不同水稻品系对稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构的影响
发布时间：2021-08-18 23:04
稻纵卷叶螟（Cnaphaalocrocis medinalisGuenee）（Rice leaf folder,RLF）是一种世界范围内危害水稻、大麦、小麦、甘蔗等作物的重要害虫。肠道微生物在宿主的食物消化、生长发育、免疫以及代谢方面起着重要的作用,近年来新一代测序技术大大推动了肠道微生物的研究。为分析稻纵卷叶螟肠道微生物对宿主的功能,本文综合运用传统微生物培养技术、变性梯度凝胶电泳技术（DGGE）、16SrRNA基因测序技术以及宏基因组测序技术对稻纵卷叶螟肠道细菌多样性及其功能进行了分析,具体结果如下:一、取食甬优15品系稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构和功能采用传统微生物培养方法,共分离得到10种不同的细菌,其中变形菌门Proteobacteria和厚壁菌门Firmicutes所占比例分别为70%和30%,表明变形菌门为稻纵卷叶螟肠道可培养细菌中的优势菌群。采用DGGE方法,分离得到的变形菌门所占比例为77%,厚壁菌门所占比例为23%,在门的水平上肠道微生物的组成与传统微生物培养方法一致。利用16SrRNA基因测序技术分析稻纵卷叶螟肠道细菌组成,结果表明,稻纵卷叶螟肠道细菌主要由变形菌门...
【文章来源】：福建农林大学福建省
【文章页数】：104 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 前言
1.1 稻纵卷叶螟的生物学特征、危害及防治
1.2 昆虫肠道微生物的研究概况
1.3 昆虫肠道微生物的研究意义
1.4 昆虫肠道微生物的功能
1.4.1 肠道微生物消化食物与提供营养的功能
1.4.2 肠道微生物对昆虫的保护防御功能
1.4.3 肠道微生物与Bt抗性的关系
1.4.4 肠道微生物的其他功能
1.5 昆虫肠道微生物的研究方法
1.6 本研究的目的和意义
2 材料与方法
2.1 主要仪器及试剂配置
2.1.1 主要仪器
2.1.2 主要试剂
2.1.3 培养基配制
2.1.4 DGGE试剂配制
2.1.5 引物设计与合成
2.2 取食甬优15品系稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构和功能的研究
2.2.1 稻纵卷叶螟肠道细菌的分离与培养
2.2.2 稻纵卷叶螟肠道细菌的PCR-DGGE分析
2.2.3 稻纵卷叶螟肠道细菌16S rRNA基因V4高变区测序
2.2.4 稻纵卷叶螟肠道细菌宏基因组测序与分析
2.2.5 宏基因组测序分析稻纵卷叶螟肠道细菌的功能
2.3 取食不同品系水稻稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构差异的研究
2.3.1 供试虫源与食源
2.3.2 PCR-DGGE分析不同品系水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌的影响
2.3.3 16S rRNA基因测序分析不同品系水稻稻纵卷叶螟肠道细菌的影响
2.4 Bt水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构影响的研究
2.4.1 稻纵卷叶螟的饲养
2.4.2 16S rRNA基因测序分析转基因水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌的影响
3 结果与分析
3.1 取食甬优15品系稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构和功能的分析
3.1.1 传统微生物培养法分析稻纵卷叶螟肠道细菌多样性
3.1.2 稻纵卷叶螟肠道细菌DGGE分析
3.1.3 稻纵卷叶螟肠道细菌16S rRNA基因V4高变区测序分析
3.1.4 稻纵卷叶螟肠道细菌宏基因组分析
3.1.5 稻纵卷叶螟肠道细菌功能研究
3.2 不同品系水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构的影响
3.2.1 DGGE法分析不同品系水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构的影响
3.2.2 16S rRNA基因测序分析不同品系水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构的影响
3.3 转基因水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构的影响
3.3.1 基于门水平分析肠道细菌群落分布
3.3.2 基于纲水平分析肠道细菌群落分布
3.3.3 基于目水平分析肠道细菌群落分布
3.3.4 基于科水平分析肠道细菌群落分布
3.3.5 基于属水平分析肠道细菌群落分布
3.3.6 稻纵卷叶螟肠道细菌LEfSe分析
4 总结与讨论
4.1 取食甬优15品系稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构和功能的研究
4.2 不同品系水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构的影响
4.3 转基因水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构的影响
参考文献
附录1
附录2
附录3
致谢
本文编号：3350793
【文章来源】：福建农林大学福建省
【文章页数】：104 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 前言
1.1 稻纵卷叶螟的生物学特征、危害及防治
1.2 昆虫肠道微生物的研究概况
1.3 昆虫肠道微生物的研究意义
1.4 昆虫肠道微生物的功能
1.4.1 肠道微生物消化食物与提供营养的功能
1.4.2 肠道微生物对昆虫的保护防御功能
1.4.3 肠道微生物与Bt抗性的关系
1.4.4 肠道微生物的其他功能
1.5 昆虫肠道微生物的研究方法
1.6 本研究的目的和意义
2 材料与方法
2.1 主要仪器及试剂配置
2.1.1 主要仪器
2.1.2 主要试剂
2.1.3 培养基配制
2.1.4 DGGE试剂配制
2.1.5 引物设计与合成
2.2 取食甬优15品系稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构和功能的研究
2.2.1 稻纵卷叶螟肠道细菌的分离与培养
2.2.2 稻纵卷叶螟肠道细菌的PCR-DGGE分析
2.2.3 稻纵卷叶螟肠道细菌16S rRNA基因V4高变区测序
2.2.4 稻纵卷叶螟肠道细菌宏基因组测序与分析
2.2.5 宏基因组测序分析稻纵卷叶螟肠道细菌的功能
2.3 取食不同品系水稻稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构差异的研究
2.3.1 供试虫源与食源
2.3.2 PCR-DGGE分析不同品系水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌的影响
2.3.3 16S rRNA基因测序分析不同品系水稻稻纵卷叶螟肠道细菌的影响
2.4 Bt水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构影响的研究
2.4.1 稻纵卷叶螟的饲养
2.4.2 16S rRNA基因测序分析转基因水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌的影响
3 结果与分析
3.1 取食甬优15品系稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构和功能的分析
3.1.1 传统微生物培养法分析稻纵卷叶螟肠道细菌多样性
3.1.2 稻纵卷叶螟肠道细菌DGGE分析
3.1.3 稻纵卷叶螟肠道细菌16S rRNA基因V4高变区测序分析
3.1.4 稻纵卷叶螟肠道细菌宏基因组分析
3.1.5 稻纵卷叶螟肠道细菌功能研究
3.2 不同品系水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构的影响
3.2.1 DGGE法分析不同品系水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构的影响
3.2.2 16S rRNA基因测序分析不同品系水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构的影响
3.3 转基因水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构的影响
3.3.1 基于门水平分析肠道细菌群落分布
3.3.2 基于纲水平分析肠道细菌群落分布
3.3.3 基于目水平分析肠道细菌群落分布
3.3.4 基于科水平分析肠道细菌群落分布
3.3.5 基于属水平分析肠道细菌群落分布
3.3.6 稻纵卷叶螟肠道细菌LEfSe分析
4 总结与讨论
4.1 取食甬优15品系稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构和功能的研究
4.2 不同品系水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构的影响
4.3 转基因水稻对稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构的影响
参考文献
附录1
附录2
附录3
致谢
本文编号：3350793
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/dzwbhlw/3350793.html
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