锥栗半同胞子代群体遗传结构及栗疫病抗性变异分析
发布时间：2021-07-10 20:45
锥栗（Castanea henryi）是我国南方重要的木本粮食树种。随着锥栗产业及种植面积的不断扩大,选育锥栗优良品种显得尤为重要。由于对锥栗疫病抗性的遗传基础研究比较薄弱,目前仍未选育出用于推广的高抗优良品种。本研究利用开发的转录组SSR标记对锥栗半同胞子代群体进行了遗传多样性及遗传结构分析,并对群体的栗疫病抗性及苗期性状进行了变异分析,开展了优良家系和优良单株的初步选择,并进行了转录组SSR分子标记和表型性状的关联分析,为进一步的良种选育提供参考。主要研究结果如下:1.以6个锥栗农家品种、3个板栗农家品种和3个日本栗栽培品种为材料,共设计合成108对转录组SSR引物进行扩增,。其中引物FAFUZLEST-7、FAFUZLEST-9、FAFUZLEST-11、FAFUZLEST-12、FAFUZLEST-18等5个引物的多态性条带百分比均为100%。2.利用18对转录组SSR引物对14个锥栗半同胞子代群体进行遗传多样性和遗传结构分析。检测出Shanon信息指数（I）的范围在1.037～1.287,平均有效等位基因数Ne=3.015,平均观测杂合度Ho=0.584,平均期望杂合度He=...
【文章来源】：福建农林大学福建省
【文章页数】：105 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
部分SSR引物的扩增结果
锥栗半同胞子代群体遗传结构及栗疫病抗性变异分析17图2-212个基因型的聚类图Figure2-2Dendrogramofthe12genotypes注：蓝色为板栗，绿色为日本栗，红色为锥栗。Cm-1~3为板栗1~3，Cc-1~3为日本栗1~3，Ch-1~6为处暑红、双峰子、大苞榛、乌榛、大尖嘴、油榛。Note:BlueforCastaneamollissima,greenforCastaneacrenata,redforCastaneahenryi.Cm-1~3areCastaneamollissima1~3,Cc-1~3areCastaneacrenata1~3,Ch-1~6areCSH、SFZ、DBZ、WZ、DJZ、YZ.
锥栗半同胞子代群体的转录组SSR分析22尖嘴（DJZ）群体的He最大，大苞榛（DBZ）的最小；Shanon信息指数（I）的范围在1.037-1.287，平均Shanon信息指数（I）为1.186，其中中尖嘴（ZJZ）群体的I最大，大苞榛（DBZ）的最小；多态性位点百分比（PPL）的范围在34.25%~60.77%，平均多态性位点百分比（PPL）为93.37%，其中油桐仔（YTZ）群体的PPL最大，大苞榛（DBZ）的最校总体可以看出群体总体平均值都较高，说明锥栗的遗传多样性较丰富。从（表3-2）中可以看出，有11个群体的观测杂合度值低于它们的期望杂合度值，这说明大部分群体的交配方式偏离随机杂交方式。图3-1锥栗半同胞家系毛细管电泳三色图Figure3-1Capillaryelectrophoresistrichromatograminsemi-siblingfamiliesofCastaneahenryi
【参考文献】：
期刊论文
[1]甜玉米种子营养品质主要性状全基因组关联分析[J]. 王长进,徐运林,程昕昕,周毅,余海兵. 浙江农业学报. 2020(03)
[2]温热带玉米株高的全基因组关联分析[J]. 郭子锋,徐孝洁,刘小刚,王山荭. 玉米科学. 2020(01)
[3]普通小麦根系建成相关性状的全基因组关联分析[J]. 陈贵菊,靳义荣,刘彩云,贾德新,樊庆琦,刘金栋,刘鹏. 植物遗传资源学报. 2020(04)
[4]林木全基因组关联分析研究进展与展望[J]. 李鹏,卢文杰,肖亮,权明洋,李连政,杜庆章,张德强. 中国科学:生命科学. 2020(02)
