甘薯响应蔓割病菌侵染的转录组分析及抗病相关基因挖掘

发布时间：2022-01-28 01:09

　　甘薯是重要的粮食、饲料、工业原料作物,也是粮食安全的底线作物。甘薯的块根及茎叶营养价值高,已成为公认的健康食品。甘薯根系发达,茎蔓有着地生根的习性,吸水吸肥能力强,对土壤和日照长度要求不严格,适应性广,在世界各地均有种植。目前全世界甘薯栽培面积达1.2亿亩,总产1亿吨。作为世界第七大粮食作物,广泛种植于世界上100多个国家,以亚洲种植面积最大,非洲排在第二位。中国甘薯栽培面积5千万亩,总产7千多万吨,分别占世界的42%和68%。自从16世纪传入中国之后,甘薯便在福建和广东一带栽培并传播到长江流域和黄河流域,形成了多个栽培区域。在非洲甘薯是继玉米、水稻、小麦和木薯之后第五大粮食作物。随着世界经济的发展,甘薯在各国的消费形式也呈现多样化,美国等发达国家对甘薯的利用主要表现在防癌保健食品开发和做为优质蔬菜食用,发展中国家作为粮食的利用没有衰退,主要进行淀粉加工、优质鲜薯食用、菜用市场开发、保健食品开发等。一些非洲国家将甘薯作为食物,甚至作为食物能量的主要来源。从紫色甘薯中提取花青素,用于食品加工和保健食品的制作也有着非常广阔的前景。但是甘薯在生产上面临着许多病虫害的威胁,其中甘薯蔓割病（枯萎... 

【文章来源】：福建农林大学福建省

【文章页数】：96 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
Appendix List of Abbrevation
中文摘要
Abstract
1. Introduction
    1.1 Background
    1.2 Sweet potato in China
    1.3 Introduction to Fusarium oxysporum
    1.4 Fusarium distribution
    1.5 Disease cycle of fusarium
    1.6 Fusarium disease process
    1.7 Mycelium of fusrium
    1.8 Mechanism of interaction between fungal and plant
    1.9 Identification of Effector and R gene
    1.10 Signal transduction in relation to plant-pathogen interaction
    1.11 Transcription factor in plants and ungal
    1.12 Transcriptome research
    1.13 Control of fungal (F.oxysporum)
    1.14 Objective of the study
    1.15 Significance of study
2. Materials and Methods
    2.1 Plant material, treatment and RNA extraction
    2.2 Library preparation and Transcriptome sequencing
    2.3 Quality control and de novo assembly
    2.4 Gene functional annotation
    2.5 Differential expression analysis
    2.6 Experimental validation
    2.7 Mining for SSR markers
3. Results
    3.1 RNA sequencing and de novo transcriptome assembly
    3.2 Functional annotation
    3.3 GO and KOG classification
    3.4 KEGG pathway mapping
    3.5 Experimental validation by qRT-PCR
    3.6 Gene expression profile of Sweet potato response to Fob
    3.7 Identification of related genes involved in defense response
        3.7.1 WRKY transcription factor
        3.7.2 NAC transcription factors
        3.7.3 Ethylene response transcription factor
        3.7.4 MYB transcription factor
        3.7.5 Pathogenesis-related (PR) protein
        3.7.6 Resistance (R) genes
        3.7.7 Genes associate with Sallicyllic acid (SA) pathway
    3.8 Plant-pathogen interaction pathway
    3.9 SSR determination
4. Discussion and Conclusion
    4.1 discussion
    4.2 conclusion
Reference
Acknowledgement


【参考文献】：
期刊论文
[1]尖孢镰刀菌与寄主互作机理研究进展[J]. 裴月令,曾凡云,彭军,龙海波,郭建荣.  热带生物学报. 2014(01)
[2]中国甘薯病毒种类的血清学和分子检测[J]. 乔奇,张振臣,张德胜,秦艳红,田雨婷,王永江.  植物病理学报. 2012(01)
[3]香蕉枯萎病菌侵染香蕉根系的组织学过程[J]. 殷晓敏,徐碧玉,郑雯,曾会才,马蔚红,王家保,李焕苓,金志强.  植物病理学报. 2011(06)
[4]福建省甘薯蔓割病现状与研究进展[J]. 方树民,陈玉森.  植物保护. 2004(05)
[5]甘薯在我国粮食和能源安全中的重要作用[J]. 刘庆昌.  科技导报. 2004(09)



本文编号：3613411