烟草甲线粒体基因组序列测定与分析

发布时间：2023-09-24 17:30

　　为进一步获取烟草甲线粒体基因组信息,以期为烟草甲分类鉴定、系统发育和种群遗传等方面的深入研究奠定基础,采用二代测序技术测定了烟草甲线粒体基因组序列。结果表明:烟草甲线粒体基因组全长15 009 bp,包含13个蛋白质编码基因、2个核糖体RNA基因、22个转运RNA基因和1个控制区,基因组排列的顺序和组成与鞘翅目储粮害虫线粒体基因组相似。烟草甲线粒体基因组的A+T含量为78.7%,13个蛋白质编码基因除cox2基因的起始密码子是TTG外,其余蛋白质编码基因的起始密码子均为通用密码子ATN;典型的TAA或TAG为9个基因的终止密码子,而cox3、nad5、nad4以不完全的T作为终止密码。烟草甲的22个tRNA均能折叠成三叶草结构,但tRNA^Asp、tRNA^Leu和tRNA^His的二级结构中缺少TψC环,tRNA⁽ser(AGN))的DHU(Dihydorouridine,二氢尿嘧啶)臂缺失,因而不能形成典型的三叶草式二级结构。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品及DNA提取
    1.2 序列测定及组装
    1.3 序列注释和分析
2 结果与分析
    2.1 线粒体基因组结构
    2.2 线粒体基因组碱基组成及分析
    2.3 线粒体基因组PCGs基因
    2.4 线粒体基因组t RNA基因及r RNA基因
3 讨论
4 结论



本文编号：3848448