樱桃耐涝相关基因的克隆与表达分析
发布时间：2021-06-13 03:26
樱桃为蔷薇科樱属落叶果树,味美形娇,营养丰富,经济效益高,是我国大面积栽培的高档果品。但其根系浅,对环境变化反应敏感,不耐涝。在樱桃栽培过程中,由于降水不均、排水不良等因素,涝害时有发生,常造成严重的经济损失。因此,采取各种手段,尤其是现代分子生物学技术,进行樱桃耐涝性的遗传改良与种质创新具有重要意义。本文以筛选出的耐涝樱桃种质’沂蒙山樱’和敏涝樱桃种质’矮化樱桃’为试材,克隆了与植物耐涝相关的PsERF和PsCIPK基因、与碳水化合物代谢和根系发生相关的PsPDC、PsADH、PsSUS、PsRAMY和PsEXP基因的cDNA序列,研究了淹水胁迫和恢复处理过程中上述基因在耐/敏涝樱桃种质中的时空表达特性,并通过分析樱桃PsERF和PsCIPK基因与PsPDC、PsADH、PsSUS、PsR4MY和PsEXP基因在淹涝胁迫下表达情况的一致性和相关性,试图探明樱桃应答淹涝胁迫的响应途径,阐明樱桃种质耐涝能力强弱差异的分子机理,确定调控樱桃耐涝性的关键基因,为今后通过基因工程手段进樱桃耐涝性的分子遗传改良与种质创新奠定基础。主要研究结果如下:1、以耐涝种质’沂蒙山樱’叶片为材料,采用RAC...
【文章来源】：扬州大学江苏省
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１沂蒙山樱（左）和矮化櫻桃（右）淹涝处理??Ｆｉｇ２－１?Ｗａｔｅｒｌｏｇｇｉｎｇ?ｔｒｅａｔｍｅｎｔ?ｏｆ?Ｐｒｕｎｕｓ?ｓｅｒｒｕｌａｔａ?＊Ｙｉｍｅｎｇ，?（ｌｅｆｔ）?ａｎｄ??＇５
表示不同样本中特定基因ＣＴ值的差异，即（待测组目的基因平均ＣＴ的平均ＣＴ值）－（对照组目的基因ＣＴ值－对照组Ｍ／ｎ基因的平均Ｃ加样误差，用内目的基因标和ｗ如因标准差标准差的平方和的平方目的基因２个数值的标准差，Ａａ为《＾／？基因两个数值的标ｎ２＋Ａａ２），Ａｎ＝ＳＴＤＥＶ（Ｎｌ：Ｎ２），Ａａ＝ＳＴＤＥＶ（Ａｌ：Ａ２）。??正过误差后，目的基因表达的相对含量。根据定义，对照样本中的为１，然而相对于对照样本，Ｆ为淹涝处理株样本中该定基因表达Ｅ?（Ｆｌ，Ｆ３）?，?Ｆ１＝２ａ（－ＡＡＣＴ＋Ａ），Ｆ２＝２ａ（－ＡＡＣＴ－Ａ），Ｆ３＝２ａ（．在误差影响下目的基因表达相对含量的标准差，ｏ＝ＳＴＤＥＶ?（Ｆｌ，Ｆ２，析??基因ｃＤＮＡ全长克隆及序列分析??基因ｃＤＮＡ序列的克隆??Ｍ?；Ｖ?５；?Ｍ??
