茶足柄瘤蚜茧蜂滞育分子机制的研究
发布时间：2021-11-17 08:02
茶足柄瘤蚜茧蜂可寄生棉蚜、豆蚜、玉米蚜、高粱蚜以及菜豆和木槿上的蚜虫。昆虫可以通过进入滞育状态来度过不良环境,从而使个体在不利条件下仍能继续存活,还可以保持种群发育整齐,使交配率得以提高,以确保种群的繁衍。所以此特性在生产中可以得到广泛应用。本研究通过对滞育（Diapause,D）与非滞育（Non-Diapause,ND）的茶足柄瘤蚜茧蜂蛹进行转录组测序,目的是筛选出与滞育相关的差异表达基因,并分析其对滞育可能起到的作用,来丰富滞育的转录组学理论研究;对滞育与非滞育的茶足柄瘤蚜茧蜂蛹蛋白组的研究是通过应用iTRAQ技术,筛选出与滞育相关的蛋白并进行功能分析,从蛋白层面揭示滞育的分子机制;利用LC-MS（liquid chromatograph-mass spectrometer）技术对滞育组与非滞育组茶足柄瘤蚜茧蜂蛹进行代谢组检测,寻找影响茶足柄瘤蚜茧蜂蛹滞育的生物标志物,从代谢角度来分析滞育的分子水平调控。主要结果如下:1.差异表达基因分析结果ND.VS.D,有19,201个上调差异表达基因,19,141个下调差异基因;共25,666个差异基因被注释到GO数据库,涉及到的代谢过程有脂...
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：106 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
Unigenes长度分布
中国农业科学院硕士学位论文第二章茶足柄瘤蚜茧蜂蛹滞育相关的转录组学研究112.3.2基因功能注释基因在Nr，Nt，Pfam，KOG/COG，Swiss-prot，KEGG，GO七个数据库完成了功能注释，目的是获得更全面的功能信息。图2-2展示了此次获取的177,142个unigenes在上述数据库中注释的成功率。图2-2基因在各数据库注释成功概率统计Fig.2-2Statisticsofsuccessprobabilityofgeneannotationineachdatabase2.3.2.1Nr注释结果根据Nr库比对注释的结果，统计并绘制出比对上的物种分布图、比对的e-value分布图以及序列相似度分布图。在种间分布上，比对上的物种有Trichomalopsissarcophag（6.0%）、胡蜂Diachasmaalloeum（6.3%）、多胚跳小蜂Copidosomafloridanum（8.0%）、丽蝇蛹集金小蜂Nasoniavitripennis（9.1%）和络新妇蛛Nephilaclavipes（16.0%）以及一些未命名的其他种others（图2-3：A）。在e-value分布中,e值为0~1e-100占比最大，为22.5%，e值为0所占比例最小，为5.2%（图2-33：B）。在相似性分布中，相似性60~80%所占比例最高，为40.3%，相似性18~40%占比最少，为0.3%（图2-3：C）。AB
中国农业科学院硕士学位论文第二章茶足柄瘤蚜茧蜂蛹滞育相关的转录组学研究12C图2-3UnigenesNr注释的物种分布、e-value和相似性统计Fig.2-3Statisticsofspeciesdistribution,E-valueandsimilarityfromtheNrannotationresultsofunigenes2.3.2.2KOG注释KOG数据库将功能分为26组，将基因与数据库比对，注释成功的基因按数据库的26个组分类，一般功能预测（R:generalfunctionpredictiononly，5460个）是unigenes注释数量最多的组别，其次是蛋白质转换和伴侣蛋白（O:posttranslationalmodification,proteinturnover,chaperones,3,920个）和信号传导机理(T:signaltransductionmechanisms,3,899个)，结果见图2-4。图2-4Unigenes在KOG中的分类统计Fig.2-4StatisticsoftheunigenesinKOGclassification
