PON1基因多态性与人类长寿、CHD相关性研究

发布时间：2017-09-29 07:47

  本文关键词：PON1基因多态性与人类长寿、CHD相关性研究

  更多相关文章： PON1 TNF-α IL-6 人类长寿 meta分析 PON1 rs854560 单核苷酸多态性 冠心病

【摘要】：目的探讨PON1 rs662.rs854560.TNF-αrs1800629.IL-6 rs1800795位点多态性与人类长寿相关性,为衰老分子机制研究及治疗衰老相关疾病提供遗传学依据。方法通过检索网络数据库里关于PON1.IL-6.TNF-a基因多态性与长寿相关性的病例对照文献数据,统计PON1 rs662.rs854560.IL-6 rs1 800795.TNF-a rs1 800629位点的基因型及基因频率,采用Meta分析软件包Stata/SE软件9.0,计算OR值及95% CI置信区间,分层分析候选基因多态性与长寿的相关性。结果对PON1 rs662加性随机效应模型合并,OR=1.080,95％CI=0.989.1.179, P=0.088；显性随机效应模型合并,OR=1.099,95％CI=0.975.1.240,P=0.124;隐性固定效应模型合并,RR vs.QQ+RQ合并计算后OR=1.102,95％CI=0.947-1.283,P=0.210；在提高长寿标准(≥93)情况下,加性随机效应模型合并,OR=1.025, 95％CI=0.939-1.119, P=0.580;显性随机效应模型合并,OR=1.034,95％ CI=0.904-1.182,P=0.625;隐性固定效应模型合并,OR=1.044,95％CI=0.880-1.239, P=0.622.对PON 1 rs854560加性随机效应模型合并,OR=0.946,95％CI=0.746-1.200,P=0.245；显性随机效应模型合并,OR=0.951,95％CI=0.836-1.08l,P=0.442;隐性固定效应模型合并,OR=0.887,95％CI=0.731-1.077,P=0.225;在提高长寿标准(≥93)情况下,加性随机效应模型合并,OR=1.071,95％CI=0.951-0.845,P=0.408;显性固定效应模型合并OR=0.977,95％CI=0.830-1.151,P=0.783;隐性随机效应模型合并,OR=0.839,95％CI=0.612-1.152,P=0.278。对TNF-a rs1800629加性固定效应模型合并,OR=0.98,95％CI=0.79-1.22,P=0.852；显性固定效应模型合并,O R=0.97,95％CI=0.75.1.24,P=0.791:隐性固定效应模型合并,OR=1.061,95％CI=0.507-2.217,P=0.876；隐性固定效应模型合并,OR=1.061,95％CI=0.507-2.217,P=0.876；在提高长寿标准(≥90)情况下,加性固定效应模型合并,OR=0.920,95％CI=0.699-1.211,P=0.554;显性随机效应模型合并,OR=0.899,95％CI=0.661-1.222,P=0.496;隐性随机效应模型合并,OR=1.069,95％CI=0.297-3.844,P=0.918:性别亚组分层下,男性(≥80),加性固定效应模型合并,OR=0.930,95％CI=0.580-1.480,P=0.792;显性随机效应模型合并,OR=0.928,95％CI=0.578-1.490,P=0.758；隐性随机效应模型合并,OR=1.312,95％CI=0.266-6.482,P=0.739。对IL-6 rs1800795加性随机效应模型合并,OR=1.068,95%CI=0.918-1.243,P=0.396；显性随机效应模型合并,OR=1.089,95％CI=0.929-1.277,P=0.292；隐性随机效应模型合并,OR=1.026.95％CI=0.818-1.288,P=0.824；在提高长寿标准(≥90)情况下,显性随机效应模型合并,OR=1.097,95％CI=0.842-1.427,P=0.494；性别亚组分层下,男性(≥80岁),显性随机效应模型合并,OR=1.083,95％CI =0.803-1.460, P=0.601；分层分析女性组,长寿标准(≥80),显性随机效应模型合并,OR:1.156,95％CI=0.932-1.434,P=0.187；分层分析,长寿标准(≥100),加性随机效应模型合并,OR=1.244,95％CI=0.998-1.550,P=0.052;显性随机效应模型合并,OR=1.276,95％CI=0.941-1.732,P=0.117;隐性随机效应模型合并,OR=1.511, 95％CI=0.864-2.641,P=0.148;分层分析男性组,长寿标准(≥100),显性随机效应模型合并计算后OR=0.70,95％CI=0.35-1.38,P=0.30;性别民族年龄亚亚组中,意大利男性(≥100),OR=2.02,95％CI=1.25-3.26,P=0.004。