基于DNA甲基转移酶的巴氏新小绥螨温度耐受性研究
发布时间：2021-10-22 23:24
21世纪以来,生物防治在农业系统发挥着越来重要的作用,巴氏新小绥螨Neoseiulus barkeri因其发育历期短,捕食种类多,种群繁殖力强和扩散能力强等优点,成为一类极具应用前景、可用来防治害螨和小型农业吸汁性害虫的重要生防因子。随着全球气候的变暖,螨类作为一种变温动物,对温度极其敏感,因此高温也成为制约捕食螨在农业生态系统中持续控制害螨、发挥其生物防治效能的非生物因素。为了提升巴氏新小绥螨N.barkeri在田间的生物效能,本课题组通过高温锻炼驯化筛选出明显具有温度可塑性和适应性的巴氏新小绥螨N.barkeri耐高温品系,已有的研究表明其对高温胁迫的承受能力显著增强。本研究着眼于巴氏新小绥螨N.barkeri生态适应性机制,从表观遗传学的角度研究高温胁迫处理下,两种温度品系雌成螨及各世代之间的DNA甲基化水平差异;在此基础上筛选克隆了Nb Dnmt1基因,并对其m RNA表达模式进行分析,最后采用RNAi技术对该基因的温度耐受性功能进行了验证。本研究所获得的主要研究结果如下:1.42°C高温胁迫处理巴氏新小绥螨N.barkeri两种温度品系雌成螨,测定其全基因组甲基化水平。结果显...
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
自然界中DNA甲基化类型[16]
（A）高温胁迫巴氏新小绥螨雌成螨的全基因组甲基化水平分析；（B）高温胁迫不同世代巴氏新小绥螨雌成螨的全基因组甲基化水平分析
西南大学硕士学位论文26品系之间的表达量差异性比较分析采用独立样本t检验（Student’st-test）表示数据。所有柱形图均使用OriginPro9.0制作完成。2结果与分析2.1巴氏新小绥螨Dnmt1基因克隆及生物信息学分析基于巴氏新小绥螨N.barkeri转录组数据库，通过RT–PCR技术成功克隆获得1条DNA甲基转移酶基因cDNA全长，将其命名为NbDnmt1，登录号为MK077804。NbDnmt1开放阅读框（ORF）全长1377bp，编码458个氨基酸，NbDnmt1的相对分子量大小为60.71kDa，等电点为9.42，亲水性平均系数（Grandaverageofhydropathicity，GRAVY）值为-0.861，为亲水性蛋白。将NbDnmt1基因的氨基酸序列提交到NCBI库分析比对发现其与西方静走螨（Galendromusoccidentalis）的Dnmt1序列一致性高达95%。将其序列与西方静走螨（Goccidentalis）；小蜂螨（Tropilaelapsmercedesae）；瓦螨（Varroadestructor）的Dnmt1序列通过DNAMAN软件比对，序列相似度均高达90%以上，这表明蜱螨目螨类的Dnmt1具有高度的一致性（图3.1）。图3.1巴氏新小绥螨与其他物种Dnmt1多重序列比对（保守区域用蓝色方框标出）Figure3.1MultiplealignmentofthededucedaminoacidsequenceoftheNbDnmt1withotherspecies.（Thewell–conservedregionswereunderlinedwithbluebox）2.2巴氏新小绥螨Dnmt1基因同源性分析将NCBI数据库搜索昆虫纲其他物种Dnmt1的氨基酸序列，与本研究所得的巴氏新小绥螨N.barkeriDnmt1推导氨基酸序列采用MEGA6.0软件NJ(Neighbor-
【参考文献】：
期刊论文
[1]动物温度依赖型性别决定中的表观遗传学机制[J]. 滑留帅,茹文秀,白献晓,龚世平. 河南畜牧兽医(综合版). 2016 (09)
[2]捕食螨繁育与应用[J]. 徐学农,吕佳乐,王恩东. 中国生物防治学报. 2015(05)
[3]高温对二化螟实验种群生长、存活和繁殖的影响[J]. 罗举,张孝羲,翟保平,郭玉人,朱建华. 生态学报. 2005(04)
[4]变温变湿对智利小植绥螨发育和存活的影响[J]. 郭玉杰,董慧芳. 生物防治通报. 1987(01)
博士论文
