甜菜坏死黄脉病毒侵染本生烟和大果甜菜的microRNA组群及致病机理研究

发布时间：2021-02-05 18:40

　　microRNA在植物生长发育和抵御病原物侵染的过程中发挥着重要的作用,其表达受植物病毒侵染的影响。对microRNA表达谱的分析可以为病原物致病机理的研究提供新的见解。甜菜坏死黄脉病毒（Beetnecrotic yellow vein virus,BNYVV）是甜菜生产上的毁灭性病害--甜菜丛根病的病原,现已广泛存在于世界各甜菜产区,造成巨大的经济损失。该多分体病毒由4-5条+ssRNA组成,其不同组合在同一寄主植物上或者同一组合在不同寄主植物上致病性不尽相同,致病机理仍不清楚。本论文在已有的研究基础上,从microRNA组学的角度切入,对BNYVV侵染本生烟和大果甜菜的致病原因进行了研究。结果如下:①被BNYVV侵染的本生烟表现出矮化卷叶、根和花器官发育缺陷等症状,本研究通过microRNA表达谱芯片和RT-qPCR试验分析和验证了 miRNAs和靶标基因的差异表达,找到8条本生烟物种特异性miRNAs;发现129条miRNAs的差异表达与BNYVV的侵染相关。与转录组测序结果关联分析发现:GA、IAA和JA信号通路被抑制,乙烯和SA信号通路被激活;GA-GRF1-miR396通路... 

【文章来源】：中国农业大学北京市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：148 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
摘要
Abstract
缩略词
第一章 文献综述
    1.1 植物microRNA的研究进展
    1.2 植物病毒致病机理的研究进展
    1.3 甜菜坏死黄脉病毒的研究进展
    1.4 研究目的与意义
第二章 材料与方法
    2.1 实验材料
    2.2 试剂配制
    2.3 实验方法
第三章 BNYVV侵染本生烟的microRNA组群研究
    3.1 花器官和根发育缺陷是BNYVV RNA4侵染引起的特异性症状
    3.2 microRNA表达谱芯片分析
    3.3 靶标基因分析
    3.4 激素信号系统中的miRNAs/靶标基因在症状形成过程中的作用
    3.5 miR398上调表达有利于本生烟抗BNYVV
    3.6 小结与讨论
第四章 乙烯信号通路在BNYVV致病过程中的作用
    4.1 沉默EIN3减缓BNYVV积累,减轻卷叶症状
    4.2 沉默ACO抑制BNYVV的积累
    4.3 外用1-甲基环丙烯减缓BNYVV积累,减轻卷叶症状
    4.4 小结与讨论
第五章 BNYVV侵染对本生烟光合和抗病系统的影响
    5.1 BNYVV侵染破坏了本生烟光合系统
    5.2 BNYVV侵染诱导本生烟的抗病系统
    5.3 小结与讨论
第六章 BNYVV侵染大果甜菜的microRNA组群研究
    6.1 大果甜菜的small RNA深度测序
    6.2 大果甜菜microRNA组群的系统进化分析
    6.3 miRNAs的差异表达分析
    6.4 大果甜菜差异表达miRNAs的可能靶标基因预测
    6.5 BNYVV侵染本生烟和大果甜菜的microRNA组学比较分析
    6.6 小结与讨论
第七章 结论与展望
    7.1 结论
    7.2 展望
参考文献
致谢
附录Ⅰ BNYVV RNA3编码p25蛋白致病性的研究
附录Ⅱ 双抗BNYVV与BBSV转基因本生烟的创制
附录Ⅲ 引物列表
附录Ⅳ 大果甜菜物种特异性miRNA-5P/-3P序列
个人简介


【参考文献】：
期刊论文
[1]利用小RNA深度测序和组装技术鉴定紫藤花叶病病原[J]. 苏秀,徐毅,陈莎,傅帅,钱亚娟,张立钦,周雪平.  植物病理学报. 2015(01)
[2]烟草T-DNA插入位点侧翼序列扩增方法的筛选与优化[J]. 刘慧,刘贯山,刘峰,龚达平,张雪峰,崔萌萌,路铁刚,王元英.  中国烟草科学. 2014(01)
[3]芜菁花叶病毒对不结球白菜内源激素含量及代谢相关基因转录水平的影响[J]. 王淑敏,侯喜林,李英,曹学伟,张硕,王枫.  南京农业大学学报. 2011(05)
[4]UGPase和反义4CL基因对转基因烟草纤维素和木质素合成的调控[J]. 梁海泳,夏秀英,冯雪松.  植物生理学通讯. 2006(06)
[5]甜菜黑色焦枯病毒经甘蓝油壶菌传播的研究[J]. 蒋军喜,张景凤,车少臣,羊大进,于嘉林,蔡祝南,刘仪.  江西农业大学学报. 1999(04)
[6]甜菜黑色焦枯型病毒病原、cDNA合成、光生物素标记及探针制备[J]. 蔡祝南,陈定虎,吴茂森,崔星明,于嘉林,刘仪.  北京农业大学学报. 1993(03)
[7]甜菜丛根病症状类型的研究[J]. 崔星明,刘仪,蔡祝南,武坚.  植物保护. 1991(05)

博士论文
[1]甜菜坏死黄脉病毒侵染本生烟和大果甜菜的生物学、转录组学和蛋白质组学研究[D]. 范慧艳.中国农业大学 2014



本文编号：3019394