结论PON 1 rs662.rs854560.TNF-a rs 1800629及IL-6 rs1800795多态性与白种人群长寿相关性并不显著,但IL-6 rs1800795多态性与意大利民族男性长寿显著相关(P=0.004).这一研究结果可能受基因与基因以及环境的交互影响,其他因素包括性别、地理梯度、地理位置、地中海饮食习惯、运动锻炼也能调控人类达到极限寿命,阐释PON 1 rs662.rs854560.TNF-a rs 1800629及IL-6 rs 1800795多态性与长寿的关系需要更多研究数据去进一步论证。目的探讨云南地区人群PON1基因rs854560位点多态性与冠心病(CHD)相关性,为冠心病的早期诊断及治疗提供遗传学依据。方法分别收集云南地区CHD病人及健康人血样131例和305例。提取DNA,采用基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱分析技术进行分型检测,运用SPSS 20.0软件包分析PON1基因rs854560位点多态性与CHD发病风险的相关性,并进一步针对吸烟人群和糖尿病人群进行分层分析。结果1.首先采用Logistic回归分析PON1 rs854560基因多态性与冠心病发病风险的相关性。研究表明,PON1 rs854560 位点 LM vs.LL, OR=1.049, 95% CI=0.477-2.295, P=0.881:MM vs. LL, OR=0.815, 95% CI=0.071-27.16, P=0.816; MM+LM vs.LL, OR=1.013, 95% CI=0.468-2.204, P=0.978。1.1以吸烟对人群分层分析。吸烟组中,LM vs.LL, OR=0.821,95% CI=0.260-2.625, P=0.718: MM vs.LL,数据无效,无法比较(0病例)；MM+LM vs. LL, OR=0.821, 95% CI=0.260-2.625, P=0.718。不吸烟组中,LM vs.LLOR=1.253, 95% CI=0.433-3.627, P=0.679; MM vs.LL,OR=1.202, 95% CI=0.067-29.517, P=0.967; MM+LM vs.LL, OR=1.170, 95% CI=0.418-3.366, P=0.778。1.2以糖尿病对人群分层分析。糖尿病组中,LM vs.LL,OR=2.566,95%CI=0.855-8.560, P=0.171；MM vs.LL,OR=4.693, 95% CI=0.161-116.397, P=0.385; MM+LM vs.LL, OR=2.454, 95% CI=0.773-7.880, P=0.178。非糖尿病组中,LM vs. LL,OR=0.765, 95% CI=0.310-1.942, P=0.577:MM vs.LL, OR=0.855,95% CI=0.054-21.067, P=0.912; MM+LM vs.LL, OR=0.748, 95% CI=0.278-1.840,P=0.509。进一步针对有糖尿病的冠心病组与无糖尿病的冠心病组比较,LM vs.LL OR=3.263, 95% CI=0.830-13.424, P=0.089:MM vs.LL,数据无效,无法比较(0病例)；MM+LM vs.LL, OR=3.263, 95% CI=0.830-13.424, P=0.089。1.3以吸烟和糖尿病对人群同时分层分析。在不吸烟人群中,有糖尿病冠心病组与无糖尿病冠心病组比较,LM vs.LL,OR=2.533,95％CI=O.378-16.708,P=0.354； MM vs.LL,数据无效,无法比较(0病例)；MM+LM vs.LL,OR=2.533,95％ CI=0.378-16.708,P=0.354。