小菜蛾基因组中内源性逆转录病毒元件PxERV的发现与特征分析

发布时间：2021-06-07 04:43

　　【目的】内源性逆转录病毒（endogenous retroviruses, ERVs）是一类在宿主基因组中世代留存的有类似病毒结构的序列元件。本研究在通过前期小菜蛾Plutella xylostella精巢转录组分析发现一个小菜蛾内源性逆转录病毒元件PxERV的基础上,探究该逆转录病毒元件的序列特征及侵染活性,为探明内源性逆转录病毒对小菜蛾的影响奠定基础。【方法】利用生物信息学方法分析鉴定了PxERV在小菜蛾基因组上的序列及结构特点,并用基因克隆和测序得到PxERV的env基因序列;进一步通过MEGA6软件构建了昆虫env基因编码的氨基酸序列与核型多角体病毒包膜糖蛋白的系统发育树。利用qPCR技术检测了env基因在小菜蛾G88品系不同发育时期虫体和精巢中的表达模式及FZ品系成虫和G88品系的成虫和幼虫中env基因拷贝数的变化。利用CRISPR/Cas9介导小菜蛾G88品系中env基因突变,检测PxERV的独立复制活性。【结果】PxERV有LTR-pol-env-LTR结构,其env基因与果蝇Drosophila buzzatii逆转座子osvaldo和粉纹夜蛾Trichoplusia ... 

【文章来源】：昆虫学报. 2020,63(07)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

小菜蛾内源性逆转录病毒元件PxERV基因组结构示意图

基于氨基酸序列构建的昆虫内源性逆转录病毒env基因编码的氨基酸序列与核型多角体病毒包膜糖蛋白系统发育树(邻接法, 1 000次重复)

我们对5个发育时期的小菜蛾G88品系虫体和精巢中env基因的表达情况进行了qPCR检测,结果(图3)显示该env基因在成虫精巢中特异性高表达(P<0.05),在其他发育时期的虫体和精巢之间表达量都没有显著差异(P>0.05),但在成虫时期的虫体中比其他时期虫体中表达量稍高;在精巢中的表达量总体比在虫体中表达量稍高。2.4 env基因在小菜蛾不同品系中的拷贝数


本文编号：3215888