【参考文献】：
期刊论文
[1]浅谈氨基酸对乌骨鸡黑色素沉积的影响[J]. 郑娟霞,陈文宁,杨莉,月金玲,王琤韡. 江西饲料. 2019(06)
[2]基于iTRAQ的定量蛋白质组学技术探索淡色库蚊越冬机制[J]. 张倩,石桂红,郭秀霞,王海防,张杰,张崇星. 中国血吸虫病防治杂志. 2019(02)
[3]近十年全球小型寄生蜂滞育研究的新进展[J]. 张洪志,高飞,刘梦姚,王曼姿,韩艳华,孔琳,陈红印,刘晨曦,王孟卿,张礼生. 环境昆虫学报. 2018(01)
[4]烟蚜茧蜂滞育关联基因的转录组学分析[J]. 安涛,张洪志,韩艳华,陈红印,张礼生. 中国生物防治学报. 2017(05)
[5]胍丁胺对大鼠应激性体温升高的抑制作用[J]. 熊资,杨永录,胥建辉,卜舒,罗蓉,陈冰. 中国应用生理学杂志. 2016(03)
[6]支链脂肪酸酯[J]. 陈贤为,徐枢枢,赵越超,缪明永,石汉平. 肿瘤代谢与营养电子杂志. 2015(04)
[7]烟蚜茧蜂脂代谢相关的滞育相关蛋白差异表达分析[J]. 黄凤霞,蒋莎,任小云,安涛,陈红印,张礼生. 中国生物防治学报. 2015(06)
[8]意大利蝗越冬卵游离氨基酸变化研究[J]. 葛婧,任金龙,赵莉. 新疆农业科学. 2014(10)
[9]苹果酸脱氢酶与异柠檬酸脱氢酶在滞育七星瓢虫中的差异表达[J]. 刘遥,张礼生,陈红印,黄凤霞,蒋莎,任小云. 中国生物防治学报. 2014(05)
[10]高通量转录组测序技术及其在鳞翅目昆虫上的应用[J]. 杨帆,黄立华,张爱兵. 昆虫学报. 2014(08)
博士论文
[1]大猿叶虫滞育准备期滞育相关蛋白和基因的鉴定及功能分析[D]. 谈倩倩.华中农业大学 2016
硕士论文
[1]茶足柄瘤蚜茧蜂的人工繁育及滞育特性研究[D]. 孙程鹏.内蒙古农业大学 2018
[2]伞裙追寄蝇滞育相关蛋白的差异表达[D]. 姜珊.甘肃农业大学 2018
[3]七星瓢虫雌成虫滞育相关蛋白差异表达的研究[D]. 刘遥.中国农业科学院 2014
[4]棉铃虫滞育和非滞育蛹免疫差异研究[D]. 李欣欣.华中农业大学 2013
[5]茶足柄瘤蚜茧蜂扩繁技术的基础性研究[D]. 黄海广.内蒙古农业大学 2012
[6]核糖体蛋白L13与癌基因MDM2介导的p53之间关系及其生物学功能的研究[D]. 徐晓红.华东师范大学 2011
本文编号：3500493
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：106 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
Unigenes长度分布
中国农业科学院硕士学位论文第二章茶足柄瘤蚜茧蜂蛹滞育相关的转录组学研究112.3.2基因功能注释基因在Nr，Nt，Pfam，KOG/COG，Swiss-prot，KEGG，GO七个数据库完成了功能注释，目的是获得更全面的功能信息。图2-2展示了此次获取的177,142个unigenes在上述数据库中注释的成功率。图2-2基因在各数据库注释成功概率统计Fig.2-2Statisticsofsuccessprobabilityofgeneannotationineachdatabase2.3.2.1Nr注释结果根据Nr库比对注释的结果，统计并绘制出比对上的物种分布图、比对的e-value分布图以及序列相似度分布图。在种间分布上，比对上的物种有Trichomalopsissarcophag（6.0%）、胡蜂Diachasmaalloeum（6.3%）、多胚跳小蜂Copidosomafloridanum（8.0%）、丽蝇蛹集金小蜂Nasoniavitripennis（9.1%）和络新妇蛛Nephilaclavipes（16.0%）以及一些未命名的其他种others（图2-3：A）。在e-value分布中,e值为0~1e-100占比最大，为22.5%，e值为0所占比例最小，为5.2%（图2-33：B）。在相似性分布中，相似性60~80%所占比例最高，为40.3%，相似性18~40%占比最少，为0.3%（图2-3：C）。AB
