棉花黄萎病菌株间病毒种类差异及生物防治潜力分析

发布时间：2022-01-14 15:52

　　棉花黄萎病（Verticillium wilt）是典型的土传、维管束真菌病害,但该病害防治难度大,故又被称为棉花上的“癌症”。防治棉花黄萎病的方法主要有选育抗病品种、化学防治、农业防治和生物防治等措施,而利用生物防治方法防治棉花黄萎病越来越受到人们的关注。弱毒相关真菌病毒的发现和应用为生物防治提供了有益补充,利用真菌病毒治疗板栗疫病和油菜菌核病取得了成功。因此,从棉花黄萎病菌中筛选可引起致病力衰退的相关病毒,可望为棉花黄萎病的生物防治提供新的病毒资源。发现大丽轮枝菌强毒力菌株和低毒力菌株间携带病毒的种类存在明显差异。本研究以10株强致病力和弱致病力的单孢后代菌株为研究材料,在明确菌株致病力的基础上,分别进行高通量宏病毒组测序,结果表明棉花黄萎病菌中携带丰富的病毒种类,多数为未曾报道或分类地位不明确的病毒。10株弱致病力菌株中总共携带42种病毒,按核酸类型可分为正单链RNA病毒、负单链RNA病毒、双链RNA病毒及尚未进行分类的病毒;其中单链RNA病毒占52%,dsRNA病毒占19%,未分类的病毒占29%。强致病力菌株中总共携带1种病毒,为负单链RNA病毒。通过两种不同致病力菌株所含病毒类... 

【文章来源】：中国农业科学院北京市

【文章页数】：62 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

菌株的生长培养性状（12天，25℃）

中国农业科学院硕士学位论文第二章棉花黄萎病菌中病毒多样性17图2-4菌株总RNA琼脂糖凝胶电泳检测Fig.2-4DetectionoftotalRNAofstrainsbyagarosegelelectrophoresis注：左图为强致病力菌株总RNA；右图为弱致病力菌株总RNANote:ThepictureontheleftshowsthetotalRNAofvirulentstrains;ThepictureontherightshowsthetotalRNAofweaklypathogenicstrains.OD260/OD280比值是区别RNA好坏的一个重要参数，通常好的RNAOD260/OD280比值在1.9-2.1之间，最低浓度高于120ng/μl，经过检测提取的样品都符合标准，也符合高通量测序的要求。2.3.6高通量测序结果分析通过高通量测序得到病毒遗传信息后，利用NCBI在GenBank上进行同源性比对，通过比对10株弱致病力菌株的测序结果，按核酸类型的分类将获得的病毒可分为正单链RNA病毒、负单链RNA病毒、双链RNA病毒和尚未进行分类的病毒（图2-5A），其中ssRNA病毒占52%，dsRNA病毒占19%，通过数据对比发现ssRNA病毒占据的比例较大，但是根据相关的资料显示目前dsRNA病毒是发现数量最多的，ssRNA只占1/3（PEARSONetal.,2009）。正单链RNA病毒主要有番茄丛矮病毒科（Tombusviridae）、欧尔密病毒属（Ourmiavirus）、裸露RNA病毒（Narnaviridae）和未分类的病毒（图2-5B）。其中欧尔密病毒属和番茄丛矮病毒科各占59%和29%，裸露RNA病毒科占6%，未分类的病毒占6%。以上比对得到的病毒宿主大多数为植物类，从另一面表现出真菌病毒分化于植物病毒，植物病毒通过植物病原菌进入到真菌，经过长时间不停地演变进化，进而成为了真菌病毒。负单链RNA病毒主要是一些未分类的病毒。双链RNA病毒主要有双分体病毒（Partitiviridae）和产黄青霉病毒科（Chrysoviridae），2种病毒在数量上各占一半。另外还有许多分类地位不明确的病?

中国农业科学院硕士学位论文第二章棉花黄萎病菌中病毒多样性18图2-5棉花黄萎病菌病毒种类呈现多样性A病毒核酸类型分类；B正单链RNA病毒分类Fig.2-5ThediversityofmycovirusesisolatedfromVerticilliumA:Classificationoftheviralnucleicacidtype;B:ClassificationofthePositivesingle-strandedRNAvirus表2-4弱致病力菌株测序获得的病毒信息Table2-4ClassificationofvirusfromweaklypathogenicstrainsTypeFamilyNumberExamplePositive-strandedRNAvirusTombusviridaeNarnaviridaeOurmiavirusUnassigned51101Sclerotiniasclerotiorumumbra-likevirus3Sclerotiniasclerotiorummitovirus6Erysiphenecatorassociatedourmia-likevirus7Trichodermaharzianumambiguivirus1Negative-strandedRNAvirusUnassigned5Fusariumpoaenegative-strandedvirus2Double-strandedRNAvirusPartitiviridaeChrysoviridae44VerticilliumdahliaepartitivirusMacrophominaphaseolinachrysovirus1强致病力菌株的测序结果通过NCBI在GenBank上进行同源性比对，根据核酸类型的分类可以将得到的病毒信息分为负单链RNA病毒。负单链RNA病毒有布尼亚病毒科（Bunyaviridae）（表2-5）。表2-5强致病力菌株测序获得的病毒信息Table2-5ClassificationofvirusfromvirμlentstrainsTypeFamilyNumberExampleNegative-strandedRNAvirusBunyaviridae1Plasmoparaassociatedmycobunyavirales-likevirus1

【参考文献】：
期刊论文
[1]浅谈棉花病虫害的发生与防治[J]. 丁勇.  种子科技. 2018(08)
[2]棉花枯、黄萎病的症状及防治方法[J]. 丁晓华.  河北农业. 2018(07)
[3]棉花黄萎病的综合防治[J]. 唐黎标.  中国棉花加工. 2016(04)
[4]真菌病毒的研究进展[J]. 唐利华,莫贱友,郭堂勋,李其利,黄穗萍.  中国农学通报. 2016(12)
[5]棉花黄萎病防治方法研究进展[J]. 章茂林,夏日照,廖晓兰.  现代农业科技. 2014(07)
[6]棉花枯、黄萎病的发生与防治[J]. 郭荣成,张太平.  河南农业. 2013(24)
[7]棉花枯、黄萎病的发生及综合防治[J]. 赵燕华.  现代农业科技. 2013(22)
[8]棉花黄萎病防治技术研究进展[J]. 马宗斌,严根土,刘桂珍,霍晓妮,贾文华.  河南农业科学. 2012(02)
[9]蛭石沙土无底纸钵定量蘸菌液法鉴定棉花品种(系)的抗黄萎病性[J]. 朱荷琴,冯自力,李志芳,赵丽红,师勇强.  中国棉花. 2010(12)
[10]我国植物病害生物防治的现状及发展策略[J]. 邱德文.  植物保护. 2010(04)

博士论文
[1]腹泻儿童及灵长类动物肠道病毒宏基因组学研究[D]. 周成林.江苏大学 2015
[2]我国棉花黄萎病菌的致病力分化及致病相关基因的克隆与分析[D]. 朱荷琴.西北农林科技大学 2013



本文编号：3588785