３＇和５’ＲＡＣＥ获得的序列结果使用ＤＮＡＭＡＮ进行拼接，得到基因ｃＤＮＡ全长序列。??该ｃＤＮＡ全长１６２５ｂｐ，具有起始密码子、完整的开放阅读框（１１４９ｂｐ；）、终止密码子、５＇非??编码区（１５１ｂｐ）、３＇非编码区（３１３ｂｐ）和ｐ０ｌｙ（Ａ）尾巴（１２ｂｐ），共编码?３８２?个氨基酸（图２－４），??将其命名为ＰｓＭＦ。??１?ＡＣＡＴＧＧＧＧＡＧ?ＡＣ?ＡＡＴ?ＡＡ：?ＡＡＡＡＧＣＡＴＴ?ＴＣＴＣ?ＴＴ?Ｔ?ＴＡＡＣＴＣＧＣ?Ｔ?ＴＣＧ?ＴＴ?ＴＯＣＡＭＡＣＡＣＭ??６１?ＡＡＣＣ?Ａ；?ＴＯＧ?Ｔ?ＡＴ?ＡＣＡＴ?ＴＴ?ＴＡＳ?ＴＣＴＧ?ＡｆＬＡＡＡＴＯＣＣ?ＡＧＣ?ＴＴ?Ｔ?ＴＣＧ?ＡＴ?Ｔ?ＴＴＣＣＧ?ＡＣＡＴＣＴ?Ｔ?ＴＴ??１２１?ＣＣＡＧＣＴＧＣＡＡＪｉＧ?ＴＯ：?ＴＣＴＧ?ＡＳ?ＡＡＣＧＧＣ?ＡＭＡＡＴＧＴＧ?ＴＧＧ?ＡＧＧ?ＴＧＣ?ＴＡＴＡＡＴ?ＡＴＣＯＧ?ＡＴＴ?Ｔ??Ｉ?ＨＣＧＧＡＩＩＳＤＦ??１８１?ＣＡＴ?ＡＧＣＧＯＣＧｉｉＣ?ＴＯＵＧ?ＴＣＡＯＧＧＣＴＣ?Ａ３ＣＧＣＣＧＡＣ?ＴＡＣＣＴＣ?ＴＧＧＯＣＣＧＡＴＣＴＣＡＡＡＡＡＡＴＣ??ＩＩ?ＩＡＰＴＲＳＲＬＴＡＤＹＬＷＰＤＬＫＫＳ??２４１?Ｔ?ＴＣＧＧＧ?ＡＭＧＯＪＧ?ＴＴＣ?ＴＣＧＭＧＯ：?ＡＣＴＣ?Ａ；ＣＯＣＣＧＡＡＡＴＣＧＴＣＧＡＣ?ＴＴＡＧＡＣＧＡＣＧＡ??３１?ＳＳＧＫＲＦＳＫＰＬＳＰＥＩＶＤＬＤＤＤ??３０１?Ｃ?ＴＴＣＧＡＧＧＣ?ＴＧＡＴ?ＴＴＣＣＡＧＧＡＡＴＴＣＭＧＧＡＣＧＡＧＩＣ?ＴＧＡＴＧＴＧＧＡＣＧＡＡＧＡＴ
【参考文献】：
期刊论文
[1]野生毛樱桃SSR遗传多样性和遗传结构分析[J]. 宛甜,蔡宇良,冯瑛,张雪,何恒流. 西北植物学报. 2013(08)
[2]低氧胁迫下钙对樱桃根系功能及氮代谢的影响[J]. 生利霞,冯立国,束怀瑞. 生态学杂志. 2011(10)
[3]低氧胁迫下外源硝态氮对樱桃根系功能及氮代谢相关酶活性的影响[J]. 冯立国,生利霞,束怀瑞. 应用生态学报. 2010(12)
[4]氮对低氧胁迫下樱桃根系抗氧化酶活性及线粒体功能的影响[J]. 生利霞,冯立国,束怀瑞. 园艺学报. 2009(11)
[5]外源硝态氮提高淹水甜樱桃根系糖含量及蔗糖相关酶活性[J]. 郝云红,胡艳丽,沈向,毛志泉,王元征,苏立涛,杨树泉. 园艺学报. 2009(07)
[6]低氧胁迫下钙对樱桃砧木根系抗氧化系统及线粒体功能的影响[J]. 生利霞,冯立国,束怀瑞. 中国农业科学. 2008(11)
[7]Calcineurin B-like interacting protein kinase OsCIPK23 functions in pollination and drought stress responses in rice （Oryza sativa L.）[J]. Edith Omo-Ikerodah. 遗传学报. 2008(09)
[8]淹水对两种甜樱桃砧木根系无氧呼吸酶及发酵产物的影响[J]. 陈强,郭修武,胡艳丽,李静,高相彬,王闯,郝云红,赵林,毛志泉. 生态学报. 2007(11)
[9]CIPK9: a calcium sensor-interacting protein kinase required for low-potassium tolerance in Arabidopsis[J]. Girdhar K Pandey,Yong Hwa Cheong,Beom-Gi Kim,John J Grant,Legong Li. Cell Research. 2007(05)
[10]柑橘组织RNA提取方法研究[J]. 徐昌杰,陈昆松,张波,王钱洁,叶薇佳. 果树学报. 2004(02)
