家蚕二分浓核病毒NS1蛋白表达分析及其互作蛋白研究

发布时间:2021-07-24 13:40
  家蚕二分浓核病毒(Bombyx mori bidensovirus,BmBDV)归属于新设定的二分DNA病毒科二分浓核病毒属,是目前唯一一个编码DNA聚合酶的单链二分体DNA病毒。该病毒曾归属于细小病毒科浓核病毒亚科,与家蚕浓核病毒Ⅰ相似,病毒粒子为二十面体非囊膜包裹结构,主要感染家蚕中肠柱状上皮细胞,并引发家蚕浓核症。Bm BDV基因组包括两个节段的单链DNA分子VD1 6.6 kb和VD26.0 kb,独立包装。BmBDV NS1由VD1-ORF2编码,具有316个氨基酸残基,其理论分子量大小为36 KDa,等电点8.70,生物信息学结果表明Bm BDV NS1蛋白与细小病毒NS1蛋白同源。先前的研究发现NS1蛋白是一个多功能蛋白,具有ATPase、解旋酶及绑定特定DNA序列的活性。然而,该蛋白的表达模式及其与宿主或病毒蛋白的相互作用还未阐明。在本研究中,我们首先设计了12条含12个氨基酸的短肽抗原,制备NS1的单克隆抗体,其中一个抗体具有较高的特异性和效价,能特异识别大肠杆菌中表达的NS1和病毒感染的家蚕中肠中的NS1,抗原表位为DIPPEEYRELRT。然后分析了ns1基因在病... 

【文章来源】:江苏大学江苏省

【文章页数】:77 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

家蚕二分浓核病毒NS1蛋白表达分析及其互作蛋白研究


家蚕感染BmBDV后的病理现象[8]

基因组结构


编码非结构蛋白 NS3,VD2-ORF2 包括 3483 nts,编码次要结构蛋白 P133(其基因组结构图1.2 所示)。此外,通过序列分析发现,在这些 ORFs 的上下游区域都存在有各类保守的启动子元件 TATA 盒子、CAGT 盒子和多聚的腺苷酸化信号序列[7, 10, 11]。BmBDV 是动物病毒中唯一的具有两个节段的单链 DNA 基因组结构且编码DNA 聚合酶的病毒[12],并且该病毒还具有不同于其相似病毒细小病毒基因组结构,复制模式也未可知。因此,研究 BmBDV 复制相关蛋白对研究该病毒的复制机制具有重要意义。

序列,同源蛋白,在线分析


家蚕二分浓核病毒 NS1 蛋白表达分析及其互作蛋白研究SKPSSLISNISSPST)。T45 是一个碱性的丝氨酸/苏氨酸激酶的磷酸化位点Baso-ST-kin,Basophilic serine/threonine kinase group),其保守氨基酸序列为QKSAKRLTISSLESG)。Y160 是一个络氨酸激酶磷酸化位点(Y-kin,Tyrosineinase group),其保守氨基酸序列为(SKFCEALYSIFTMSD)及 Y116 是一个SH2,Src homology 2 group)结构的酪氨酸位点,其保守氨基酸序列为INYQEYYYEEV NNRL)。SH2(Src 同源域 2)结构域是 Src 癌蛋白和许多他细胞内信号转导蛋白质中结构保守的蛋白质结构域[14, 15],SH2 结构域和含有些结构域的蛋白质与其他蛋白质上的磷酸化酪氨酸残基相互作用,有助于受体氨酸激酶途径的信号转导(如图 1.5)。总之,NS1 结构的多样性,保证了 NS1白功能的多样性(如图 1.6)。

【参考文献】:
期刊论文
[1]家蚕二分浓核病毒NS1蛋白的表达及定位[J]. 张清,张晓龙,李国辉,姚勤,胡朝阳.  生物技术. 2015(03)
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[3]细小病毒非结构蛋白NS1功能的研究进展[J]. 张俊红,李国辉,陈慧卿,黄国平,姚勤.  安徽农业科学. 2010(22)
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[5]家蚕病毒的特性和对蚕的侵染[J]. 杨大桢.  四川蚕业. 1987(03)
[6]家蚕作为模式生物在现代生物学中的应用[J]. 朱晓苏,宋艳,徐世清.  实验动物与比较医学. 2009 (01)

硕士论文
[1]家蚕二分浓核病毒NS1蛋白的表达及细胞毒性研究[D]. 徐五.江苏大学 2016
[2]家蚕丝氨酸蛋白酶BmSP142在抗病毒侵染中的作用[D]. 周倩.江苏大学 2016
[3]家蚕二分浓核病毒感染的家蚕连续病理变化研究[D]. 张晓龙.江苏大学 2016



本文编号:3300757

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