利用转录组测序方法研究獭兔毛色相关基因

发布时间：2017-09-26 19:45

  本文关键词：利用转录组测序方法研究獭兔毛色相关基因

  更多相关文章： 转录组测序 獭兔 毛色 差异表达 GO和KEGG通路分析

【摘要】：利用转录组测序方法分析了不同毛色(白色和海狸色)獭兔皮肤组织中基因的表达差异,旨在找到影响獭兔毛色的候选基因。采用Illumina Hi Seq TM2500测序平台对不同毛色獭兔耳组织中所有m RNA进行高通量测序,所得序列经质控、组装后比对到GO、COG、SWISS-PROT数据库中注释,并进行差异表达基因聚类分析和KEGG通路分析。结果表明:测序共获得Unigene 275 625个,差异表达基因12 408个,其中上调表达基因4 904个,下调表达基因7 504个。KEGG通路分析发现,这些差异基因显著地富集在13个代谢通路中,并在细胞色素代谢通路(metabolism of xenobiotics by cytochrome P450)中有8个差异表达的基因,其中CP2F1和CP2BB属于细胞色素P450家族成员,而GSTA4与黑素细胞分化有关,可能在獭兔毛色中发挥作用。
【作者单位】： 山西省农业科学院畜牧兽医研究所;
【关键词】： 转录组测序 獭兔 毛色 差异表达 GO和KEGG通路分析
【基金】：国家兔产业技术体系项目(CARS-44-B-6) 山西省农科院博士基金项目(YBSJJ1401)
【分类号】：S829.1
【正文快照】： 獭兔,学名力克斯兔(Rex rabbit),是世界著名的皮用兔品种,因其皮毛具有“短、平、密、细、美、牢”等特点,制作的服饰色彩斑斓、轻柔飘逸而受到人们的喜爱。獭兔毛色众多,已发展出海狸色、蓝色、青紫蓝、红色等二十多种色型,九十多种颜色[1]。中国是养兔大国,年产獭兔皮张和出

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 邢少辰,林秀峰;分离基因的有效手段-mRNA差异显示技术[J];吉林农业科学;2004年02期

2 杜娟,林戈,卢光t;人胚胎干细胞和分化细胞差别基因的筛选[J];遗传学报;2004年09期

3 张冉;林浴霜;;不同品种鸡MSTN基因表达差异的研究[J];中国家禽;2012年06期

4 唐婷;柳峰松;任国栋;;谢氏宽漠王β-actin基因cDNA克隆、序列分析及表达量检测[J];昆虫学报;2008年11期

5 何蕾;薛仁宇;曹广力;胡小龙;贡成良;;基于RNA-Seq技术分析家蚕卵巢培养细胞(BmN)高表达基因[J];蚕业科学;2014年03期

6 杨红兰;张道远;刘燕;马瑞;张元明;;齿肋赤藓乙醛脱氢酶基因ALDH21的克隆与表达分析[J];基因组学与应用生物学;2010年01期

7 周鑫;柴保国;赵卫东;郑振宇;;小鼠早期胚胎发育过程中胚胎发育相关功能基因mRNA的表达[J];河南农业大学学报;2010年06期

8 王金玲;单雪松;杨雨江;王雪丽;;北京鸭/番鸭杂交体系肝脏组织基因表达差异的研究[J];家畜生态学报;2009年01期

9 单雪松;崔庆媛;李克鹏;王雪丽;杨雨江;;北京鸭×番鸭杂种优势相关基因表达差异研究[J];南京农业大学学报;2010年01期

10 崔庆媛;单雪松;李克鹏;梁国鹏;;北京鸭/番鸭杂交体系肌肉组织基因表达差异的研究[J];黑龙江畜牧兽医;2010年05期

中国重要会议论文全文数据库 前6条

1 张文俊;江华;赵耀忠;朱晓海;刘安堂;;皮肤恶性黑色素瘤与良性痣基因表达差异的研究[A];第四届华东六省一市整形外科学术会议暨2007年浙江省整形、美容学术会议论文汇编[C];2007年

