基因功能富集分析的研究进展
本文关键词:基因功能富集分析的研究进展
【摘要】:基因功能的富集分析已成为高通量组学数据分析的常规手段,对于揭示生物医学分子机制具有重要意义.目前已有上百种基因功能富集分析的方法和工具.根据所解决的问题和算法的原理,这些方法可大体分为过代表分析、功能集打分、基于通路拓扑结构和基于网络拓扑结构4大类.本文对这4大类方法的原理及其中的典型方法进行了综述,并讨论了基因功能富集分析结果的冗余性问题及建立标准数据集的必要性.
【作者单位】: 复旦大学生命科学学院生物统计学与计算生物学系;复旦大学附属儿科医院;
【关键词】: 组学数据 功能富集 冗余性 标准数据集
【基金】:国家自然科学基金(批准号:91231116,31071113,30971643) 国家重点基础研究发展计划(批准号:2012CB316505,2010CB529505)资助
【分类号】:Q811.4
【正文快照】: 随着高通量测序技术的飞速发展及相关技术的广泛应用,生物医学相关研究领域已进入了大规模组学数据呈指数增长的后基因组时代[1].一方面,这使得生物医学研究得以从单个基因的分析转变为系统水平上的研究,对于揭示生物医学的基本分子机制具有重要推动作用.但另一方面,如此庞大
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,本文编号:960726
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