基于线粒体COI基因的毛蚶群体遗传多样性

发布时间：2017-09-26 19:37

  本文关键词：基于线粒体COI基因的毛蚶群体遗传多样性

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【摘要】：采用PCR技术,扩增了大连、乳山、烟台、舟山4个毛蚶(Scapharca subcrenata)地理群体共38个个体的线粒体COI基因部分序列,并分析了4个毛蚶群体的遗传多样性和系统发育关系。研究结果显示:38个毛蚶COI部分序列经处理得到长度均为625bp的基因片段,共分为30种单倍型;基于COI部分序列的分析结果,毛蚶4个地理群体总的变异位点为301个,多样性指数Pi为0.15048,平均核苷酸差异数为92.242,单倍型多样性指数S为241。聚类分析显示毛蚶大连群体、乳山群体和烟台群体具有高度的遗传多样性,3个群体交叉聚在一起,没有明显的群体分化;舟山群体单独聚为一支,与其他3个群体分化明显。研究表明,线粒体COI基因不能单独做为毛蚶大连、乳山和烟台群体的遗传标记,但可以作为毛蚶舟山群体的有效群体遗传标记,为线粒体COI基因在群体遗传学的应用提供了基础资料。
【作者单位】： 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所;上海海洋大学水产与生命学院;
【关键词】： 毛蚶(Scapharca subcrenata) COI基因 群体 遗传多样性
【基金】：国家科技部基础工作专项(2013FY110700) 黄海水产研究所级基本科研业务费资助(20603022013032)~~
【分类号】：S917.4
【正文快照】： 毛蚶(Scapharca subcrenata),俗称瓦楞子或毛蛤,属软体动物门(Mollusca),双壳纲(Bivalvia),翼形亚纲(Pteriomorphia),蚶目(Arcoida),蚶科(Arcidae),毛蚶属(Scapharca),广泛分布于中国、朝鲜和日本沿海[1],在中国的渤海、黄海、东海、南海均有大量分布,是中国北方重要经济贝类

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 孙超;刘志鸿;杨爱国;周丽青;吴彪;严加坤;侯丫;董春光;;光滑河蓝蛤3个野生群体线粒体COI基因遗传多样性研究[J];湖南农业科学;2013年07期

2 杨光;杨玉香;;毛蚶幼体下沉原因分析及解决方法[J];河北渔业;2012年06期

3 陈蓉;刘建勇;唐连俊;饶颖竹;;中国5个海区不同群体毛蚶形态差异分析[J];海洋科学;2009年07期

4 郑文娟;朱世华;沈锡权;刘必谦;潘志崇;叶央芳;;基于线粒体COI基因序列探讨泥蚶的遗传分化[J];动物学研究;2009年01期

5 王晓梅;郭永军;戴伟;朱静;;不同群体毛蚶rDNA转录间隔区RFLP及序列分析[J];四川动物;2008年05期

6 牛东红;李家乐;沈和定;姜志勇;;缢蛏六群体线粒体DNA-COI基因序列变异及群体遗传结构分析[J];海洋学报(中文版);2008年03期

7 赵新生;徐国成;万东善;;毛蚶升温促熟人工育苗技术研究[J];中国水产;2008年03期

8 程汉良;夏德全;吴婷婷;孟学平;吉红九;董志国;陈淑吟;;6种帘蛤科贝类及4个地理种群文蛤线粒体COI基因片段序列分析[J];海洋学报(中文版);2007年05期

9 李旭光;阎斌伦;许广平;陈建华;董志国;吴兴兵;许璞;杨家新;;毛蚶三个地理群体生化遗传特征分析[J];海洋渔业;2007年03期

10 陈建华;阎斌伦;高焕;;毛蚶生物学特性及其研究进展[J];河北渔业;2006年09期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 孟辉辉;曹荣;刘淇;魏玉西;;超高压处理在毛蚶脱壳和减菌化中的作用研究[J];食品安全质量检测学报;2016年01期

2 李宏俊;张晶晶;袁秀堂;张安国;柳圭泽;邵魁双;王立俊;;利用线粒体COI和微卫星标记分析文蛤7个地理群体的遗传变异[J];生态学报;2016年02期

3 田吉腾;侯丫;刘志鸿;杨爱国;吴彪;周丽青;董春光;;基于线粒体COI基因的毛蚶群体遗传多样性[J];海洋科学;2016年01期

4 程雪艳;滕爽爽;肖国强;邵艳卿;张炯明;方军;柴雪良;;基于微卫星的泥蚶5个地理群体遗传多样性分析[J];海洋科学;2015年11期

5 王冲;孙同秋;王玉清;张凯;王志忠;邱兆星;;不同群体毛蚶形态性状对重量性状的影响效果分析[J];海洋渔业;2015年05期

6 卢亚楠;王丽;丛玉婷;王连顺;杨国军;;毛蚶壳形态性状对重量性状的影响分析[J];河北渔业;2015年08期

7 王庆志;张明;滕炜鸣;周遵春;谭克非;杜尚昆;;毛蚶养殖生物学研究进展[J];大连海洋大学学报;2015年04期

8 产久林;姜华鹏;刘一萌;胡星星;王丛丛;许强华;;COⅠ和16S rRNA基因在高原裂腹鱼物种鉴定中的应用[J];水生态学杂志;2015年04期

9 李莉;郑永允;徐科凤;邱兆星;郭萍萍;;不同贝龄毛蚶壳形态性状对体质量的影响[J];海洋科学;2015年06期

10 高霄龙;李莉;邱兆星;郑永允;李琪;;生态因子对红螯相手蟹捕食毛蚶苗种的影响[J];生态学报;2015年11期

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 孟学平;高如承;申欣;王帅;程汉良;董志国;阎斌伦;;西施舌5个地理群体ITS1序列变异及系统发生分析[J];生态学报;2010年20期

