大豆再生相关基因GmRUB1的克隆及表达分析

发布时间：2017-09-26 00:34

  本文关键词：大豆再生相关基因GmRUB1的克隆及表达分析

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【摘要】：大豆再生过程涉及细胞的分裂和分化、器官的决定和形成。RUB1基因在物质的转移和积累以及泛素化过程等多层次、多途径发挥着重要的调控作用。本研究利用实验室前期转录组测序技术得到差异表达基因GmRUB1,该基因是大豆再生中泛素化过程重要的组成部分,应用PLACE数据库、Interpro、expasy数据库、SOPMA、Phyre、Protscale、MEGA5等工具对该基因的启动子元件、编码氨基酸的功能、亲水性、疏水性、等电点、二级结构、三级结构、同源性比较进行分析。并研究了该基因在大豆品种东农50各器官中的表达分析。结果表明,其前体序列具有很多与再生相关的响应元件,理论等电点为7.67,脂肪系数为79.34,稳定系数为48.06,属于不稳定蛋白,GmRUB1编码的蛋白属于泛素结合蛋白,有一个泛素化过程中的E2连接酶的结构域,二级结构中24.59%为α螺旋结构,39.34%为不规则卷曲,10.93%为β转角,25.14%为延伸链,三级结构共有122个氢键,6个螺旋结构,18个转角结构,亲水性平均系数为-0.389,GmRUB1基因与苜蓿亲缘较近,qRT-PCR结果表明GmRUB1的表达量在果实中较高,说明GmRUB1基因可能参与大豆再生过程。随后对该基因进行了克隆及表达载体构建。上述结果初步分析了GmRUB1基因编码氨基酸的生物信息学及表达情况。并通过对其进行克隆和载体构建,对今后进一步研究该基因的功能,提高大豆再生率,建立稳定的大豆再生体系提供了理论基础。
【作者单位】： 东北农业大学农学院大豆生物学教育部重点实验室;65301部队农副业基地;
【关键词】： GmRUB 克隆 大豆 再生 生物信息学
【基金】：黑龙江省杰出青年基金(JJ2016JQ0029) 哈尔滨市优秀学科带头人项目(2015RQXXJ018) 东北农业大学大学生SIPT项目共同资助
【分类号】：S565.1;Q943.2
【正文快照】： *通讯作者,xxwu2012@126.comCloning and Expression Analysis of Regeneration Related Gene Gm RUB1in SoybeanYu Yicheng1Pan Xiaocheng2Xu Mengjie1Zhang Hechun1Wang Lingdong1Wei Yi1Wu Xiaoxia1*1 Key Laboratory of Soybean Biology in Chinese Ministry of Education，

本文编号：920516