博士论文
[1]砂梨果实成熟软化相关基因的克隆、表达分析及其表达载体的构建[D]. 乔玉山.南京农业大学 2009
[2]野生樱桃种质资源的遗传分析及其栽培品种的DNA指纹鉴定[D]. 蔡宇良.西北大学 2006
硕士论文
[1]甜樱桃内参基因验证与MADS-Box基因的克隆及表达分析[D]. 陶永焕.河南农业大学 2014
[2]甜樱桃内参基因的筛选[D]. 张芳明.河南农业大学 2013
[3]苹果MdCIPK6的基因克隆及其在逆境胁迫响应中的作用[D]. 王荣凯.山东农业大学 2011
[4]不同形态氮对甜樱桃涝后恢复过程中生理生化特性影响的研究[D]. 李静.山东农业大学 2008
[5]青竹复叶槭耐水淹与耐低温生理研究[D]. 李昳乐.河南农业大学 2008
[6]毛樱桃资源遗传多样性及与李属近缘种亲缘关系的研究[D]. 张琪静.沈阳农业大学 2007
[7]涝害对樱桃砧木生理生化特性的影响[D]. 王嘉艳.山东农业大学 2006
[8]淹水胁迫下薏苡乙醇脱氢酶（ADH1）和丙酮酸脱羧酶（PDC1）基因cDNA片段的克隆及其表达的初步分析[D]. 吴功庆.华中农业大学 2006
本文编号：3226897
【文章来源】：扬州大学江苏省
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１沂蒙山樱（左）和矮化櫻桃（右）淹涝处理??Ｆｉｇ２－１?Ｗａｔｅｒｌｏｇｇｉｎｇ?ｔｒｅａｔｍｅｎｔ?ｏｆ?Ｐｒｕｎｕｓ?ｓｅｒｒｕｌａｔａ?＊Ｙｉｍｅｎｇ，?（ｌｅｆｔ）?ａｎｄ??＇５
表示不同样本中特定基因ＣＴ值的差异，即（待测组目的基因平均ＣＴ的平均ＣＴ值）－（对照组目的基因ＣＴ值－对照组Ｍ／ｎ基因的平均Ｃ加样误差，用内目的基因标和ｗ如因标准差标准差的平方和的平方目的基因２个数值的标准差，Ａａ为《＾／？基因两个数值的标ｎ２＋Ａａ２），Ａｎ＝ＳＴＤＥＶ（Ｎｌ：Ｎ２），Ａａ＝ＳＴＤＥＶ（Ａｌ：Ａ２）。??正过误差后，目的基因表达的相对含量。根据定义，对照样本中的为１，然而相对于对照样本，Ｆ为淹涝处理株样本中该定基因表达Ｅ?（Ｆｌ，Ｆ３）?，?Ｆ１＝２ａ（－ＡＡＣＴ＋Ａ），Ｆ２＝２ａ（－ＡＡＣＴ－Ａ），Ｆ３＝２ａ（．在误差影响下目的基因表达相对含量的标准差，ｏ＝ＳＴＤＥＶ?（Ｆｌ，Ｆ２，析??基因ｃＤＮＡ全长克隆及序列分析??基因ｃＤＮＡ序列的克隆??Ｍ?；Ｖ?５；?Ｍ??
３＇和５’ＲＡＣＥ获得的序列结果使用ＤＮＡＭＡＮ进行拼接，得到基因ｃＤＮＡ全长序列。??该ｃＤＮＡ全长１６２５ｂｐ，具有起始密码子、完整的开放阅读框（１１４９ｂｐ；）、终止密码子、５＇非??编码区（１５１ｂｐ）、３＇非编码区（３１３ｂｐ）和ｐ０ｌｙ（Ａ）尾巴（１２ｂｐ），共编码?３８２?个氨基酸（图２－４），??将其命名为ＰｓＭＦ。??１?ＡＣＡＴＧＧＧＧＡＧ?ＡＣ?ＡＡＴ?ＡＡ：?ＡＡＡＡＧＣＡＴＴ?ＴＣＴＣ?ＴＴ?Ｔ?ＴＡＡＣＴＣＧＣ?Ｔ?ＴＣＧ?ＴＴ?ＴＯＣＡＭＡＣＡＣＭ??６１?ＡＡＣＣ?Ａ；?ＴＯＧ?Ｔ?ＡＴ?ＡＣＡＴ?ＴＴ?ＴＡＳ?ＴＣＴＧ?ＡｆＬＡＡＡＴＯＣＣ?ＡＧＣ?ＴＴ?Ｔ?ＴＣＧ?ＡＴ?Ｔ?ＴＴＣＣＧ?ＡＣＡＴＣＴ?Ｔ?ＴＴ??１２１?ＣＣＡＧＣＴＧＣＡＡＪｉＧ?ＴＯ：?ＴＣＴＧ?ＡＳ?ＡＡＣＧＧＣ?ＡＭＡＡＴＧＴＧ?ＴＧＧ?ＡＧＧ?ＴＧＣ?ＴＡＴＡＡＴ?ＡＴＣＯＧ?ＡＴＴ?Ｔ??Ｉ?ＨＣＧＧＡＩＩＳＤＦ??１８１?ＣＡＴ?ＡＧＣＧＯＣＧｉｉＣ?ＴＯＵＧ?ＴＣＡＯＧＧＣＴＣ?Ａ３ＣＧＣＣＧＡＣ?ＴＡＣＣＴＣ?ＴＧＧＯＣＣＧＡＴＣＴＣＡＡＡＡＡＡＴＣ??ＩＩ?ＩＡＰＴＲＳＲＬＴＡＤＹＬＷＰＤＬＫＫＳ??２４１?Ｔ?ＴＣＧＧＧ?ＡＭＧＯＪＧ?ＴＴＣ?ＴＣＧＭＧＯ：?ＡＣＴＣ?Ａ；ＣＯＣＣＧＡＡＡＴＣＧＴＣＧＡＣ?ＴＴＡＧＡＣＧＡＣＧＡ??３１?ＳＳＧＫＲＦＳＫＰＬＳＰＥＩＶＤＬＤＤＤ??３０１?Ｃ?ＴＴＣＧＡＧＧＣ?ＴＧＡＴ?ＴＴＣＣＡＧＧＡＡＴＴＣＭＧＧＡＣＧＡＧＩＣ?ＴＧＡＴＧＴＧＧＡＣＧＡＡＧＡＴ