[5]马尾松候选基因EST-SSR引物开发[J]. 龚桂芳,冯源恒,安琪,杨章旗. 分子植物育种. 2020(23)
[6]锥栗基因组SSR开发及农家品种的遗传多样性分析[J]. 顾光仕,李颖林,刘丹,陈辉,郑国华,李煜. 森林与环境学报. 2020(01)
[7]水稻4种功能营养成分与SSR标记关联分析[J]. 邹德堂,赵海彤,孙健,瞿炤珺,孙琦,付俊生,韩笑. 东北农业大学学报. 2019(12)
[8]锥栗幼林期叶片表型及光合生理性状遗传变异研究[J]. 杨龙,江锡兵,吴强,章平生,吴聪连,吴小云,龚榜初,赖俊声. 林业科技通讯. 2019(11)
[9]板栗和锥栗种间杂交F1代叶片表型及其遗传变异研究[J]. 江锡兵,章平生,杨龙,吴强,吴聪连,吴小云,龚榜初,赖俊声. 园艺学报. 2019(11)
[10]转基因技术对中国农业发展的影响分析与建议[J]. 黄毓骁. 中国集体经济. 2019(24)
博士论文
[1]赤桉抗风特性及其重要性状的关联分析[D]. 尚秀华.中国林业科学研究院 2017
[2]基于连锁与连锁不平衡作图解析粳稻稻瘟病抗性遗传位点[D]. 郭丽颖.东北农业大学 2016
[3]利用关联作图解析紫斑牡丹重要性状的等位遗传变异[D]. 吴静.北京林业大学 2016
[4]杜仲高密度遗传连锁图谱构建与重要数量性状的分子标记[D]. 李煜.西北农林科技大学 2015
[5]桉树高密度遗传图谱构建及生长和材性相关QTL解析[D]. 于晓丽.中国林业科学研究院 2015
[6]利用连锁与连锁不平衡联合作图解析毛白杨重要性状的等位遗传变异[D]. 杜庆章.北京林业大学 2014
[7]美洲黑杨×青杨连锁图构建及重要材性QTLs分析[D]. 黄秦军.北京林业大学 2003
硕士论文
[1]基于SSR、SRAP标记的榛属种质资源遗传多样性及亲缘关系分析[D]. 陈豫静.沈阳农业大学 2019
[2]基于SSR标记的香蕉品种指纹图谱及ID构建[D]. 唐敏慧.江西农业大学 2019
[3]中国樟树群体遗传结构研究[D]. 刘爽.江西农业大学 2019
[4]基于SSR分子标记的中国古老月季野生亲本分析[D]. 吴高琼.云南大学 2019
[5]锥栗野生和栽培群体遗传多样性的SSR分析[D]. 李颖林.福建农林大学 2019
[6]闽楠种质资源遗传多样性的SSR分析[D]. 刘丹.福建农林大学 2019
[7]乌桕EST-SSR标记开发与遗传评价[D]. 董峰平.浙江农林大学 2019
[8]野生花生全基因组SSR标记的开发与应用[D]. 仇静静.山东师范大学 2018
[9]野杏SSR标记多样性及其与表型性状的关联分析[D]. 卢彩云.沈阳农业大学 2018
[10]甘蔗栽培品种的主要农艺性状与AFLP和SSR分子标记的关联分析[D]. 朱专为.福建农林大学 2018
本文编号：3276632
【文章来源】：福建农林大学福建省
【文章页数】：105 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
部分SSR引物的扩增结果
锥栗半同胞子代群体遗传结构及栗疫病抗性变异分析17图2-212个基因型的聚类图Figure2-2Dendrogramofthe12genotypes注：蓝色为板栗，绿色为日本栗，红色为锥栗。Cm-1~3为板栗1~3，Cc-1~3为日本栗1~3，Ch-1~6为处暑红、双峰子、大苞榛、乌榛、大尖嘴、油榛。Note:BlueforCastaneamollissima,greenforCastaneacrenata,redforCastaneahenryi.Cm-1~3areCastaneamollissima1~3,Cc-1~3areCastaneacrenata1~3,Ch-1~6areCSH、SFZ、DBZ、WZ、DJZ、YZ.