[1]巴氏新小绥螨高温品系筛选及其适应性机制研究[D]. 张国豪.西南大学 2017
硕士论文
[1]温度诱导烟粉虱DNA甲基化的特征和Dnmt1基因温度耐受性功能的鉴定[D]. 戴恬美.中国农业科学院 2015
[2]褐飞虱Dnmt3及翅发育相关基因的表达和功能分析[D]. 李瑶.南京农业大学 2015
[3]柑橘全爪螨几丁质合成与代谢途径重要基因的研究[D]. 夏文凯.西南大学 2015
[4]拟南芥温度胁迫和红光响应基因XCT表观遗传机理探究[D]. 王玉晗.山东农业大学 2014
本文编号：3452022
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
自然界中DNA甲基化类型[16]
（A）高温胁迫巴氏新小绥螨雌成螨的全基因组甲基化水平分析；（B）高温胁迫不同世代巴氏新小绥螨雌成螨的全基因组甲基化水平分析
西南大学硕士学位论文26品系之间的表达量差异性比较分析采用独立样本t检验（Student’st-test）表示数据。所有柱形图均使用OriginPro9.0制作完成。2结果与分析2.1巴氏新小绥螨Dnmt1基因克隆及生物信息学分析基于巴氏新小绥螨N.barkeri转录组数据库，通过RT–PCR技术成功克隆获得1条DNA甲基转移酶基因cDNA全长，将其命名为NbDnmt1，登录号为MK077804。NbDnmt1开放阅读框（ORF）全长1377bp，编码458个氨基酸，NbDnmt1的相对分子量大小为60.71kDa，等电点为9.42，亲水性平均系数（Grandaverageofhydropathicity，GRAVY）值为-0.861，为亲水性蛋白。将NbDnmt1基因的氨基酸序列提交到NCBI库分析比对发现其与西方静走螨（Galendromusoccidentalis）的Dnmt1序列一致性高达95%。将其序列与西方静走螨（Goccidentalis）；小蜂螨（Tropilaelapsmercedesae）；瓦螨（Varroadestructor）的Dnmt1序列通过DNAMAN软件比对，序列相似度均高达90%以上，这表明蜱螨目螨类的Dnmt1具有高度的一致性（图3.1）。图3.1巴氏新小绥螨与其他物种Dnmt1多重序列比对（保守区域用蓝色方框标出）Figure3.1MultiplealignmentofthededucedaminoacidsequenceoftheNbDnmt1withotherspecies.（Thewell–conservedregionswereunderlinedwithbluebox）2.2巴氏新小绥螨Dnmt1基因同源性分析将NCBI数据库搜索昆虫纲其他物种Dnmt1的氨基酸序列，与本研究所得的巴氏新小绥螨N.barkeriDnmt1推导氨基酸序列采用MEGA6.0软件NJ(Neighbor-
【参考文献】：
期刊论文
[1]动物温度依赖型性别决定中的表观遗传学机制[J]. 滑留帅,茹文秀,白献晓,龚世平. 河南畜牧兽医(综合版). 2016 (09)
[2]捕食螨繁育与应用[J]. 徐学农,吕佳乐,王恩东. 中国生物防治学报. 2015(05)
[3]高温对二化螟实验种群生长、存活和繁殖的影响[J]. 罗举,张孝羲,翟保平,郭玉人,朱建华. 生态学报. 2005(04)
[4]变温变湿对智利小植绥螨发育和存活的影响[J]. 郭玉杰,董慧芳. 生物防治通报. 1987(01)
博士论文
[1]巴氏新小绥螨高温品系筛选及其适应性机制研究[D]. 张国豪.西南大学 2017
硕士论文
[1]温度诱导烟粉虱DNA甲基化的特征和Dnmt1基因温度耐受性功能的鉴定[D]. 戴恬美.中国农业科学院 2015
[2]褐飞虱Dnmt3及翅发育相关基因的表达和功能分析[D]. 李瑶.南京农业大学 2015
[3]柑橘全爪螨几丁质合成与代谢途径重要基因的研究[D]. 夏文凯.西南大学 2015
[4]拟南芥温度胁迫和红光响应基因XCT表观遗传机理探究[D]. 王玉晗.山东农业大学 2014
本文编号：3452022
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/nykj/3452022.html
