2种类型的烟草扭脉病毒外壳蛋白基因的序列和结构分析

发布时间：2017-10-05 09:04

  本文关键词：2种类型的烟草扭脉病毒外壳蛋白基因的序列和结构分析

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【摘要】：烟草丛顶病主要由烟草丛顶病毒(Tobacco bushy top virus,TBTV)和烟草扭脉病毒(Tobacco vein distorting virus,TVDV)复合侵染引起。其中,TVDV的CP蛋白可分别包装TBTV和TVDV形成病毒粒子;但也存在TVDV单独侵染不携带TBTV的病样。本文利用RT-PCR对自然状态下携带TBTV的TVDV(采自云南弥渡)和不携带TBTV的TVDV(采自云南保山)的cp基因进行序列克隆,发现TVDV弥渡分离物的cp基因为618个核苷酸,而TVDV保山分离物的cp基因为621个核苷酸,二者的核苷酸序列一致性为90.02%,氨基酸序列一致性为89.81%;而长度相同的TVDV cp基因序列一致性为98.5%~100%。表明这2个cp基因属于2种不同类型。系统发育树分析也表明这2个cp基因属于进化距离较远的2个群。利用SWISS-MODEL进行同源建模,发现2种类型的TVDV CP蛋白的主要空间结构域基本一致,存在细小的结构域及结构域之间无规则卷曲角度的差异,整体空间结构没有发生明显改变。推断TVDV保山分离物CP蛋白中关键氨基酸的序列突变是导致CP无法包装TBTV,从而在病害传播过程中丢失TBTV的主要因素。
【作者单位】： 山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室;山东农业大学动物科技学院;云南农业大学农业生物多样性控制病虫害教育部重点实验室;
【关键词】： 烟草扭脉病毒 烟草丛顶病毒 外壳蛋白 同源建模
【基金】：国家自然科学基金资助项目(31370179) 山东省自然科学基金资助项目(ZR2013CM015)
【分类号】：S432.41
【正文快照】： 烟草丛顶病1993年在我国云南保山地区首次大面积爆发流行。1996年和1998年该病在云南省三江流域再度大规模流行,对部分烟区造成毁灭性损失。截至2001年,累计发病51 300 hm2,约17%田块绝收[1]。近年来通过对该病主要传播介体—蚜虫的综合防治,其发生程度大大减轻[2]。典型的烟

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1 李凡,钱宁刚,张雪峰,吴建宇,孔宝华,周雪平,陈海如;烟草扭脉病毒复制酶基因克隆及序列分析[J];云南农业大学学报;2003年02期

2 李凡,钱宁刚,杨根华,吴建宇,周雪平,陈海如;烟草扭脉病毒外壳蛋白基因克隆及序列分析[J];云南农业大学学报;2002年04期

3 ;[J];;年期

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本文编号：975908