苹果树腐烂病菌VmSom1、VM1G 0 6657、VM1G 0 7354和VM1G 1 1970基因的功能分析
发布时间：2021-12-31 22:44
苹果树腐烂病（Valsa canker of apple）是由苹果黑腐皮壳菌（Valsa mali）引起的重要枝干病害,危害严重,已经成为苹果产业发展的严重障碍,明确病菌生长发育及其致病机制对于有效防控病害十分重要和必要。Som1是作用于调控病原真菌生长发育、形态分化和致病力的环化腺苷酸信号途径（c AMP/PKA）的一个重要转录因子,前期通过对Vm Som1缺失突变体（ΔVm Som1）和野生型菌株转录组分析,发现了3个显著差异表达基因VM1G06657、VM1G07354、VM1G11970,但对其功能知之甚少。本研究以Vm Som1和上述三个差异表达基因为出发点,通过生物信息学分析获得了这四个基因的详细信息、结构域和系统进化关系。通过对四个基因进行敲除、回复和检测,获得了正确敲除和回复突变体。本研究重在对四个腐烂病菌基因敲除突变株、回复菌株与野生菌株在生长发育、胁迫耐受、致病力方面进行了研究,并探究了Vm Som1的缺失对其他三个基因表达的影响。研究结果如下:1.生物信息学分析表明Vm Som1（KUI74346....
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：71 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
敲除突变体PCR验证示意图
因的确定和分析获得及详细信息因通过 Blast 比对，如图 2 所示。VmSom1 基因大小为 2723，位于 12 号染色体 69225 bp-71947 bp，编码 824 个氨基酸，子。VM1G_11970 基因大小为 502 bp，登录号为 KUI74531.1 bp-56647 bp，编码 128 个氨基酸，包含 1 个内含子 2 个外显子 1050 bp，登录号为 KUI71651.1，位于 7 号染色体 209859 bp基酸，无内含子。VM1G_07354 基因大小为 2120 bp，登录号为染色体 2748276 bp-2750395 bp，编码 531 个氨基酸，包含 3 个
图 3 苹果树腐烂病菌 VmSom1 蛋白的 NJ 系统进化分析Fig. 3 NJ Phylogenetic analysis of VmSom1 protein from V.mali通过与其他真菌的同源性分析显示，VM1G_06657 与 Valsa mali var. pyri 中的Myb-like DNA-binding protein myb-1（KUI58850.1）的同源性为 98.28%，与 Valsa malicola中的 hypothetical protein VMCG_02812（ROW09038.1）的同源性为 86.82%，与 V. sordida中的 hypothetical protein VSDG_09916（ROV87513.1）的同源性为 91.52%，与C.leucostoma 中的 hypothetical protein VPNG_02297（ROW15519.1）的同源性为 74.52%，与 D. ampelina 中的 putative trichome differentiation protein gl1（KKY29649.1）的同源性为 45.62%，与 Diaporthe helianthi 中的 regulator of conidiation（POS72487.1）的同源性为 44.23%，与 Coniella lustricola 中的 hypothetical protein BD289DRAFT_442914（PSR79103.1 ）的同源性为 36.80%，与 Monosporascus sp. mg162 中的 hypotheticalprotein DL768_005565（RYP48566.1）的同源性为 38.28%，与 Monosporascus sp. MG133中的 hypothetical protein DL767_010459（RYP13989.1）的同源性为 36.68%，与
【参考文献】：
期刊论文
[1]苹果树腐烂病菌根皮苷水解酶基因Vmlph1的功能[J]. 朱百涛,尹志远,吴玉星,高小宁,冯浩,韩青梅,黄丽丽. 西北农业学报. 2018(04)
[2]苹果腐烂病菌VmHMG基因敲除突变体获得及表型分析[J]. 贾晓曼,王怡霖,孙庚午,何邦令,葛顺峰,王玉涛,刘会香. 核农学报. 2018(03)
[3]苹果树腐烂病研究分析[J]. 周岩. 现代农业. 2017(06)
[4]苹果树腐烂病菌细胞色素P450基因Vmcyp5的功能[J]. 高明煜,吴玉星,朱百涛,高小宁,冯浩,黄丽丽. 微生物学报. 2018(02)
[5]苹果树腐烂病菌果胶裂解酶基因Vmpl4的致病功能研究[J]. 许春景,孙迎超,吴玉星,冯浩,高小宁,黄丽丽. 果树学报. 2017(01)
[6]提升产业价值链 打造中国“苹果梦”[J]. 王旭芳. 中国农村科技. 2016(08)
[7]苹果树腐烂病菌胞外果胶酶分离纯化及其性质[J]. 冯浩,何媛媛,甄伟,高小宁,王惠,黄丽丽. 微生物学通报. 2017(03)
[8]中国苹果病害发生与分布现状调查[J]. 胡清玉,胡同乐,王亚南,王树桐,曹克强. 植物保护. 2016(01)
[9]苹果树腐烂病菌非核糖体多肽合成酶基因VmNRPS12的功能[J]. 马晨琛,李正鹏,戴青青,韩青梅,黄丽丽. 微生物学报. 2016(08)
[10]近50年我国苹果树腐烂病发生情况分析[J]. 赵绪生,齐永志,王亚南,甄文超,曹克强. 贵州农业科学. 2014(11)
博士论文
[1]稻瘟病菌麦角甾醇生物合成途径和cAMP-PKA信号途径致病相关新基因功能研究[D]. 闫霞.浙江大学 2012
