云南地方稻种抗稻瘟病基因Pi-d3序列变异分析

发布时间：2017-10-04 19:06

  本文关键词：云南地方稻种抗稻瘟病基因Pi-d3序列变异分析

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【摘要】：对来自云南的80份地方稻种抗稻瘟病基因Pi-d3编码区序列进行了PCR扩增并测序分析。结果表明,与地谷相比,80份云南地方稻种的Pi-d3编码区序列(全长2775bp)存在39个变异位点,平均变异率为1.41%。所有材料可以归为37种单倍型,频率较高的单倍型是H8(28.8%)、H4(11.3%)、H23(5.0%),其他单倍型频率较低,显示了云南地方稻种Pid3基因变异丰富,单倍型类型多,但频率较低。37种单倍型中存在28个氨基酸差异位点,共编码33种蛋白,其中18种单倍型共计32份材料(包括12份籼稻品种)出现了假基因,假基因化的频率较高,可能是粳稻Pi-d3假基因化向籼稻渗透。除已发现的737位氨基酸假基因位点外,新发现32和467两个假基因位点。Pi-d3基因在籼稻、粳稻亚种,水稻、陆稻,黏稻、糯稻的单倍型类型及频率两方面均存在差异,表明亚种间或生态型间发生了一定的遗传分化。37种单倍型在云南的地理分布呈大分散、小聚居的特点,普洱、版纳、临沧的单倍型种类最丰富,并以之为中心向外扩展,单倍型种类随之减少。
【作者单位】： 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室;
【关键词】： 云南地方稻种 稻瘟病 Pi-d基因 单核苷酸多态性
【基金】：国家自然科学基金资助项目(31360331) 科技部基础性工作专项(2012FY110200) 云南省自然科学基金资助项目(2013FZ146)
【分类号】：S435.111.41
【正文快照】： 水稻是世界上重要的粮食作物,稻瘟病是由稻瘟病菌(Magnaporthe　oryzae;无性态:Pyriculariaoryzae)引起的水稻真菌病害[1],在世界各水稻种植区均有发生,可引起水稻大幅减产,甚至绝收,严重 阻碍了水稻生产的可持续发展。稻瘟病抗性可分为垂直抗性和水平抗性两种类型,垂直抗性

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本文编号：972317