六种斑野螟亚科昆虫全线粒体基因组的序列测定与分析

发布时间：2021-05-19 19:32

　　本文采用PCR技术结合引物步移法测定了桃多斑野螟Conogethes punctiferalis（Guenee,1854）,黄杨绢野螟Diaphaniaperspectalis（Walker,1859）,白蜡绢须野螟 Palpita nigropnctalis（Bremer,1864）,四目扇野螟 Pleuroptya infeior（Hampson,1898）,乳翅卷野螟Pycnarmon lactiferalis（Walker,1859）豹纹卷野螟Pycnarmon pantherata（Butler,1878）6种斑野螟亚科昆虫（螟蛾总科:草螟科）线粒体基因组全序列,并结合已测螟蛾总科昆虫线粒体基因组对其进行了比较基因组学以及系统发育关系的初步分析,主要结论如下:1.桃多斑野螟、黄杨绢野螟、白蜡绢须野螟、四目扇野螟、乳翅卷野螟、豹纹卷野螟线粒体基因组序列全长分别为15325 bp、15249 bp、15226 bp、15348 bp、15219 bp、15545 bp,其中豹纹卷野螟是已测螟蛾总科昆虫线粒体基因组序列中最长的一个物种,其长度差异主要体现在控制区。6种斑野螟亚科昆虫... 

【文章来源】：陕西师范大学陕西省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：74 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第1章 前言
    1.1 分类单元及研究物种的介绍
        1.1.1 鳞翅目及螟蛾总科概况
        1.1.2 研究物种的介绍
    1.2 线粒体基因组
        1.2.1 线粒体结构特征
        1.2.2 线粒体基因组
        1.2.3 线粒体基因组各组分特征
    1.3 螟蛾总科线粒体基因组的研究现状
    1.4 本研究的目的和意义
第2章 研究材料与方法
    2.1 标本的采集、保存与鉴定
    2.2 实验主要仪器和试剂
    2.3 实验方法
        2.3.1 总DNA提取和检测
        2.3.2 PCR引物设计、扩增和测序
        2.3.3 数据处理及分析
    2.4 系统发育分析
        2.4.1 数据来源及外群选择
        2.4.2 系统发育分析方法
第3章 实验结果及分析讨论
    3.1 基因组的结构和组成
        3.1.1 线粒体基因组的结构
        3.1.2 核苷酸组成
    3.2 基因间隔区与重叠区
    3.3 蛋白质编码基因
        3.3.1 蛋白质编码基因的组成结构
        3.3.2 蛋白质编码基因起始密码子和终止密码子的使用
        3.3.3 蛋白质编码基因密码子的使用及氨基酸的组成
    3.4 tRNA基因
        3.4.1 tRNA基因的组成
        3.4.2 tRNA基因的二级结构
    3.5 rRNA基因
        3.5.1 rRNA基因的组成
        3.5.2 rRNA基因的二级结构
    3.6 A+T富集区
    3.7 讨论
第4章 螟蛾总科系统发育关系的探讨
    4.1 系统发育树的构建
    4.2 系统发育树的结果及讨论
        4.2.1 贝叶斯法建树结果分析
        4.2.2 最大似然法建树结果分析
第5章 总结
参考文献
致谢
攻读硕士学位期间的研究成果


【参考文献】：
期刊论文
[1]印度谷螟线粒体基因组测定及螟蛾总科系统发育分析[J]. 唐培安,吴海晶,王娟,郭仲龙,袁明龙.  中国科学:生命科学. 2015(09)
[2]线粒体基因组数据的分析方法和软件[J]. 李雪娟,杨婧,王俊红,任倩俐,李霞,黄原.  应用昆虫学报. 2013(01)
[3]菜粉蝶线粒体基因组的全序列测定和分析[J]. 毛增辉,郝家胜,朱国萍,胡静,司曼曼,朱朝东.  昆虫学报. 2010(11)
[4]The phylogeny of Orthoptera inferred from mtDNA and description of Elimaea cheni（Tettigoniidae:Phaneropterinae）mitogenome[J]. Zhijun Zhou a,b,Haiyan Ye b,Yuan Huang b,Fuming Shi a a College of Life Science,Hebei University,Baoding 071002,China b College of Life Science,Shaanxi Normal University,Xi’an 710062,China.  遗传学报. 2010(05)
[5]The complete mitogenome of the Chinese bush cricket,Gampsocleis gratiosa （Orthoptera:Tettigonioidea）[J]. Zhijun Zhou a,Fuming Shi b,Yuan Huang a,a College of Life Science,Shaanxi Normal University,Xi’an 710062,China b College of Life Science,Hebei University,Baoding 071002,China.  遗传学报. 2008(06)
[6]黄杨绢野螟的发生规律及防治技术[J]. 史洪中,胡孔峰.  湖北农业科学. 2007(01)
[7]桃蛀螟在玉米上危害加重原因与控制对策[J]. 王振营,何康来,石洁,马嵩岳.  植物保护. 2006(02)
[8]PCR引物设计及软件使用技巧[J]. 张新宇,高燕宁.  生物信息学. 2004(04)
[9]玉米田桃蛀螟发生规律的研究[J]. 吴立民,陆化森.  昆虫知识. 1995(04)



本文编号：3196323