有糖尿病有冠心病组与无糖尿病无冠心病组比较,LM vs. LL,OR=2.381,95％CI=0.491一11.699,P=0.296:MM vs.LL,OR=5.547,95％ CI=0.257-138.059,P=0.332:MM+LM vs.LL,OR=2.224,95％CI=0.455-10.856,P=0.777。无糖尿病有冠心病组中,无糖尿病无冠心病组比较,LM vs.LL,OR=0.952, 95％CI=0.363-3.454,P=0.945:MM vs.LL,OR=1.449,95％CI=0.159-36.644, P=0.825:MM+LM vs.LL,OR=0.889,95％CI=0.257-3.200,P=0.817。在吸烟人群中,有糖尿病冠心病组与无糖尿病有冠心病组比较,LM vs.LL, OR=4.669,95％CI=O.673-32.360,P=0.169；MM vs.LL,数据无效,无法比较(0病例)；MM+LM vs.LL,OR=4.669,95％CI=0.673-32.360,P=0.169。有糖尿病冠心病组与无糖尿病无冠心病组比较,LM vs.LL,OR=2.564,95％CI=0.461-14.184, P=0.280；MM vs.LL,数据无效,无法比较(0病例)；MM+LM vs.LL, OR=2.564, 95％CI=0.461-14.184,P=0.280。无糖尿病冠心病组与无糖尿病无冠心病组比较,LMvs.LL,OR=0.549,95％CI=0.144-2.161,P=0.393；MM vs.LL,数据无效,无法比较(0病例)；MM+LM vs.LL,OR=0.549,95％CI=0.144-2.161,P=0.393。2.其次采用基因直接计数法和卡方分布检验比较分析冠心病组与对照组的基因型和基因频率,结果显示基因型：X2=0.452,P=0.798；等位基因：X2=0.007, OR=0.969,95％CI=0.457-2.065,P=0.934。2.1以吸烟对人群分层。在吸烟亚组中,冠心病组与对照组相比较,基因型：X2=0.904,P=0.636；等位基因：X2=0.134,OR=0.808,95％CI=0.258-2.527,P=0.714。在不吸烟亚组中,冠心病组与对照组相比较,基因型：X2=0.464,P=0.793；等位基因：X2=0.026,OR=1.087,95％CI=0.390.3.029,P=0.873。2.2以糖尿病对人群分层。有糖尿病的冠心病组与无糖尿病的冠心病组相比较,基因型：X2=3.400,P=0.065;等位基因：X2=3.265,OR=3.152,95％CI=0.854-11.637,P=0.071；有糖尿病的冠心病组与无糖尿病无冠心病组相比较,基因型：X2=2.797,P=0.247；等位基因：X2=2.113,OR=2.220,95％CI=0.737-6.681,P=0.146；无糖尿病的冠心病组与无糖尿病无冠心病组相比较,基因型：X2=0.683,P=0.711;等位基因：X2=0.577,OR=0.704,95％CI=0.284-1.747,P=0.447。2.3以吸烟和糖尿病对人群同时分层。在不吸烟人群中,有糖尿病的冠心病组与无糖尿病的冠心病组相比较,基因型：X2=0.944,P=0.331;等位基因：X2=0.904,OR=2.385,95％CI=0.378-15.034,P=0.342；有糖尿病的冠心病组与无糖尿病无冠心病组相比较,基因型：X2=1.278,P=0.528；等位基因：X2=0.815,OR=1.99,95％CI=0.434-9.123,P=0.367；无糖尿病的冠心病组与无糖尿病无冠心病组相比较,基因型：X2=0.23,P=0.892；等位基因：X2=0.08,OR=0.835,95％CI=0.238.2.923,P=0.777。2.4在吸烟人群中,有糖尿病的冠心病组与无糖尿病的冠心病组相比较,基因型：X2=2.83,P=0.093；等位基因：X2=2.747,OR=4.259,95％CI=0.665-27.275,P=0.099；有糖尿病的冠心病组与无糖尿病无冠心病组相比较,基因型：X2=1.235,P=0.267；等位基因：X2=1.170,0R=2.389,95％CI=0.471-12.117,P=0.279；无糖尿病的冠心病组与无糖尿病无冠心病组相比较,基因型：X2=0.754,P=0.385:等位基因：X2=0.725,OR=0.561,95％CI=0.146-2.159,P=0.394.结论PON 1 rs854560多态性与云南地区人群冠心病的发病风险相关性不显著,但该位点携带M有提高同时患冠心病和糖尿病的发病风险趋势(P=0.089)。结果可能受其他未知复杂因素和研究样本量影响,包括遗传、环境、地理、温度、饮食、高血压史、糖尿病史、代谢异常、饮水、职业等诸多复杂因素,需要更多研究数据阐释PON1rs854560与心血管疾病发病风险的关系。
