马铃薯晚疫病菌有性生殖后代群体结构比较分析
发布时间：2022-12-17 17:17
由致病疫霉（Phytophthora infestans,P.infestans）引起的晚疫病（Potato late blight,PLB）是世界范围内马铃薯的毁灭性病害之一。本研究采集并分离、纯化来自于云南省昆明市马铃薯主产区的PLB病样,利用形态学和ITS序列定种后,确定其染色体倍性、交配型、线粒体单倍型、毒性和甲霜灵敏感性。选取其中5株菌株,利用改良的卵孢子萌发方法得到有性生殖F1代群体;然后对F1代群体的表型（交配型、致病性、甲霜灵敏感性）和基因型（染色体倍性、线粒体单倍型、SSR标记）进行测定并用相关性分析解析基因型和表型之间的联系。在得到上述结果的基础上,利用1对P.infestans亲本诱导有性生殖得到的F1代交配型分离群体（A1、A2、A1A2、自育型）进行全基因组重测序和比较分析。本研究的主要结果有:1.2017年7月中旬,在云南省昆明市寻甸县和嵩明县不同马铃薯品种上采集晚疫病发病叶片,分离纯化和鉴定得到共19株P.infestans。对峙培养后鉴定出A1交配型3株,A2交配型12株,A1A2交配型1...
【文章页数】：83 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
中文摘要
Abstract
术语及符号说明
第一章 绪论
1.1 马铃薯晚疫病概述
1.1.1 马铃薯重要性、晚疫病的危害症状及流行方式
1.1.2 马铃薯晚疫病菌的分类地位及生活史
1.2 马铃薯晚疫病菌有性生殖的概述
1.2.1 马铃薯晚疫病菌有性生殖的发生条件
1.2.2 马铃薯晚疫病菌卵孢子萌发条件
1.3 马铃薯晚疫病菌群体结构的概述
1.3.1 P.infestans表型的研究
1.3.1.1 P.infestans交配型的研究
1.3.1.2 P.infestans抗药性的研究
1.3.1.3 P.infestans致病性和致病力的研究
1.3.2 P.infestans基因型的研究
1.3.2.1 P.infestans基于胞质线粒体DNA单倍型的研究
1.3.2.2 P.infestans基于蛋白质水平的同工酶的研究
1.3.2.3 P.infestans基于核基因组的限制性片段长度多态性的研究
1.3.2.4 P.infestans基于核基因组的扩增片段长度多态性的研究
1.3.2.5 P.infestans基于核基因组的微卫星标记的研究
1.3.2.6 P.infestans基于核基因组的单核苷酸多态性的研究
1.4 相关性分析及基于全基因组的比较分析
1.5 本研究内容及目的
第二章 P.infestans有性生殖后代诱导方法研究
2.1 P.infestans分离与鉴定
2.1.1 材料及方法
2.1.1.1 病样采集
2.1.1.2 培养基
2.1.1.3 病原菌的分离纯化
2.1.1.4 病原菌形态学及分子生物学鉴定和保存
2.1.1.5 交配型的测定
2.1.2 结果与分析
2.2 P.infestans线粒体DNA单倍型的测定
2.2.1 实验材料
2.2.2 实验方法
2.2.2.1 P.infestans基因组DNA的提取
2.2.2.2 DNA质量的检测
2.2.2.3 P.infestans线粒体DNA单倍型的测定
2.2.3 结果与分析
2.2.4 讨论
2.3 P.infestans卵孢子萌发条件的优化
2.3.1 实验材料
2.3.2 实验方法
2.3.2.1 卵孢子的收集
2.3.2.2 卵孢子萌发条件
2.3.2.3 卵孢子活性测定方法
2.3.3 结果与分析
2.3.3.1 卵孢子产生情况及无性结构死亡处理
2.3.3.2 卵孢子活力测定的结果
2.3.3.3 卵孢子的萌发率
2.3.4 讨论
第三章 P.infestans有性生殖F_1 代群体结构表型特点及分析
3.1 实验材料
3.1.1 供试菌株
3.1.2 培养基
3.1.3 鉴定寄主
3.1.4 实验试剂
3.2 实验方法
3.2.1 染色体倍性测定的方法
3.2.2 P.infestans有性生殖F_1 代菌株交配型测定的方法
3.2.3 P.infestans有性生殖F_1 代菌株甲霜灵敏感性测定的方法
3.2.4 P.infestans有性生殖F_1 代菌株毒性测定的方法
3.2.4.1 鉴别寄主的准备
3.2.4.2 供试菌株的准备
3.2.4.3 人工接种的方法
