 氧甲基转移酶(OMT) 基因复制 新功能化 苯并VA嗪 玉米
【基金】：国家自然科学基金(No.31171165)
【分类号】：Q943.2
【正文快照】：

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

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【共引文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 范苗;陈铭;徐建红;;玉米新型氧甲基转移酶基因的全基因组鉴定、进化与表达研究[J];农业生物技术学报;2016年08期

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前4条

1 范玉洁;林飞鹏;安泽伟;唐朝荣;;一个橡胶树谷胱甘肽-S-转移酶基因的克隆和表达特性分析[J];中国农业科学;2011年20期

2 倪志勇;吕萌;李波;王娟;白岩;范玲;;棉花咖啡酸-O-甲基转移酶基因的克隆及特征分析[J];中国农业科学;2010年06期

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【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 倪志勇;吕萌;马文静;陈艳;范玲;;棉花咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶基因的克隆及表达[J];西北植物学报;2009年10期

2 李雪平;高志民;彭镇华;岳永德;;绿竹咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶基因的克隆与分析[J];分子植物育种;2008年03期

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7 宋银;王东浩;吴锦斌;周露;王国栋;王U喼，

本文编号：919841