中国农业科学院硕士学位论文第二章茶足柄瘤蚜茧蜂蛹滞育相关的转录组学研究12C图2-3UnigenesNr注释的物种分布、e-value和相似性统计Fig.2-3Statisticsofspeciesdistribution,E-valueandsimilarityfromtheNrannotationresultsofunigenes2.3.2.2KOG注释KOG数据库将功能分为26组，将基因与数据库比对，注释成功的基因按数据库的26个组分类，一般功能预测（R:generalfunctionpredictiononly，5460个）是unigenes注释数量最多的组别，其次是蛋白质转换和伴侣蛋白（O:posttranslationalmodification,proteinturnover,chaperones,3,920个）和信号传导机理(T:signaltransductionmechanisms,3,899个)，结果见图2-4。图2-4Unigenes在KOG中的分类统计Fig.2-4StatisticsoftheunigenesinKOGclassification
【参考文献】：
期刊论文
[1]浅谈氨基酸对乌骨鸡黑色素沉积的影响[J]. 郑娟霞,陈文宁,杨莉,月金玲,王琤韡. 江西饲料. 2019(06)
[2]基于iTRAQ的定量蛋白质组学技术探索淡色库蚊越冬机制[J]. 张倩,石桂红,郭秀霞,王海防,张杰,张崇星. 中国血吸虫病防治杂志. 2019(02)
[3]近十年全球小型寄生蜂滞育研究的新进展[J]. 张洪志,高飞,刘梦姚,王曼姿,韩艳华,孔琳,陈红印,刘晨曦,王孟卿,张礼生. 环境昆虫学报. 2018(01)
[4]烟蚜茧蜂滞育关联基因的转录组学分析[J]. 安涛,张洪志,韩艳华,陈红印,张礼生. 中国生物防治学报. 2017(05)
[5]胍丁胺对大鼠应激性体温升高的抑制作用[J]. 熊资,杨永录,胥建辉,卜舒,罗蓉,陈冰. 中国应用生理学杂志. 2016(03)
[6]支链脂肪酸酯[J]. 陈贤为,徐枢枢,赵越超,缪明永,石汉平. 肿瘤代谢与营养电子杂志. 2015(04)
[7]烟蚜茧蜂脂代谢相关的滞育相关蛋白差异表达分析[J]. 黄凤霞,蒋莎,任小云,安涛,陈红印,张礼生. 中国生物防治学报. 2015(06)
[8]意大利蝗越冬卵游离氨基酸变化研究[J]. 葛婧,任金龙,赵莉. 新疆农业科学. 2014(10)
[9]苹果酸脱氢酶与异柠檬酸脱氢酶在滞育七星瓢虫中的差异表达[J]. 刘遥,张礼生,陈红印,黄凤霞,蒋莎,任小云. 中国生物防治学报. 2014(05)
[10]高通量转录组测序技术及其在鳞翅目昆虫上的应用[J]. 杨帆,黄立华,张爱兵. 昆虫学报. 2014(08)
博士论文
[1]大猿叶虫滞育准备期滞育相关蛋白和基因的鉴定及功能分析[D]. 谈倩倩.华中农业大学 2016
硕士论文
[1]茶足柄瘤蚜茧蜂的人工繁育及滞育特性研究[D]. 孙程鹏.内蒙古农业大学 2018
[2]伞裙追寄蝇滞育相关蛋白的差异表达[D]. 姜珊.甘肃农业大学 2018
[3]七星瓢虫雌成虫滞育相关蛋白差异表达的研究[D]. 刘遥.中国农业科学院 2014
[4]棉铃虫滞育和非滞育蛹免疫差异研究[D]. 李欣欣.华中农业大学 2013
[5]茶足柄瘤蚜茧蜂扩繁技术的基础性研究[D]. 黄海广.内蒙古农业大学 2012
[6]核糖体蛋白L13与癌基因MDM2介导的p53之间关系及其生物学功能的研究[D]. 徐晓红.华东师范大学 2011
本文编号：3500493
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/dzwbhlw/3500493.html
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