【关键词】：PON1 TNF-α IL-6 人类长寿 meta分析 PON1 rs854560 单核苷酸多态性 冠心病
【学位授予单位】：昆明理工大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R339.36;R394
【目录】：

• 摘要 16-8
• AbstractⅠ8-10
• 摘要 210-13
• Abstract Ⅱ13-22
• 缩略表 122-24
• 缩略表 224-26
• 第一部分 PON1、TNF-α、IL-6基因多态性与人类长寿相关性研究26-82
• 第一章 绪论26-34
• 1.1 长寿与衰老26-28
• 1.2 与长寿密切相关的热门基因28-32
• 1.3 荟萃分析PON1、TNF-α、IL-6与长寿相关性的意义32-34
• 第二章 实验材料与方法34-36
• 2.1 文献的检索34
• 2.2 研究文献收集和排除的标准34-35
• 2.3 整理数据进行统计分析35-36
• 第三章 实验结果36-74
• 3.1 研究文献的纳入结果36-38
• 3.2 PON1基因rs662多态性与长寿相关性的Meta分析结果38-45
• 3.2.1 异质性的检验38-40
• 3.2.2 文献发表偏倚的评估40-41
• 3.2.3 选取样本含量的敏感性分析41
• 3.2.4 数据合并计算41-45
• 3.3 PON1基因rs854560多态性与长寿相关性的Meta分析结果45-53
• 3.3.1 异质性的检验45-47
• 3.3.2 文献发表偏倚的评估47-48
• 3.3.3 选取样本含量的敏感性分析48
• 3.3.4 数据合并计算48-53
• 3.4 TNF-α基因rs1800629多态性与长寿相关性的Meta分析结果53-62
• 3.4.1 异质性的检验53-55
• 3.4.2 文献发表偏倚的评估55-56
• 3.4.3 选取样本含量的敏感性分析56
• 3.4.4 数据合并计算56-62
• 3.5 IL-6基因rs1800795多态性与长寿相关性的Meta分析结果62-74
• 3.5.1 异质性的检验62-65
• 3.5.2 文献发表偏倚的评估65-66
• 3.5.3 选取样本含量的敏感性分析66
• 3.5.4 数据合并计算66-74
• 第四章 讨论74-80
• 第五章 结论与展望80-82
• 5.1 结论80
• 5.2 展望80-82
• 第二部分 PON1基因rs854560多态性与云南地区人群CHD相关性研究82-116
• 第一章 绪论82-88
• 1.1 长寿与冠心病82-83
• 1.2 与CHD密切相关的热门基因PON183-86
• 1.3 探究PON1与CHD相关性的意义86-88
• 第二章 实验材料与方法88-98
• 2.1 实验的材料88-91
• 2.1.1 主要的试剂与药品88-89
• 2.1.2 主要的仪器与设备89
• 2.1.3 实验溶液的配制89-91
• 2.2 方法91-98
• 2.2.1 血样的收集和样本信息的采集91
• 2.2.2 样本外周血的基因组DNA抽提(酚-氯仿提取法)91-92
• 2.2.3 基因分型92-96
• 2.2.4 统计分析96-98
• 第三章 实验结果分析98-110
• 3.1 样本的TOF检测原始结果98-99
• 3.2 制作数据表格99-101
• 3.3 研究对象选入的一般信息101
• 3.4 冠心病组和健康组信息的对比101-102
• 3.5 样本等位基因和基因型频率的分析结果102-110
• 3.5.1 PON1基因的rs854560(L55M)位点102
• 3.5.2 PON1基因rs854560多态性与冠心病相关性102-103
• 3.5.3 对吸烟和糖尿病分层分析103-110
• 第四章 讨论110-114
• 第五章 结论与展望114-116
• 5.1 结论114
• 5.2 展望114-116
• 致谢116-118
• 参考文献118-130
• 附录A 攻读学位期间公开发表学术论文情况130

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本文编号：940830