锥栗半同胞子代群体的转录组SSR分析22尖嘴（DJZ）群体的He最大，大苞榛（DBZ）的最小；Shanon信息指数（I）的范围在1.037-1.287，平均Shanon信息指数（I）为1.186，其中中尖嘴（ZJZ）群体的I最大，大苞榛（DBZ）的最小；多态性位点百分比（PPL）的范围在34.25%~60.77%，平均多态性位点百分比（PPL）为93.37%，其中油桐仔（YTZ）群体的PPL最大，大苞榛（DBZ）的最校总体可以看出群体总体平均值都较高，说明锥栗的遗传多样性较丰富。从（表3-2）中可以看出，有11个群体的观测杂合度值低于它们的期望杂合度值，这说明大部分群体的交配方式偏离随机杂交方式。图3-1锥栗半同胞家系毛细管电泳三色图Figure3-1Capillaryelectrophoresistrichromatograminsemi-siblingfamiliesofCastaneahenryi
【参考文献】：
期刊论文
[1]甜玉米种子营养品质主要性状全基因组关联分析[J]. 王长进,徐运林,程昕昕,周毅,余海兵. 浙江农业学报. 2020(03)
[2]温热带玉米株高的全基因组关联分析[J]. 郭子锋,徐孝洁,刘小刚,王山荭. 玉米科学. 2020(01)
[3]普通小麦根系建成相关性状的全基因组关联分析[J]. 陈贵菊,靳义荣,刘彩云,贾德新,樊庆琦,刘金栋,刘鹏. 植物遗传资源学报. 2020(04)
[4]林木全基因组关联分析研究进展与展望[J]. 李鹏,卢文杰,肖亮,权明洋,李连政,杜庆章,张德强. 中国科学:生命科学. 2020(02)
[5]马尾松候选基因EST-SSR引物开发[J]. 龚桂芳,冯源恒,安琪,杨章旗. 分子植物育种. 2020(23)
[6]锥栗基因组SSR开发及农家品种的遗传多样性分析[J]. 顾光仕,李颖林,刘丹,陈辉,郑国华,李煜. 森林与环境学报. 2020(01)
[7]水稻4种功能营养成分与SSR标记关联分析[J]. 邹德堂,赵海彤,孙健,瞿炤珺,孙琦,付俊生,韩笑. 东北农业大学学报. 2019(12)
[8]锥栗幼林期叶片表型及光合生理性状遗传变异研究[J]. 杨龙,江锡兵,吴强,章平生,吴聪连,吴小云,龚榜初,赖俊声. 林业科技通讯. 2019(11)
[9]板栗和锥栗种间杂交F1代叶片表型及其遗传变异研究[J]. 江锡兵,章平生,杨龙,吴强,吴聪连,吴小云,龚榜初,赖俊声. 园艺学报. 2019(11)
[10]转基因技术对中国农业发展的影响分析与建议[J]. 黄毓骁. 中国集体经济. 2019(24)
博士论文
[1]赤桉抗风特性及其重要性状的关联分析[D]. 尚秀华.中国林业科学研究院 2017
[2]基于连锁与连锁不平衡作图解析粳稻稻瘟病抗性遗传位点[D]. 郭丽颖.东北农业大学 2016
[3]利用关联作图解析紫斑牡丹重要性状的等位遗传变异[D]. 吴静.北京林业大学 2016
[4]杜仲高密度遗传连锁图谱构建与重要数量性状的分子标记[D]. 李煜.西北农林科技大学 2015
[5]桉树高密度遗传图谱构建及生长和材性相关QTL解析[D]. 于晓丽.中国林业科学研究院 2015
[6]利用连锁与连锁不平衡联合作图解析毛白杨重要性状的等位遗传变异[D]. 杜庆章.北京林业大学 2014
[7]美洲黑杨×青杨连锁图构建及重要材性QTLs分析[D]. 黄秦军.北京林业大学 2003
硕士论文
[1]基于SSR、SRAP标记的榛属种质资源遗传多样性及亲缘关系分析[D]. 陈豫静.沈阳农业大学 2019
[2]基于SSR标记的香蕉品种指纹图谱及ID构建[D]. 唐敏慧.江西农业大学 2019
[3]中国樟树群体遗传结构研究[D]. 刘爽.江西农业大学 2019
[4]基于SSR分子标记的中国古老月季野生亲本分析[D]. 吴高琼.云南大学 2019
[5]锥栗野生和栽培群体遗传多样性的SSR分析[D]. 李颖林.福建农林大学 2019
[6]闽楠种质资源遗传多样性的SSR分析[D]. 刘丹.福建农林大学 2019
[7]乌桕EST-SSR标记开发与遗传评价[D]. 董峰平.浙江农林大学 2019
[8]野生花生全基因组SSR标记的开发与应用[D]. 仇静静.山东师范大学 2018
[9]野杏SSR标记多样性及其与表型性状的关联分析[D]. 卢彩云.沈阳农业大学 2018
[10]甘蔗栽培品种的主要农艺性状与AFLP和SSR分子标记的关联分析[D]. 朱专为.福建农林大学 2018
本文编号：3276632
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/dzwbhlw/3276632.html
最近更新
教材专著
