甜玉米胚乳突变基因shrunken2的序列变异解析

发布时间：2017-09-30 07:02

  本文关键词：甜玉米胚乳突变基因shrunken2的序列变异解析

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【摘要】：Shrunken2基因编码葡萄糖焦磷酸化酶的大亚基,是玉米淀粉合成途径中的限速酶,shrunken2是Shrunken2的隐性突变等位基因,对甜玉米品质和风味的形成起着重要的作用。本研究以玉米B73的Shrunken2基因为参考序列,在58份甜玉米自交系中进行shrunken2基因的重测序,共获得了7 635 bp的核苷酸序列,涵盖了20个外显子,17个内含子以及3'UTR区域。基因多态性分析发现,在供试群体中共有多态性位点105个,包括78个SNP和27个Indel。与普通玉米B73的Shrunken2序列之间存在58个多态性位点差异,包括50个SNP和8个Indel,其中位于编码区的SNP位点包含2个同义突变和7个非同义突变。根据shrunken2基因全长序列和编码区序列可将该群体分成14种和4种单倍型。中性检测表明该基因经历了自然和人工双重选择过程。
【作者单位】： 中山大学生命科学学院;广东省农业科学院作物研究所;广东省作物遗传育种重点实验室;
【关键词】： 甜玉米 Shrunken 序列多态性 中性检测 单倍型
【基金】：广东省科学技术厅广东省农作物遗传改良重点实验室建设项目(粤科财字(2013)82号) 广东省农业科技研究团队项目(2011A020102010) 广东省科技计划项目(2009B080701103;2011A030100002;2014A020208061;2016A020208006)共同资助
【分类号】：S513
【正文快照】： *同等贡献作者**通讯作者,yl.lee@126.comAnalysis of Sequence Polymorphism of shrunken2 in Sweet CornSuo Haicui1,2,3*Zheng Jinrong2,3*Zhang Xiaolan2,3Li Zhijun2,3Li Wu2,3Hu Jianguang2,3Han Fuguang2,3Wang Kehan2,3Wang Li2,3Li Yuliang2,3**1 School of Life Sci

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本文编号：946758