番茄MADS-box基因Lemads1的可变剪接与表达模式分析

发布时间：2017-09-29 07:31

  本文关键词：番茄MADS-box基因Lemads1的可变剪接与表达模式分析

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【摘要】：可变剪接(alternative splicing)是真核基因转录的普遍现象和重要调控方式,在生物体的各种生理过程中发挥着重要的作用。植物转录因子MADS-box基因在植物生长发育中发挥重要作用。番茄(Solanum lycopersicum L.)SEPALLATA(SEP)亚族基因Lemads1是1个在番茄果实成熟过程中具有关键作用的MADS-box家族成员,但至今尚未见其转录剪接模式的详细报道。本研究发现,Lemads1基因在转录时存在可变剪接现象,并检测到4种Lemads1可变剪接转录本,其扩增长度依次为:699 bp、741 bp、1 404 bp和1 539 bp。剪接方式有外显子选择性切除和内含子保留两种。这4种转录本编码长度为232 aa、246 aa和266 aa的3种蛋白质。氨基酸序列比对和系统进化分析结果表明,这3种蛋白序列的差异主要集中在C区,但并不影响它们的系统进化地位。在进化上,它们仍属于SEP亚家族LOFSEP亚支中的FBP9/23分支,与它们亲缘关系最近的番茄SEP类蛋白是SLMBP21。Lemads1反义RNA转基因植株表型观察结果表明,该基因可能参与番茄果实成熟和萼片发育过程;而组织特异性表达分析表明,该基因的4种转录本具有相似但并不完全相同的表达模式,它们都在萼片和果实中高表达,但在这2个组织发育过程中的表达变化却有明显差异。暗示这些可变剪接转录本在萼片和果实发育过程中扮演了不同的角色。本研究提供了番茄Lemads1基因存在可变剪切的重要信息,对该基因功能的深度发掘具有指导意义。
【作者单位】： 山西大学生命科学学院;
【关键词】： 可变剪接 番茄 MADS-box Lemads
【基金】：国家自然科学基金项目(No.31501772)~~
【分类号】：Q943.2
【正文快照】： 在自然界中,大部分由真核生物DNA转录而来的前体mRNA(pre-mRNAs)都包含外显子(exons)和分布在外显子之间的非编码区域内含子(introns)两部分[1]。前体mRNA的正确编辑对于真核生物体至关重要。但对于很多基因来说,前体mRNA的剪接方式并不是唯一的。同一条前体mRNA可能通过不同，

本文编号：940749