甘蓝染色体片段替换系的构建和黑腐病抗性QTL定位及候选基因分析

发布时间：2021-09-24 01:25

　　结球甘蓝（Brassica oleracea var.capitata）是一种在世界范围内广泛种植的叶菜类蔬菜。近年来,由于复种指数的提高、不合理栽培方式与大量引种,黑腐病在我国甘蓝产区普遍发生且逐年加重,严重影响了甘蓝的品质和产量,造成巨大的经济损失。了解甘蓝黑腐病遗传机理、选育抗病品种是防治黑腐病最经济有效的办法。本研究以野生抗黑腐病甘蓝自交系R4-P1与感病骨干自交系R2-P2为杂交组合构建的重组自交系绘制了甘蓝遗传图谱;通过连续多代回交与自交策略,结合遗传图谱上均匀分布的分子标记进行辅助选择的方法构建了一套以R2-P2为背景、R4-P1为供体的甘蓝染色体片段替换系;利用构建的染色体片段替换系与绘制图谱所用的重组自交系,进行了甘蓝黑腐病抗性QTL定位,对主效定位区段内的9个候选基因进行测序比对与接病后不同时间段表达量与瞬时表达分析;并对甘蓝全基因组NBS-LRR类型抗病基因进行了鉴定与基因分析,为甘蓝抗黑腐病品种的分子选育提供帮助。主要研究结果如下:1.选用野生甘蓝高代纯合自交系R4-P1和结球甘蓝骨干自交系R2-P2构建的重组自交系,构建了一张包含303对SSR与In Del标... 

【文章来源】：甘肃农业大学甘肃省

【文章页数】：125 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图2-1双亲R4-P1与R2-P2形态特征

1 对 InDel）条带清晰单一、差异明显标记且重复性好的标记，标记 20.1%。高密度遗传图谱的构建09 对 RIL8 群体的多态性进行统计整理 (图 2-2)，整理数据导入 JoinMap择软件中的“Individual genot.freq.”命令，挑选出在这些标记中出现杂合基型）较多的株系，利用“individuals”命令中的“Exclude”按钮共删除 2 个单株锁分析时，以 α=0.05 水平上的 LOD 值作为阈值 (LOD 阈值=5.0)，在 LO，共有 303 个 SSR 标记进入 9 个连锁群 (LG1-LG9)，各连锁群的重组频有连锁群上的所有 LOD 得分均>0.6。最终得到的连锁群数与染色体[B.ole8，CC)]数目一致，连锁率为 98.15%，其余 6 个标记由于结果统计不准确重与偏分离等原因未进入 9 条连锁群。群的染色体定位与标记分布

L-Finder (0.9a14) (http://mapdisto.free.fr/CSSLFinder/) 程序谱上，从 C1-C9 依次选择出均匀分布于甘蓝 9 条染色体上的片段替换系的构建，并根据各标记的位置以及各标记间的图软件绘制替换系构建所用分子标记遗传图谱。计与技术路线体片段替换系的构建流程如图 3-1 所示，具体流程如下： R4-P1 和 R2-P2 杂交产生 F1代，随后以 R2-P2 为轮回亲本C2F1代材料。从 BC2F1开始进行，于 2015 年利用从各图谱上选择的分系共计 126 个单株进行全基因组分子标记跟踪和人工选择F1世代中选择最佳单株分别进行回交与自交，最佳单株选择 的染色体替换片段数尽可能少，受体 R2-P2 的遗传背景回全基因组的覆盖率要尽可能的高，对BC3F1单株没有覆盖到


本文编号：3406818