[2]稻瘟病菌G蛋白及MAPK信号途径相关基因的功能分析[D]. 张海峰.南京农业大学 2011
硕士论文
[1]苹果树腐烂病菌4个多聚半乳糖醛酸酶基因功能的初步研究[D]. 宋娜.西北农林科技大学 2014
[2]苹果树腐烂病菌2个己糖激酶基因功能的初步研究[D]. 戴青青.西北农林科技大学 2014
[3]苹果树腐烂病菌内切多聚半乳糖醛酸酶基因的功能研究[D]. 许利军.西北农林科技大学 2014
[4]青霉素对苹果树及腐烂病中根皮苷影响的研究[D]. 王娟.内蒙古农业大学 2009
本文编号：3561120
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：71 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
敲除突变体PCR验证示意图
因的确定和分析获得及详细信息因通过 Blast 比对，如图 2 所示。VmSom1 基因大小为 2723，位于 12 号染色体 69225 bp-71947 bp，编码 824 个氨基酸，子。VM1G_11970 基因大小为 502 bp，登录号为 KUI74531.1 bp-56647 bp，编码 128 个氨基酸，包含 1 个内含子 2 个外显子 1050 bp，登录号为 KUI71651.1，位于 7 号染色体 209859 bp基酸，无内含子。VM1G_07354 基因大小为 2120 bp，登录号为染色体 2748276 bp-2750395 bp，编码 531 个氨基酸，包含 3 个
图 3 苹果树腐烂病菌 VmSom1 蛋白的 NJ 系统进化分析Fig. 3 NJ Phylogenetic analysis of VmSom1 protein from V.mali通过与其他真菌的同源性分析显示，VM1G_06657 与 Valsa mali var. pyri 中的Myb-like DNA-binding protein myb-1（KUI58850.1）的同源性为 98.28%，与 Valsa malicola中的 hypothetical protein VMCG_02812（ROW09038.1）的同源性为 86.82%，与 V. sordida中的 hypothetical protein VSDG_09916（ROV87513.1）的同源性为 91.52%，与C.leucostoma 中的 hypothetical protein VPNG_02297（ROW15519.1）的同源性为 74.52%，与 D. ampelina 中的 putative trichome differentiation protein gl1（KKY29649.1）的同源性为 45.62%，与 Diaporthe helianthi 中的 regulator of conidiation（POS72487.1）的同源性为 44.23%，与 Coniella lustricola 中的 hypothetical protein BD289DRAFT_442914（PSR79103.1 ）的同源性为 36.80%，与 Monosporascus sp. mg162 中的 hypotheticalprotein DL768_005565（RYP48566.1）的同源性为 38.28%，与 Monosporascus sp. MG133中的 hypothetical protein DL767_010459（RYP13989.1）的同源性为 36.68%，与
【参考文献】：
期刊论文
[1]苹果树腐烂病菌根皮苷水解酶基因Vmlph1的功能[J]. 朱百涛,尹志远,吴玉星,高小宁,冯浩,韩青梅,黄丽丽. 西北农业学报. 2018(04)
[2]苹果腐烂病菌VmHMG基因敲除突变体获得及表型分析[J]. 贾晓曼,王怡霖,孙庚午,何邦令,葛顺峰,王玉涛,刘会香. 核农学报. 2018(03)
[3]苹果树腐烂病研究分析[J]. 周岩. 现代农业. 2017(06)
[4]苹果树腐烂病菌细胞色素P450基因Vmcyp5的功能[J]. 高明煜,吴玉星,朱百涛,高小宁,冯浩,黄丽丽. 微生物学报. 2018(02)
[5]苹果树腐烂病菌果胶裂解酶基因Vmpl4的致病功能研究[J]. 许春景,孙迎超,吴玉星,冯浩,高小宁,黄丽丽. 果树学报. 2017(01)
[6]提升产业价值链 打造中国“苹果梦”[J]. 王旭芳. 中国农村科技. 2016(08)
[7]苹果树腐烂病菌胞外果胶酶分离纯化及其性质[J]. 冯浩,何媛媛,甄伟,高小宁,王惠,黄丽丽. 微生物学通报. 2017(03)
[8]中国苹果病害发生与分布现状调查[J]. 胡清玉,胡同乐,王亚南,王树桐,曹克强. 植物保护. 2016(01)
[9]苹果树腐烂病菌非核糖体多肽合成酶基因VmNRPS12的功能[J]. 马晨琛,李正鹏,戴青青,韩青梅,黄丽丽. 微生物学报. 2016(08)
[10]近50年我国苹果树腐烂病发生情况分析[J]. 赵绪生,齐永志,王亚南,甄文超,曹克强. 贵州农业科学. 2014(11)
博士论文
[1]稻瘟病菌麦角甾醇生物合成途径和cAMP-PKA信号途径致病相关新基因功能研究[D]. 闫霞.浙江大学 2012
[2]稻瘟病菌G蛋白及MAPK信号途径相关基因的功能分析[D]. 张海峰.南京农业大学 2011
硕士论文
[1]苹果树腐烂病菌4个多聚半乳糖醛酸酶基因功能的初步研究[D]. 宋娜.西北农林科技大学 2014
[2]苹果树腐烂病菌2个己糖激酶基因功能的初步研究[D]. 戴青青.西北农林科技大学 2014
[3]苹果树腐烂病菌内切多聚半乳糖醛酸酶基因的功能研究[D]. 许利军.西北农林科技大学 2014
[4]青霉素对苹果树及腐烂病中根皮苷影响的研究[D]. 王娟.内蒙古农业大学 2009
本文编号：3561120
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