芸薹根肿菌分泌蛋白PbSP1的克隆及表达特征分析

发布时间:2021-04-13 15:26
  【目的】对芸薹根肿菌PbSP1进行克隆和功能分析,丰富芸薹根肿菌分泌蛋白的科学认知。【方法】通过生物信息学分析、表达动态变化和异源表达对芸薹根肿菌分泌蛋白PbSP1进行研究。【结果】通过测序分析发现,PbSP1的序列与已经公布的芸薹根肿菌e3菌株的参考基因组对应基因序列一致,且不存在内含子。生物信息学分析发现PbSP1氨基酸序列的氨基端存在一段信号肽序列,同时序列中存在4个Kazal结构域。通过酵母蔗糖酶分泌实验进一步发现,PbSP1编码的信号肽序列具有活性。通过不同阶段表达特征分析发现,PbSP1在不同时期差异表达,其中在芸薹根肿菌休眠孢子萌发期表达最为活跃。通过亚细胞定位实验发现PbSP1定位在细胞质内。【结论】PbSP1可以被芸薹根肿菌分泌到胞外,并在芸薹根肿菌休眠孢子萌发过程中发挥重要功能。 

【文章来源】:西南农业学报. 2020,33(10)北大核心CSCD

【文章页数】:5 页

【部分图文】:

芸薹根肿菌分泌蛋白PbSP1的克隆及表达特征分析


PbSP1表达量分析

细胞


PbSP1的亚细胞定位

序列,序列,信号肽,氨基


用SignalP 4.1和SMART分别对PbSP1的氨基酸序列进行分析(图2-a)。PbSP1包含185个氨基酸残基,在其氨基端(1~19 aa)存在1个信号肽,分别在20~57 aa, 58~97 aa,100~140 aa, 146~183 aa处均存在一个Kazal结构域。此外,通过TMHMM v2.0分析未发现PbSP1存在膜定位序列。因PbSP1存在一个氨基端信号肽,推测该蛋白可以被分泌到胞外。通过酵母蔗糖酶分泌实验发现(图 2-b),转入PbSP1信号肽序列的YTK12能够在YPRAA上正常生长,也能将TTC还原成红色不溶物甲臜。上述结果表明PbSP1第1~19位的氨基酸序列(1~19)具有信号肽功能。2.3 PbSP1的表达特征

【参考文献】:
期刊论文
[1]甘蓝根肿病菌休眠孢子的生物学特性及侵染寄主的显微观察[J]. 杜艳,刘邮洲,刘永锋,李建斌,乔俊卿,许凌宇.  西南农业学报. 2016(06)
[2]根肿病的研究进展[J]. 李壮,牛应泽,吴永成,郭世星.  西南农业学报. 2013(04)
[3]油菜根肿病症状、病原形态及产量损失研究[J]. 王靖,黄云,胡晓玲,牛应泽,李晓兰,梁勇.  中国油料作物学报. 2008(01)



本文编号:3135552

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