水稻抗白叶枯病基因Xa23启动子变异及功能标记

发布时间：2021-11-24 18:31

　　Xa23是广谱强效的水稻抗白叶枯病显性基因,其与等位感病基因xa23功能差异在于启动子上的被水稻白叶枯病菌无毒效应因子avrXa23能识别激活28 bp核心序列（EBEavr Xa23）,开发其功能标记能够加快水稻育种进程。本研究检测43份国外野生稻、7份代表性常规稻的Xa23启动子,利用生物信息软件Vector NTI对启动子上游200 bp序列进行分析。结果表明,只有9份普通野生稻,2份常规稻能扩增出启动子上游约200 bp序列,检出率只有22.0%,说明Xa23不广泛存在于水稻中;进一步的序列分析显示,EBEavr Xa23序列存在丰富的变异,其等位序列至少存在7种单倍型,但EBEavr Xa23只存在水稻CBB23中。最后,依据EBEavr Xa23序列开发了Xa23显性功能标记,经验证该标记能明确区分水稻是否携Xa23基因。本研究将有助于进一步研究Xa23进化机制及分子标记辅助选择育种。 

【文章来源】：分子植物育种. 2020,18(21)北大核心CSCD

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

Xa23启动子扩增

Xa23启动子序列比较分析

本研究材料采用携抗病Xa23基因的水稻CB-B23 (Xa23)及携感病等位xa23的水稻JG30 (xa23)外，用于Xa23启动子测序扩增的还有31个国外普通野生稻、12个国内普通野生稻(以采集地命名)及7个常见水稻品种‘IR24’、‘日本晴’、‘9311’、‘台北309 (TP309)’及携单一抗白叶枯病基因材料IRBB21(Xa21)、IRBB27 (Xa27)、IRBB5 (xa5)(表1)。3.2 Xa23启动子PCR扩增

【参考文献】：
期刊论文
[1]近30年来我国水稻主要品种更新换代历程浅析[J]. 曾波.  作物杂志. 2018(03)
[2]水稻抗白叶枯病基因Xa23的EST标记及其在分子育种上的利用[J]. 王春连,戚华雄,潘海军,李进波,樊颖伦,章琦,赵开军.  中国农业科学. 2005(10)
[3]水稻抗白叶枯病基因Xa23的PCR分子标记定位及辅助选择[J]. 潘海军,王春连,赵开军,章琦,樊颖伦,周少川,朱立煌.  作物学报. 2003(04)
[4]携有抗白叶枯病新基因Xa23水稻近等基因系的构建及应用（英文）[J]. 章琦,王春连,赵开军,杨文才,乔枫,周永力,江祺祥,刘古春.  中国水稻科学. 2002(03)
[5]普通野生稻的抗水稻白叶枯病（Xanthomonas oryzaepv.oryzae）新基因Xa-23（t）的鉴定和分子标记定位[J]. 章琦,赵炳宇,赵开军,王春连,杨文才,林世成,阙更生,周永力,李道远,陈成斌,朱立煌.  作物学报. 2000(05)
[6]水稻白叶枯病抗性基因的研究与分子育种[J]. 翟文学,朱立煌.  生物工程进展. 1999(06)

博士论文
[1]水稻抗白叶枯病基因Xa23的进化机制及XA23与HR功能相关的重要氨基酸的分析[D]. 崔华.中国农业科学院 2018



本文编号：3516534