3.3 结果与分析
3.3.1 P.infestans有性生殖F_1 代菌株核染色体倍性的测定结果
3.3.2 P.infestans有性生殖F_1 代菌株交配型的测定结果
3.3.3 P.infestans有性生殖F_1 代菌株甲霜灵敏感性的测定结果
3.3.4 P.infestans有性生殖F_1 代菌株毒性的测定结果
3.4 讨论
第四章 P.infestans有性生殖F_1 代菌株基因型及基因型与表型的相关性分析
4.1 实验材料
4.1.1 供试菌株
4.1.2 培养基
4.1.3 供试引物
4.2 实验方法
4.2.1 P.infestans有性生殖F_1 代菌株基因组DNA的提取
4.2.2 P.infestans有性生殖F_1 代菌株线粒体DNA单倍型的测定
4.2.3 PCR反应体系和扩增程序
4.2.4 数据统计及分析
4.2.5 P.infestans有性生殖F_1 代群体基因型和表型的关联分析
4.3 结果与分析
4.3.1 P.infestans有性生殖F_1 代菌株线粒体单倍型的测定结果
4.3.2 P.infestans有性生殖F_1 代菌株SSR基因型结果
4.3.3 P.infestans有性生殖F_1 代菌株表型与基因型结果
4.4 讨论
第五章 P.infestans有性生殖F_1 代交配型分离群体比较基因组分析
5.1 实验材料
5.2 实验方法
5.2.1 有性生殖F_1 代基因组提取
5.2.2 有性生殖F_1 代全基因组序列测定、编辑、拼接和注释
5.2.3 有性生殖F_1 代群体全基因组变异检测
5.2.4 基于10 个全基因组序列的聚类分析
5.2.5 基于4个BSA群体的PCA分析
5.3 实验结果
5.3.1 有性生殖F_1 代基因组提取的结果检测
5.3.2 有性生殖F_1 代全基因组序列测定、编辑、拼接和注释的结果
5.3.3 有性生殖F_1 代全基因组变异检测的结果
5.4 讨论
第六章 全文总结
参考文献
攻读学位期间研究成果
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]马铃薯晚疫病菌有性生殖发生对无毒基因Avr-blb1多样性及菌株毒性的影响[J]. 梁静思,王伟伟,单慧,杨洋,李灿辉,唐唯. 西南农业学报. 2019(01)
[2]云南省昆明市马铃薯晚疫病菌甲霜灵抗药性监测[J]. 霍超,曹继芬,王昌命,赵志坚. 安徽农业科学. 2018(12)
[3]致病疫霉RXLR效应蛋白相关研究进展[J]. 王洪洋,秦丽娟,唐唯,田振东. 生物技术通报. 2018(02)
[4]甘肃省马铃薯致病疫霉交配型组成及其对甲霜灵的抗药性[J]. 张大为,惠娜娜,王立,李继平,朱小琼,国立耘. 西北农业学报. 2014(06)
[5]四川马铃薯晚疫病菌交配型、生理小种、甲霜灵敏感性及mtDNA单倍型组成分析[J]. 李洪浩,彭化贤,席亚东,王晓黎,刘波微. 中国农业科学. 2013(04)
[6]马铃薯晚疫病发病程度田间观察记录标准的探讨[J]. 李文娟,FORBES Gregory A.,谢开云. 中国马铃薯. 2012(04)
[7]北方五省(区)马铃薯晚疫病菌对甲霜灵和精甲霜灵的敏感性检测[J]. 王文桥,王丽,韩秀英,张小风,马志强,孟润杰. 植物保护. 2012(03)
[8]不同寄主致病疫霉菌群体遗传结构的SSR比较分析[J]. 陈昌盛,李本金,黄灿强,许旭萍,陈庆河,翁启勇. 中国农学通报. 2010(19)
[9]中国部分地区马铃薯寄主上致病疫霉SSR基因型分析[J]. 姚国胜,杨志辉,朱杰华,桂秀梅,陶晡. 菌物学报. 2009(02)
[10]云南致病疫霉交配型、甲霜灵敏感性、mtDNA单倍型及其群体演替研究[J]. 赵志坚,曹继芬,李灿辉,孙道旺,杨明英,王军. 中国农业科学. 2007(04)
博士论文
[1]我国西北马铃薯主产区晚疫病菌群体遗传多样性研究[D]. 田月娥.西北农林科技大学 2015
[2]大豆疫霉菌无毒基因的克隆及马铃薯抗病品种紫花白抗晚疫病机制的研究[D]. 娜仁.内蒙古农业大学 2013
[3]中国马铃薯晚疫病菌群体遗传结构研究[D]. 朱杰华.河北农业大学 2004
硕士论文
[1]云南省马铃薯晚疫病菌群体遗传结构及其有性生殖特点[D]. 缪云琴.云南师范大学 2014
[2]马铃薯晚疫病菌线粒体单倍型分析及其对杀菌剂敏感性测定[D]. 陈良华.河北农业大学 2009
