近交作物限制性二阶段全基因组关联分析方法及其应用和软件开发

发布时间：2021-09-29 13:01

　　全基因组关联分析（genome-wide association studies,GWAS）方法最初被提出于人类遗传研究,它利用自然群体的连锁不平衡（linkagedisequilibrium,LD）,通过全基因组标记与表型间的相关性测验来推断和解析复杂疾病的遗传基础,目前已成为动植物数量性状遗传基础解析的重要方法,在遗传育种研究中发挥了重要作用。但对于近交（inbreeding）作物,由于较高的自交率,近交作物自然群体通常具有广泛的LD程度,全基因组上的LD衰减距离通常远大于异交群体,从而导致GWAS中距离目标遗传位点较远的标记也可能被检测为显著关联,因此进一步将这种远距离显著关联的标记应用于遗传育种时,将可能导致选择失效甚至出现偏差。另外,近交作物常规育种需要利用目标性状全基因组遗传信息进行亲本和后代的分子标记辅助选择（marker-assisted selection,MAS）,虽然 基于种质资源 群体的 GWAS 为育种性状遗传基础解析提供了方法,但是目前GWAS主要用于主效基因的发掘,为了尽可能避免假阳性以及提高试验的可重复性,通常采用非常严格的显著水平和群体结构控制方法,这... 

【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：122 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图１－３全基因组选择过程示意图??Ｆｉｇｕｒｅ?１－３?Ｄｉａｇｒａｍ?ｏｆ?ｇｅｎｏｍｉｃ?ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ?ｐｒｏｃｅｓｓｅｓ??

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本文编号：3413750