粉蚧科昆虫DNA条形码鉴定技术及数据库的建立

发布时间：2017-03-30 13:15

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【摘要】：粉蚧是一种体型微小的吸汁害虫,隶属蚧总科粉蚧科。因其适应性及繁殖能力非常强,易对农林区爆发成灾,是我国高度警惕的有害生物。粉蚧隐蔽性强,给我国入境检疫带来极大困难,快速准确鉴定是粉蚧监测与有效防控的基础,而目前粉蚧的传统形态鉴定方法存在诸多弊端,所以寻找更加高效便捷的鉴定方法尤为紧迫。DNA条形码技术是利用标准基因片段的序列差异对物种进行鉴定的方法。本研究基于线粒体COI基因利用DNA条形码技术,对538头粉蚧样本(含23属52种)进行序列扩增,共获得502条COI基因5’端和356条COI基因3’端序列。粉蚧COI基因5’端和3’端序列长度分别为649bp和820bp,碱基组成AT含量明显高于GC含量。粉蚧科COI基因5’端种内遗传距离介于0.00%~8.03%,种间遗传距离介于1.60%~22.89%;粉蚧科COI基因3’端种内遗传距离介于0.00%~9.50%,种间遗传距离介于1.99%~24.39%。种内与种间遗传距离出现重叠现象。双条拂粉蚧和美地绵粉蚧两种粉蚧的不同地理种群分别出现明显的遗传分化,已达种的分化水平。采用邻接法构建系统发育树表明,除了双条拂粉蚧和美地绵粉蚧,其余种均可形成单系,并聚为独立分支。分别对粉蚧属、绵粉蚧属、臀纹粉蚧属和灰粉蚧属的COI基因构建系统发育树,结果显示COI基因能很好地区分粉蚧科主要属的种类,同种粉蚧聚成一支,与形态鉴定结果基本一致,对于近缘种同样具有很好的鉴定效果。本研究证明线粒体COI基因可作为DNA条形码对粉蚧科昆虫进行有效的物种鉴定,并且对粉蚧科昆虫隐存种的发现有重要意义。对粉蚧进行系统分类并构建DNA条形码数据库,为检测预警和检疫处理提供科学依据,对丰富粉蚧类群的分类研究提供重要参考。
【关键词】：粉蚧科 线粒体COI基因 分子鉴定
【学位授予单位】：华南农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S433.3
【目录】：

• 摘要3-4
• Abstract4-8
• 1 前言8-14
• 1.1 粉蚧概述8-9
• 1.1.1 粉蚧生物学特性8
• 1.1.2 粉蚧的危害8-9
• 1.2 粉蚧的分类鉴定9-10
• 1.3 DNA条形码概述10-12
• 1.3.1 DNA条形码的提出10-11
• 1.3.2 DNA条形码数据库11-12
• 1.3.3 DNA条形码在介壳虫中的应用12
• 1.4 研究目的及意义12-13
• 1.5 研究技术路线13-14
• 2 材料与方法14-19
• 2.1 实验材料14
• 2.2 主要仪器设备14
• 2.3 主要试剂14-15
• 2.4 研究方法15-19
• 2.4.1 总DNA提取15-16
• 2.4.2 目的片段扩增16-17
• 2.4.3 序列处理及分析17-18
• 2.4.4 数据库的构建18-19
• 3 结果与分析19-52
• 3.1 粉蚧科COI基因序列特征分析19-23
• 3.1.1 序列特征21-22
• 3.1.2 碱基组成22
• 3.1.3 碱基替换22-23
• 3.2 遗传距离分析23-29
• 3.3 系统发育树构建29-49
• 3.3.1 粉蚧科系统发育树29-37
• 3.3.2 粉蚧属系统发育树37-40
• 3.3.3 绵粉蚧属系统发育树40-43
• 3.3.4 臀纹粉蚧属系统发育树43-46
• 3.3.5 灰粉蚧属系统发育树46-49
• 3.4 粉蚧DNA条形码数据库的构建49-52
• 3.4.1 粉蚧DNA条形码数据库构建情况49-50
• 3.4.2 粉蚧DNA条形码数据库的功能50-52
• 4 结论与讨论52-56
• 4.1 结论52-53
• 4.2 讨论53-55
• 4.3 展望55-56
• 致谢56-57
• 参考文献57-63
• 附录63-75

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 黄标;邓业余;郑立权;黎志文;吴军亮;赵家流;文尚华;;新菠萝灰粉蚧生物学特性与发生规律的研究[J];安徽农业科学;2015年29期

2 魏亦寒;郑斯竹;蔡平;詹国辉;高渊;;分子生物学技术在蚧虫分类鉴定中的应用[J];环境昆虫学报;2015年04期

3 杨耀华;;DNA条形码技术的应用进展[J];中国医药指南;2013年17期

4 徐浪;余道坚;焦懿;向才玉;陈志|

本文编号：277225