【参考文献】：
期刊论文
[1]野生毛樱桃SSR遗传多样性和遗传结构分析[J]. 宛甜,蔡宇良,冯瑛,张雪,何恒流. 西北植物学报. 2013(08)
[2]低氧胁迫下钙对樱桃根系功能及氮代谢的影响[J]. 生利霞,冯立国,束怀瑞. 生态学杂志. 2011(10)
[3]低氧胁迫下外源硝态氮对樱桃根系功能及氮代谢相关酶活性的影响[J]. 冯立国,生利霞,束怀瑞. 应用生态学报. 2010(12)
[4]氮对低氧胁迫下樱桃根系抗氧化酶活性及线粒体功能的影响[J]. 生利霞,冯立国,束怀瑞. 园艺学报. 2009(11)
[5]外源硝态氮提高淹水甜樱桃根系糖含量及蔗糖相关酶活性[J]. 郝云红,胡艳丽,沈向,毛志泉,王元征,苏立涛,杨树泉. 园艺学报. 2009(07)
[6]低氧胁迫下钙对樱桃砧木根系抗氧化系统及线粒体功能的影响[J]. 生利霞,冯立国,束怀瑞. 中国农业科学. 2008(11)
[7]Calcineurin B-like interacting protein kinase OsCIPK23 functions in pollination and drought stress responses in rice （Oryza sativa L.）[J]. Edith Omo-Ikerodah. 遗传学报. 2008(09)
[8]淹水对两种甜樱桃砧木根系无氧呼吸酶及发酵产物的影响[J]. 陈强,郭修武,胡艳丽,李静,高相彬,王闯,郝云红,赵林,毛志泉. 生态学报. 2007(11)
[9]CIPK9: a calcium sensor-interacting protein kinase required for low-potassium tolerance in Arabidopsis[J]. Girdhar K Pandey,Yong Hwa Cheong,Beom-Gi Kim,John J Grant,Legong Li. Cell Research. 2007(05)
[10]柑橘组织RNA提取方法研究[J]. 徐昌杰,陈昆松,张波,王钱洁,叶薇佳. 果树学报. 2004(02)
博士论文
[1]砂梨果实成熟软化相关基因的克隆、表达分析及其表达载体的构建[D]. 乔玉山.南京农业大学 2009
[2]野生樱桃种质资源的遗传分析及其栽培品种的DNA指纹鉴定[D]. 蔡宇良.西北大学 2006
硕士论文
[1]甜樱桃内参基因验证与MADS-Box基因的克隆及表达分析[D]. 陶永焕.河南农业大学 2014
[2]甜樱桃内参基因的筛选[D]. 张芳明.河南农业大学 2013
[3]苹果MdCIPK6的基因克隆及其在逆境胁迫响应中的作用[D]. 王荣凯.山东农业大学 2011
[4]不同形态氮对甜樱桃涝后恢复过程中生理生化特性影响的研究[D]. 李静.山东农业大学 2008
[5]青竹复叶槭耐水淹与耐低温生理研究[D]. 李昳乐.河南农业大学 2008
[6]毛樱桃资源遗传多样性及与李属近缘种亲缘关系的研究[D]. 张琪静.沈阳农业大学 2007
[7]涝害对樱桃砧木生理生化特性的影响[D]. 王嘉艳.山东农业大学 2006
[8]淹水胁迫下薏苡乙醇脱氢酶（ADH1）和丙酮酸脱羧酶（PDC1）基因cDNA片段的克隆及其表达的初步分析[D]. 吴功庆.华中农业大学 2006
本文编号：3226897
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