果生炭疽菌效应蛋白CfCE92功能及互作靶标筛选

发布时间:2021-10-22 13:09
  果生炭疽菌严重危害多种经济作物。引起金冠系苹果品种炭疽叶枯病(GLS),造成早期落叶和果实斑点,严重影响苹果产量和品质。已知炭疽菌效应蛋白可以通过影响寄主免疫反应促进寄主感病,为炭疽菌重要致病因子。但目前对果生炭疽菌致病机理目前了解很少。实验室前期从果生炭疽菌筛选鉴定出一个效应蛋白Cf CE92,本研究拟对其致病中的功能进行系统研究,取得以下主要结果:1. 用果生炭疽菌野生型和ΔCf CE92突变体分别接种嘎啦叶片,24 h后提取RNA,进行转录组测序、基因预测与注释,共获得52.41G数据,注释45116个基因。差异分析获得突变体和野生型2370个差异表达基因,其中显著上调310个基因。通过Pathway富集分析可以看出,在乙醛酸和二羧酸代谢途径、黄酮生物合成途径、半乳糖代谢途径、氨基糖和核苷酸糖代谢、甘油脂代谢和MAPK信号转导等6个通路显著富集。2. MAPK信号通路在生物体内能够介导细胞的生长发育及分裂分化等多种生理变化,并参与病理过程。在MAPK信号通路中富集到了7个基因,包括2个脱落酸受体、PR1a、PR3、丝氨酸苏氨酸蛋白激酶、类乙烯反应转录因子和WRKY29。对PR1a... 

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【学位级别】:硕士

【部分图文】:

果生炭疽菌效应蛋白CfCE92功能及互作靶标筛选


对接种C.fructicola及突变体ΔCfCE92菌株苹果叶片转录组的相关性矩阵图

突变体,苹果,富集,基因


西北农林科技大学硕士学位论文22通过转录组数据分析,鉴定到310个在果生炭疽菌ΔCfCE92突变体接种叶片中显著上调表达基因。KEGGPathway富集获得六个显著差异有关途径:乙醛酸和二羧酸代谢途径、黄酮生物合成途径、半乳糖代谢途径、氨基酸和核苷酸代谢途径、甘油脂代谢途径、MAPK信号通路途径(图3-2),共包含32个基因(表3-1)。图3-2差异表达基因在接种ΔCfCE92突变体菌株的苹果叶片中有显著的通路富集(p<0.05)Figure3-2ThebubblediagramshowsthatthesignificantpathwayenrichmentofdifferentiallyexpressedgenesintheappleleavesinoculatedwithΔCfCE92strain(P<0.05)

基因,内参,菌株,叶片


西北农林科技大学硕士学位论文24WRKY29和胼胝质合成酶。挑选出部分与植物防御相关的基因PR1a,PR3,PR5,PR10a,MAPK3,WRKY29,Callosesynthase2-like进行qRT-PCR检测,结果如图3-3所示:差异表达最明显的为PR3基因,突变体ΔCfCE92比野生型C.fructicola上调15倍;PR1a基因突变体比野生型上调6倍。其余PR5,PR10a,MAPK3,WRKY29,Callosesynthase2-like基因差异表达相似,突变体比野生型上调为:2,2.5,1.6,2.25,2倍。qRT-PCR证实突变体比野生型这些防御相关基因普遍上调表达,表明CfCE92通过抑制病程相关PR基因、MAPK3、WRKY29和胼胝质合成酶等表达,进而侵染植物,使得植物感玻图3-3对接种ΔCfCE92和WT菌株24小时后的叶片提取总RNA,对7个防御相关基因进行qRT-PCR分析,以MdUBQ为内参基因。Figure3-3ThetotalRNAwasextractedfromtheleavesinoculatedwithΔCfCE92andWTstrainsat24hpirespectivelyandsubjectedtoqRT-PCRanalysisofsevendefense-relatedgenes.MdUBQwasusedasreferencegene.3.1.3CfCE92影响类黄酮合成途径

【参考文献】:
期刊论文
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[9]植物病原效应蛋白功能研究方法[J]. 何燕华.  现代农业科技. 2014(04)
[10]苹果炭疽叶枯病的发生与防治[J]. 王晓娥.  农业科技通讯. 2014(03)

博士论文
[1]甘蔗应答黑穗病菌侵染的转录组与蛋白组研究及抗性相关基因挖掘[D]. 苏亚春.福建农林大学 2014



本文编号:3451161

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