广州地区人巨细胞病毒临床低传代病毒株UL142基因的序列特征分析

发布时间：2017-09-27 21:32

  本文关键词：广州地区人巨细胞病毒临床低传代病毒株UL142基因的序列特征分析

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【摘要】：目的探讨广州地区人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代病毒株UL142基因的序列特征。方法选取2014年3月至2015年12月在广州医科大学附属广东省妇儿医院儿科就诊的10例HCMV症状性感染患儿的尿液标本为研究对象。将从HCMV症状性感染患儿尿液标本中分离出的病毒株进行多重PCR鉴定,对UL142基因全序列克隆到pMD18-T载体上扩增并将产物进行测序,将测序结果提交GenBank并与GenBank收录的其他10株HCMV病毒株的UL142基因进行比对分析。结果从广州地区HCMV症状性感染患儿尿液中成功分离2株HCMV临床病毒株,分别命名为HCMV D2和D3;克隆测序后由GenBank收录,收录号分别为DQ180384和DQ180370。各HCMV病毒株的UL142基因同源性比对分析发现:UL142基因序列较保守,有69处碱基发生变异,且均为点突变,无插入及缺失突变;编码蛋白的氨基酸残基为306个,序列也较保守,其中28处点突变导致编码氨基酸的改变,其余点突变均未导致编码氨基酸改变。不同HCMV病毒株中UL142基因所编码的氨基酸变异率为0.9%~6.5%。各HCMV病毒株UL142基因编码蛋白的二级结构的氨基酸数目不同,但所有HCMV病毒株UL142基因编码蛋白的等电点均在6.48~8.27。结论广州地区HCMV临床低传代病毒株ULl42基因序列及其编码产物的氨基酸序列均较为保守,但仍存在一定的多态性,这提示UL142基因在HCMV感染与致病机制的研究中可能具有重要作用。
【作者单位】： 广州医科大学附属广东省妇儿医院儿科;
【关键词】： 巨细胞病毒 临床低传代病毒株 ULl 序列分析
【基金】：广东省自然科学基金项目(9151008901000085);广东省自然科学基金项目(2015A030313726) 广东省医学科研基金项目(A2015133)~~
【分类号】：R725.1
【正文快照】： 作者单位:511442广州医科大学附属广东省妇儿医院儿科人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)为双链DNA病毒,其基因组庞大,由长独特序列(unique long,UL)和短独特序列(uniqueshort,US)2个片段组成。HCMV是引起宫内感染最常见的病毒之一,在先天性HCMV感染的新生儿中,可引起，

本文编号：932019