硫酸二甲酯对患丛枝病泡桐蛋白组的影响

发布时间：2022-07-29 19:27

　　泡桐是一种经济价值较大的树种,对改善生态环境、提高农民生活水平等方面都有很重要的作用,而泡桐易受植原体入侵而患丛枝病,病害危害极其严重,给我国林业、经济、环境等方面造成巨大的损失。为了有效预防和防治这种病害,目前虽然做了很多研究,但其发病机制仍不清楚。为深入了解泡桐丛枝病发病过程蛋白质变化的情况,采用同位素标记相对和绝对定量（i TRAQ）技术鉴定白花泡桐和毛泡桐健康幼苗、患丛枝病幼苗及不同浓度（分别为15 mg·L-1和75 mg·L-1）硫酸二甲酯（DMS）处理后恢复健康形态的患病幼苗的蛋白质,并对其进行功能注释和差异表达分析,得出以下结果:（1）白花泡桐4个样品中共鉴定到2 969个蛋白。2 959个、2 692个、2 928个蛋白质分别注释到NCBI蛋白质数据库、Swiss-Prot数据库和tr EMBL数据库。由功能分类结果可知,共有2 640个蛋白质比对到GO数据库中,共注释到51种功能类别。2 581个蛋白比对到COG数据库中,共分为23个功能类别。KEGG数据库比对结果中,2 324个蛋白质参与121条代谢通路,主要参与代谢途径、次生代谢产物生物合成和光合作用等途径。在... 

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【学位级别】：硕士

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致谢
摘要
缩略词表
1 文献综述
    1.1 蛋白质组学概述
        1.1.1 蛋白质组学产生背景和相关概念
        1.1.2 蛋白质组学研究方法
        1.1.3 蛋白质组学的研究进展
    1.2 植原体病害研究
        1.2.1 植原体概述
        1.2.2 植原体侵入后寄主症状及致病机制
        1.2.3 植原体检测、诊断及病害防治
    1.3 泡桐丛枝病研究
        1.3.1 泡桐丛枝病
        1.3.2 泡桐丛枝病研究现状
    1.4 本文研究的目的和意义
2 引言
3 材料和方法
    3.1 试验材料及处理
    3.2 主要试剂和仪器设备
        3.2.1 主要试剂
        3.2.2 主要仪器设备
    3.3 实验过程
        3.3.1 蛋白质提取
        3.3.2 蛋白质酶解
        3.3.3 iTRAQ标记
        3.3.4 SCX分离
        3.3.5 肽段分离和液相串联质谱(LC-MS/MS)分析
    3.4 生物信息学分析
        3.4.1 蛋白质鉴定及定量分析
        3.4.2 蛋白功能注释分析
    3.5 qRT-PCR验证试验
        3.5.1 总RNA的提取
        3.5.2 qRT-PCR验证
4 结果与分析
    4.1 白花泡桐蛋白质鉴定及功能注释
        4.1.1 白花泡桐蛋白质含量测定
        4.1.2 白花泡桐蛋白质鉴定质量评估
        4.1.3 白花泡桐蛋白质基本鉴定信息
        4.1.4 白花泡桐蛋白质整体分布情况
        4.1.5 白花泡桐蛋白质功能注释统计
        4.1.6 白花泡桐总蛋白的GO功能分析
        4.1.7 白花泡桐蛋白质的COG分析
        4.1.8 白花泡桐蛋白质KEGG分析
        4.1.9 白花泡桐差异蛋白统计
    4.2 毛泡桐蛋白质鉴定及功能注释
        4.2.1 毛泡桐蛋白质含量测定
        4.2.2 毛泡桐蛋白质鉴定质量评估
        4.2.3 毛泡桐蛋白质基本鉴定信息
        4.2.4 毛泡桐蛋白质整体分布情况
        4.2.5 毛泡桐蛋白质功能注释统计
        4.2.6 毛泡桐总蛋白的GO功能分析
        4.2.7 毛泡桐蛋白质的COG分析
        4.2.8 毛泡桐总蛋白的KEGG分析
        4.2.9 毛泡桐差异蛋白统计
    4.3 差异表达蛋白质统计及功能分析
        4.3.1 与丛枝病相关差异蛋白筛选
        4.3.2 与丛枝病发生相关的差异蛋白统计
        4.3.3 与丛枝病发生相关的差异蛋白功能分析
    4.4 qRT-PCR验证结果
5 结论与讨论
参考文献
ABSTRACT
攻读硕士期间发表论文和获奖情况


【参考文献】：
期刊论文
[1]iTRAQ技术及其在水稻蛋白质组学中的应用研究进展[J]. 陈凌华,程祖锌,许明,郑金贵.  中国农业科技导报. 2017(12)
[2]植原体侵染对甜樱桃叶片结构功能的影响[J]. 谭钺,朱东姿,魏海蓉,王甲威,宗晓娟,陈新,徐丽,刘庆忠.  植物生理学报. 2017(07)
[3]泡桐丛枝病发生与代谢组变化的关系（英文）[J]. 曹亚兵,翟晓巧,邓敏捷,赵振利,范国强.  林业科学. 2017(06)
[4]植物质膜蛋白质组的逆境应答研究进展[J]. 邱丽丽,赵琪,张玉红,戴绍军.  植物学报. 2017(02)
[5]周年温度变化对泡桐丛枝病植原体分布和消长的影响[J]. 曹亚兵,翟晓巧,介大委,范国强.  河南农业科学. 2016(10)
[6]花生核糖体蛋白L29-1（RPL29-1）基因克隆表达分析及载体构建[J]. 曹广英,吴琪,唐月异,王秀贞,孙全喜,关淑艳,王传堂.  分子植物育种. 2016(07)
[7]利用转录组及iTRAQ技术筛选高油酸油菜抗病相关基因[J]. 张振乾,肖钢,官春云,邬贤梦,熊兴华,李云昌,胡琼,陈社员.  华北农学报. 2015(05)
[8]水稻响应稻瘟病菌侵染的差异表达蛋白分析[J]. 陈默,宋吉强,马洪雨.  中国科技论文. 2015(12)
[9]马尾松钙调素基因的克隆及响应松材线虫侵染的表达特征[J]. 徐亮,刘振宇,吕全,梁军,张星耀.  林业科学研究. 2014(03)
[10]甲基磺酸甲酯对毛泡桐丛枝病苗DNA甲基化的影响[J]. 曹喜兵,赵振利,范国强,邓敏捷,董焱鹏.  林业科学. 2014(03)

博士论文
[1]Candidatus liberibacter asiaticus诱导的柑橘转录组学及蛋白组学研究[D]. 钟云.湖南农业大学 2012

硕士论文
[1]番茄钙调蛋白和类钙调蛋白的抗病调控功能分析[D]. 刘维.浙江大学 2015



本文编号：3667044