2 孙宝超;杨建敏;孙国华;刘相全;刘丽娟;王卫军;郑小东;;中国沿海长蛸(Octopus variabilis)自然群体线粒体COI基因遗传多样性研究[J];海洋与湖沼;2010年02期

3 葛立军;杨玉香;梁维波;;不同饵料对毛蚶幼体发育的影响[J];水产科学;2008年05期

4 张凤英;马凌波;施兆鸿;马春艳;;3种鲳属鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化[J];中国水产科学;2008年03期

5 林琪;李少菁;黎中宝;王桂忠;;中国东南沿海青蟹属不同种类的mtDNA COI基因序列分析及其系统发育[J];厦门大学学报(自然科学版);2008年02期

6 王辉;刘志刚;符世伟;;南海毛蚶形态特征对体重的相关分析[J];热带海洋学报;2007年06期

7 程汉良;夏德全;吴婷婷;孟学平;吉红九;董志国;陈淑吟;;6种帘蛤科贝类及4个地理种群文蛤线粒体COI基因片段序列分析[J];海洋学报(中文版);2007年05期

8 季军;杨四海;田大成;;水稻基因组中抗病基因正选择方式及基因转换的研究[J];中国农业科学;2007年09期

9 尤仲杰;包永波;张爱菊;;中国沿海西施舌5个自然群体形态差异和RAPD分析[J];海洋学报(中文版);2007年03期

10 苏天凤;黄建华;吴进锋;江世贵;;2种东风螺线粒体基因序列多态性研究[J];中国水产科学;2007年03期

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 陈仕江;鲁增辉;廖玉凤;黄戈;殷幼平;;7种中药材斑蝥COI基因序列的分子系统学研究[J];西南农业学报;2013年05期

2 陈哲;张姜;傅杭飞;许争争;邓坤正;张加勇;;基于形态特征和线粒体COI基因探讨扶桑绵粉蚧物种的有效性并记述一体色变异型扶桑绵粉蚧[J];生物多样性;2012年04期

3 雷忻;廉振民;雷富民;尹祚华;赵洪峰;;基于线粒体COI基因探讨瀇亚科部分属和种的分类地位[J];动物学研究;2007年03期

4 赵竹;宋云;许瑾;;基于COI基因对犀角工艺品真伪的鉴别[J];中国畜牧兽医文摘;2014年03期

5 马凌波;张凤英;乔振国;何利军;马春艳;;中国东南沿海青蟹线粒体COI基因部分序列分析[J];水产学报;2006年04期

6 李咏梅;陈秀荔;彭敏;马宁;黎铭;杨春玲;蒋伟明;曾地刚;陈晓汉;;基于线粒体COI基因序列探讨广西钦州湾牡蛎的遗传分化[J];西北农林科技大学学报(自然科学版);2009年03期

7 王新国;梁帆;奚国华;林惠娇;蒋湘;江志海;赵菊鹏;王文祥;;台湾乳白蚁不同种群兵蚁形态学及COI基因序列比较[J];仲恺农业工程学院学报;2012年03期

8 杨晓野;李云章;包巴音仓;王志;关平原;;驯鹿狂蝇(Cephenemyia trompe)线粒体COI基因序列研究[J];中国预防兽医学报;2006年05期

9 李咏梅;陈秀荔;彭敏;蒋伟明;杨春玲;马宁;黎铭;曾地刚;陈晓汉;;广西钦州湾牡蛎线粒体COI基因片段变异分析[J];西南农业学报;2008年06期

10 程汉良;夏德全;吴婷婷;孟学平;吉红九;董志国;陈淑吟;;6种帘蛤科贝类及4个地理种群文蛤线粒体COI基因片段序列分析[J];海洋学报(中文版);2007年05期

中国重要会议论文全文数据库 前3条

1 冯纪年;门秋雷;董昆;;基于COI基因的苹果蠹蛾Cydia pomonella(L.)地理种群遗传差异及扩散路径研究[A];第三届全国生物入侵大会论文摘要集——“全球变化与生物入侵”[C];2010年

2 王倩;杨帆;陆宴辉;杨益众;;五种蚜虫类害虫的COI基因检测技术[A];“创新驱动与现代植保”——中国植物保护学会第十一次全国会员代表大会暨2013年学术年会论文集[C];2013年

3 马凌波;张凤英;乔振国;;线粒体COI基因序列鉴别中国东南沿海青蟹种类组成[A];中国水产学会第五届青年学术年会摘要集[C];2004年

中国硕士学位论文全文数据库 前7条

1 史家浩;扶桑绵粉蚧的适生性及COI基因多态性分析[D];华中农业大学;2015年

2 陈文婧;20种雀形目鸟类COI基因序列扩增及亲缘关系分析[D];内蒙古大学;2012年

3 李洋;基于线粒体COI基因的蝇蛹金小蜂种群遗传多样性分析及Wolbachia感染与其线粒体基因多样性的关联[D];山东农业大学;2014年

4 张伟南;蚁蛉亚科部分种类18S rRNA、16S rRNA和COI基因序列及分子系统学研究[D];河北师范大学;2015年

5 刘静;蓟马中内共生菌Wolbachia的多样性及其对寄主线粒体COI基因的影响[D];山东农业大学;2011年

6 王旭东;郑州地区4种尸食性苍蝇mtDNA中COI基因序列的检测[D];郑州大学;2008年

7 陈志鑫;Hg~（2+）、Pb~（2+）、Cd~（2+）对中华哲水蚤（Calanus sinicus）总超氧化物歧化酶（T-SOD）及线粒体COI基因影响的初步研究[D];中国海洋大学;2010年

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本文编号：925360