[3]马铃薯晚疫病菌SSR基因型多样性及其有性F1代菌株分析[D]. 赵冬梅.河北农业大学 2009
[4]我国大豆疫霉根腐病菌无毒基因Avr1b的遗传多样性研究[D]. 朱晓莹.西北农林科技大学 2008
[5]云南马铃薯晚疫病菌群体的遗传多样性研究[D]. 杨素祥.云南师范大学 2006
[6]马铃薯晚疫病菌卵孢子生物学特性的研究[D]. 马利松.河北农业大学 2003
本文编号：3720323
【文章页数】：83 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
中文摘要
Abstract
术语及符号说明
第一章 绪论
1.1 马铃薯晚疫病概述
1.1.1 马铃薯重要性、晚疫病的危害症状及流行方式
1.1.2 马铃薯晚疫病菌的分类地位及生活史
1.2 马铃薯晚疫病菌有性生殖的概述
1.2.1 马铃薯晚疫病菌有性生殖的发生条件
1.2.2 马铃薯晚疫病菌卵孢子萌发条件
1.3 马铃薯晚疫病菌群体结构的概述
1.3.1 P.infestans表型的研究
1.3.1.1 P.infestans交配型的研究
1.3.1.2 P.infestans抗药性的研究
1.3.1.3 P.infestans致病性和致病力的研究
1.3.2 P.infestans基因型的研究
1.3.2.1 P.infestans基于胞质线粒体DNA单倍型的研究
1.3.2.2 P.infestans基于蛋白质水平的同工酶的研究
1.3.2.3 P.infestans基于核基因组的限制性片段长度多态性的研究
1.3.2.4 P.infestans基于核基因组的扩增片段长度多态性的研究
1.3.2.5 P.infestans基于核基因组的微卫星标记的研究
1.3.2.6 P.infestans基于核基因组的单核苷酸多态性的研究
1.4 相关性分析及基于全基因组的比较分析
1.5 本研究内容及目的
第二章 P.infestans有性生殖后代诱导方法研究
2.1 P.infestans分离与鉴定
2.1.1 材料及方法
2.1.1.1 病样采集
2.1.1.2 培养基
2.1.1.3 病原菌的分离纯化
2.1.1.4 病原菌形态学及分子生物学鉴定和保存
2.1.1.5 交配型的测定
2.1.2 结果与分析
2.2 P.infestans线粒体DNA单倍型的测定
2.2.1 实验材料
2.2.2 实验方法
2.2.2.1 P.infestans基因组DNA的提取
2.2.2.2 DNA质量的检测
2.2.2.3 P.infestans线粒体DNA单倍型的测定
2.2.3 结果与分析
2.2.4 讨论
2.3 P.infestans卵孢子萌发条件的优化
2.3.1 实验材料
2.3.2 实验方法
2.3.2.1 卵孢子的收集
2.3.2.2 卵孢子萌发条件
2.3.2.3 卵孢子活性测定方法
2.3.3 结果与分析
2.3.3.1 卵孢子产生情况及无性结构死亡处理
2.3.3.2 卵孢子活力测定的结果
2.3.3.3 卵孢子的萌发率
2.3.4 讨论
第三章 P.infestans有性生殖F_1 代群体结构表型特点及分析
3.1 实验材料
3.1.1 供试菌株
3.1.2 培养基
3.1.3 鉴定寄主
3.1.4 实验试剂
3.2 实验方法
3.2.1 染色体倍性测定的方法
3.2.2 P.infestans有性生殖F_1 代菌株交配型测定的方法
3.2.3 P.infestans有性生殖F_1 代菌株甲霜灵敏感性测定的方法
3.2.4 P.infestans有性生殖F_1 代菌株毒性测定的方法
3.2.4.1 鉴别寄主的准备
3.2.4.2 供试菌株的准备
3.2.4.3 人工接种的方法
3.3 结果与分析
3.3.1 P.infestans有性生殖F_1 代菌株核染色体倍性的测定结果
3.3.2 P.infestans有性生殖F_1 代菌株交配型的测定结果
3.3.3 P.infestans有性生殖F_1 代菌株甲霜灵敏感性的测定结果
3.3.4 P.infestans有性生殖F_1 代菌株毒性的测定结果
3.4 讨论
第四章 P.infestans有性生殖F_1 代菌株基因型及基因型与表型的相关性分析
4.1 实验材料
4.1.1 供试菌株
4.1.2 培养基
4.1.3 供试引物
4.2 实验方法
4.2.1 P.infestans有性生殖F_1 代菌株基因组DNA的提取
