春性甘蓝型油菜FCA同源基因可变剪接体的克隆及表达研究

发布时间：2017-09-30 08:25

  本文关键词：春性甘蓝型油菜FCA同源基因可变剪接体的克隆及表达研究

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【摘要】：【目的】克隆特早熟春性甘蓝型油菜的FCA同源基因(sBnFCA)及其可变剪接体,并分析该基因的表达模式。【方法】根据拟南芥和芸薹属植物FCA基因的DNA序列和cDNA序列设计引物,用PCR和RT-PCR技术克隆特早熟春性甘蓝型油菜"86号"的FCA同源基因(sBnFCA)及其可变剪接体,对克隆基因及编码蛋白序列进行生物信息学分析,构建系统进化树,并用qRT-PCR技术检测sBnFCA基因在不同发育时期根、茎、叶、茎尖中的表达量。【结果】克隆出了sBnFCA基因的全长序列(8 827bp),得到了sBnFCA-γ可变剪接体及一个新的可变剪接体(sBnFCA-5),新的可变剪接体在GenBank中的登录号为KJ701579.1。sBnFCA-5剪接体的CDS全长1 986bp,编码662个氨基酸残基,其推导的氨基酸序列具有2个保守的RRM结构域和1个WW结构域。生物信息学分析显示,sBnFCA-5与已报道甘蓝型油菜BnFCA-γ(AF414188.1)的相似性达99%,与拟南芥FCA-γ的相似性达87%。sBnFCA-5比sBnFCA-γ少了172个碱基序列,是一个跨外显子剪接体。sBnFCA蛋白相对分子质量和理论等电点分别为72.5ku和9.2。基因表达模式分析显示,sBnFCA-γ和sBnFCA-5在苗期、蕾期、花期的根、茎、叶和茎尖组织中都有表达,sBnFCA-γ在蕾期茎尖和花期叶片中表达量较高,sBnFCA-5在蕾期茎尖和花期叶片中表达量极高。【结论】克隆的sBnFCA-5为甘蓝型油菜sBnFCA基因的一个新的可变剪接体,该基因在春性特早熟甘蓝型油菜开花调控中可能有着重要的调节作用。
【作者单位】： 青海大学生态环境工程学院;青海大学农林科学院;
【关键词】： 春性甘蓝型油菜 基因克隆 FCA同源基因 可变剪接 自主开花途径
【基金】：国家自然科学基金项目(31360345) 青海省科技厅项目(2013-Z-716) 国家863项目(2011AA10A104) 高层次人才项目(2012-QGC-3) 科技部项目(2013BAD01B05-3)
【分类号】：S565.4
【正文快照】： 开花时间是决定油菜成熟期早晚的一个重要指标,适时开花能保证花朵在适宜的条件下授粉和种子的正常成熟,避免生育后期高温逼熟或干热等自然灾害的影响,是油菜高产和优质的重要条件[1]。影响油菜成花的环境因素很多,其中最关键的因子是温度和光照,而影响春性甘蓝型油菜成花的环，

本文编号：947151