利用转录组测序技术对罗伯茨绿僵菌可变剪接事件的研究

发布时间：2022-01-06 01:06

　　昆虫病原真菌是指某些类群即能够在寄主正常的生理条件下直接侵入其体内、增长繁殖并很快引起死亡。该菌的生活方式多样,以腐生、寄生、根际定植为主。目前,在这类真菌中以研究白僵菌和绿僵菌较为常见。绿僵菌具有容易培养及广泛的昆虫宿主特性,现已普遍应用于蝗虫、柑桔吉丁虫等生物防治中。可变剪接作为调节基因表达和产生蛋白质组多样性的重要机制,能够使某些单个基因产生多个mRNA变体,是导致真核生物基因和蛋白质较大差异的重要原因。尽管可变剪接在高等生物中研究较为广泛,但在昆虫病原真菌中的研究较为缺乏。作为重要虫生真菌中的一员,罗伯茨绿僵菌转录组方面的可变剪接研究甚少。为了进一步了解可变剪接对不同生活环境下罗伯茨绿僵菌的影响,我们从多种培养条件入手,以获得较为全面的转录组测序数据,最终从转录组水平挖掘可变剪接的具体数据。本项目以罗伯茨绿僵菌为研究对象,在各种不同环境下培养,包括生长发育、退化、逆境胁迫、侵染定殖,提取不同阶段所要孢子或者菌丝的RNA,以等浓度同体积混合成样,然后进行RNA-seq测序,得出其可变剪接数据。其次,通过统计学及生物信息学等多重方法分析可变剪接基因的表达差异。最后,通过RT-PCR... 

【文章来源】：安徽农业大学安徽省

【文章页数】：66 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图0-1应用EST数据分析可变剪接事件[33]

图0-2可变剪接的类型[37]

图 1-1 转录组测序的实验步骤Figure 1-1 Transcriptome resequencing experimental process I 降解样品总 RNA 中的所有 DNA 杂质后，真核生物 mRNA。打断 mRNA 链之后，以此为模板合成一链 cDNA 并进行 的文库用 Agilent 2100 Bioanalyzer 和 ABI StepOnePlus Real

【参考文献】：
期刊论文
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[3]2种米曲霉发酵酱油风味物质比较[J]. 赵国忠,姚云平,曹小红,陈卫.  食品科学. 2014(24)
[4]我国草原蝗虫发生与防治现状分析[J]. 洪军,杜桂林,王广君.  草地学报. 2014(05)
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[9]转录组研究新技术:RNA-Seq及其应用[J]. 祁云霞,刘永斌,荣威恒.  遗传. 2011(11)
[10]草地蝗虫防治的经济阈值与生态阈值研究进展[J]. 刘艳,张泽华,王广军.  草业科学. 2011(02)

博士论文
[1]球孢白僵菌定量蛋白质组学与赖氨酸乙酰化蛋白质组学的构建、分析及验证[D]. 王志康.浙江大学 2016
[2]昆虫病原真菌降解寄主体壁酶基因的克隆及球孢白僵菌高毒力重组菌株的获得[D]. 方卫国.西南农业大学 2003

硕士论文
[1]几种虫生菌、食用菌和植物病原真菌代谢组差异比较研究[D]. 李康乐.安徽农业大学 2012



本文编号：3571407