4.2.2 P.infestans有性生殖F_1 代菌株线粒体DNA单倍型的测定
4.2.3 PCR反应体系和扩增程序
4.2.4 数据统计及分析
4.2.5 P.infestans有性生殖F_1 代群体基因型和表型的关联分析
4.3 结果与分析
4.3.1 P.infestans有性生殖F_1 代菌株线粒体单倍型的测定结果
4.3.2 P.infestans有性生殖F_1 代菌株SSR基因型结果
4.3.3 P.infestans有性生殖F_1 代菌株表型与基因型结果
4.4 讨论
第五章 P.infestans有性生殖F_1 代交配型分离群体比较基因组分析
5.1 实验材料
5.2 实验方法
5.2.1 有性生殖F_1 代基因组提取
5.2.2 有性生殖F_1 代全基因组序列测定、编辑、拼接和注释
5.2.3 有性生殖F_1 代群体全基因组变异检测
5.2.4 基于10 个全基因组序列的聚类分析
5.2.5 基于4个BSA群体的PCA分析
5.3 实验结果
5.3.1 有性生殖F_1 代基因组提取的结果检测
5.3.2 有性生殖F_1 代全基因组序列测定、编辑、拼接和注释的结果
5.3.3 有性生殖F_1 代全基因组变异检测的结果
5.4 讨论
第六章 全文总结
参考文献
攻读学位期间研究成果
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]马铃薯晚疫病菌有性生殖发生对无毒基因Avr-blb1多样性及菌株毒性的影响[J]. 梁静思,王伟伟,单慧,杨洋,李灿辉,唐唯. 西南农业学报. 2019(01)
[2]云南省昆明市马铃薯晚疫病菌甲霜灵抗药性监测[J]. 霍超,曹继芬,王昌命,赵志坚. 安徽农业科学. 2018(12)
[3]致病疫霉RXLR效应蛋白相关研究进展[J]. 王洪洋,秦丽娟,唐唯,田振东. 生物技术通报. 2018(02)
[4]甘肃省马铃薯致病疫霉交配型组成及其对甲霜灵的抗药性[J]. 张大为,惠娜娜,王立,李继平,朱小琼,国立耘. 西北农业学报. 2014(06)
[5]四川马铃薯晚疫病菌交配型、生理小种、甲霜灵敏感性及mtDNA单倍型组成分析[J]. 李洪浩,彭化贤,席亚东,王晓黎,刘波微. 中国农业科学. 2013(04)
[6]马铃薯晚疫病发病程度田间观察记录标准的探讨[J]. 李文娟,FORBES Gregory A.,谢开云. 中国马铃薯. 2012(04)
[7]北方五省(区)马铃薯晚疫病菌对甲霜灵和精甲霜灵的敏感性检测[J]. 王文桥,王丽,韩秀英,张小风,马志强,孟润杰. 植物保护. 2012(03)
[8]不同寄主致病疫霉菌群体遗传结构的SSR比较分析[J]. 陈昌盛,李本金,黄灿强,许旭萍,陈庆河,翁启勇. 中国农学通报. 2010(19)
[9]中国部分地区马铃薯寄主上致病疫霉SSR基因型分析[J]. 姚国胜,杨志辉,朱杰华,桂秀梅,陶晡. 菌物学报. 2009(02)
[10]云南致病疫霉交配型、甲霜灵敏感性、mtDNA单倍型及其群体演替研究[J]. 赵志坚,曹继芬,李灿辉,孙道旺,杨明英,王军. 中国农业科学. 2007(04)
博士论文
[1]我国西北马铃薯主产区晚疫病菌群体遗传多样性研究[D]. 田月娥.西北农林科技大学 2015
[2]大豆疫霉菌无毒基因的克隆及马铃薯抗病品种紫花白抗晚疫病机制的研究[D]. 娜仁.内蒙古农业大学 2013
[3]中国马铃薯晚疫病菌群体遗传结构研究[D]. 朱杰华.河北农业大学 2004
硕士论文
[1]云南省马铃薯晚疫病菌群体遗传结构及其有性生殖特点[D]. 缪云琴.云南师范大学 2014
[2]马铃薯晚疫病菌线粒体单倍型分析及其对杀菌剂敏感性测定[D]. 陈良华.河北农业大学 2009
[3]马铃薯晚疫病菌SSR基因型多样性及其有性F1代菌株分析[D]. 赵冬梅.河北农业大学 2009
[4]我国大豆疫霉根腐病菌无毒基因Avr1b的遗传多样性研究[D]. 朱晓莹.西北农林科技大学 2008
[5]云南马铃薯晚疫病菌群体的遗传多样性研究[D]. 杨素祥.云南师范大学 2006
[6]马铃薯晚疫病菌卵孢子生物学特性的研究[D]. 马利松.河北农业大学 2003
本文编号：3720323
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/dzwbhlw/3720323.html
最近更新
教材专著