2 杨劲松;郑新民;陈诗书;;诱导PTPα表达24小时NIH3T3细胞基因表达差异的研究[A];中国生物化学与分子生物学会第八届会员代表大会暨全国学术会议论文摘要集[C];2001年

3 孟金萍;刘云波;张以河;孙淑华;王艳蓉;吕凤柱;杨旭;;铅暴露U251细胞基因表达谱改变及基因通路分析[A];实验动物与药理学、毒理学研究学术交流会论文汇编[C];2009年

4 刘丹慧;陈少松;罗崇林;肖雪媛;何大澄;;一个在肺癌中缺失的基因的筛选与初步研究[A];中国细胞生物学学会2005年学术大会、青年学术研讨会论文摘要集[C];2005年

5 宾晓农;谭敏;吕嘉春;蒋义国;陈家X;;基因芯片筛选BPDE转化16HBE相关基因的研究[A];第五届广东省环境诱变剂学会暨第三届广东省预防医学会卫生毒理专业委员会学术交流会论文集[C];2006年

6 霍晓芳;张俊武;;红系分化相关基因的鉴别与功能研究[A];中国遗传学会七届一次青年研讨会暨上海高校模式生物E——研究院第一届模式生物学术研讨会论文汇编[C];2005年

中国重要报纸全文数据库 前4条

1 吴一福;第四军医大学发现抑癌新基因[N];中国医药报;2008年

2 柯尊洪;基因技术在中药研究中的作用[N];中国中医药报;2002年

3 王兴 闫智勇 郝晓锋;借助基因技术发展现代中药[N];中国医药报;2003年

4 本报记者 吴红月;医院病理科借助基因检测延伸新服务[N];科技日报;2014年

中国博士学位论文全文数据库 前10条

1 李倩;转Nramp1基因克隆牛的研制[D];西北农林科技大学;2015年

2 朱明库;番茄SlNAC4和SlDEAD31基因在果实成熟及非生物胁迫响应中的功能研究[D];重庆大学;2015年

3 陈鹏程;人类分子相互作用在线资源及多物种的基因集功能关联分析工具的建立[D];浙江大学;2015年

4 孙占斌;粉红螺旋聚孢霉67-1菌寄生相关基因的筛选与功能研究[D];中国农业科学院;2015年

5 韩洪强;控制茄子果型相关性状关键基因的克隆及功能研究[D];上海交通大学;2014年

6 王X;牦牛基因组遗传变异图谱和高原适应的转录组研究[D];兰州大学;2015年

7 吴全金;‘白鸡冠’茶树响应光调控的基因差异及理化特征分析[D];福建农林大学;2015年

8 王春丽;AML1/ETO阳性白血病APP基因的临床意义、生物学功能及其作用机制研究[D];南方医科大学;2015年

9 李鑫;小鼠腭裂相关基因的克隆、筛选及功能的研究[D];中国人民解放军第四军医大学;2003年

10 孙各琴;幽门螺杆菌可塑区JHP947基因功能的初步研究[D];福建医科大学;2008年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 汤常永;梨‘中矮1号’矮生基因的筛选及PcAHS克隆与表达分析[D];中国农业科学院;2015年

2 王庆峰;胶质类芽孢杆菌胞外多糖调节及相关基因的转录分析[D];中国农业科学院;2015年

3 冬方;鲫鱼耐盐碱基因的筛选及验证[D];上海海洋大学;2015年

4 王洋;多氯联苯代谢过程中红球菌应激反应相关基因的研究[D];山西大学;2015年

5 陈明明;基于基因本体术语相似性的通路功能网络构建和分析[D];哈尔滨工业大学;2015年

6 唐奇;CRYAB基因在HCC中的表达、临床预后分析及抗凋亡功能研究[D];南京医科大学;2007年

7 杨波波;不同肿瘤基因表达分析中内参基因的选择和研究[D];西北大学;2014年

8 陈海英;HP450基因的克隆及其重组逆转录病毒载体pLXSN-HP450的构建和鉴定[D];广西医科大学;2006年

9 郭建军;转反义TrxS基因小麦种子发育过程中基因表达差异分析[D];河南农业大学;2009年

10 梁正翠;鸭的色素相关基因ASIP和AGRP的研究[D];扬州大学;2010年

，

本文编号：925401