毛乳头细胞凝聚性生长差异表达基因的筛选及HSPC016全长克隆的生物信息学分析

发布时间：2021-02-03 07:56

　　目的　筛选与毛乳头细胞 （DPC）凝聚性生长相关的基因表达 ,全长克隆凝聚性生长相关基因HSPC0 16并进行生物信息学分析。方法　应用抑制性消减杂交技术 ,构建DPC凝聚性生长与非凝聚性生长的cDNA消减文库 ,克隆鉴定凝聚性生长特异表达基因。应用RACE技术 ,克隆DPC凝聚性状态下HSPC0 16全长表达序列 ,使用生物信息学手段分析其染色体定位、蛋白序列、结构域及功能。结果　成功构建了DPC凝聚性生长差异表达cDNA文库 ,筛选出DPC与细胞同源凝集、生长调控、分化发育及信号转导相关的基因 ,其中包括HSPC0 16。HSPC0 16全长cDNA为 4 0 0bp ,染色体定位于 3q2 1 31;HSPC0 16蛋白为 6 4aa,结构域属于PD0 5 3992家族 ,与T2FA基因功能域同源。结论DPC凝聚性生长的差异表达cDNA文库为进一步筛选并克隆DPC凝聚性生长相关基因奠定了基础 ,也为宏观分析多基因协同参与DPC生长调控和功能发挥提供了依据。HSPC0 16的生物信息学分析显示此基因与DPC基因转录调节有关 

【文章来源】：中华医学杂志. 2004,(18)北大核心

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
材料与方法
    一、材料
    二、方法
        1.cDNA消减文库构建及差异表达基因筛选:
        2.差显基因HSPC016的全长cDNA克隆:
结果
    1.DPC培养及总RNA提取:
    2.DPC消减cDNA文库构建、筛选、斑点杂交及测序结果:
    3.HSPC016基因全长cDNA克隆及生物信息学分析:
讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]二步酶消化法分离人头皮毛乳头细胞[J]. 钟白玉,杨卫兵,杨希川,郝飞,伍津津.  中华皮肤科杂志. 2003(07)
[2]人毛乳头细胞凝集性生长差异表达基因cDNA文库的构建[J]. 宋志强,郝飞,杨希川,杨卫兵,程波,麦跃,叶庆佾.  第三军医大学学报. 2003(11)



本文编号：3016163