宏转录组学技术快速鉴定两种果树负链RNA新病毒

发布时间：2024-02-04 01:11

　　我国果树资源丰富,苹果、柑橘等水果含有丰富的维生素、多糖等营养物质,具有抗氧化、抗衰老、抗炎症等功效,具有重要的市场经济价值。病毒病害影响果树植株的正常生长,甚至给相关产业造成严重损失。果树病毒病害种类较多,其中部分病害的病原物至今未能确认,因此果树病毒病害的检测与鉴定对于生产及防治至关重要。病毒在果树体内分布不均且具季节性差异,有些病毒为潜伏侵染,这些因素都限制了传统病毒检测方法在果树病毒鉴定上的应用。宏转录组测序技术,可以在没有任何同源性参考序列的情况下拼接出新病毒,它的发展大大加快了未知病毒病原物的检测和鉴定进程。宏转录组测序有两种建库方式:Poly(A)富集法和去除rRNA法。本研究首先使用Poly(A)富集法对症状表现为叶片卷曲、主脉黄化、矮化的长春花样品建库测序获得病毒片段,Blast比对鉴定其为中国未曾报道过的莴苣褪绿病毒(Lettuce chrolosis virus,LCV),利用RT-PCR技术验证基因组全序列。序列比对分析表明,本分离物LCV-PW与加州分离物的全基因组RNA1和RNA2核苷酸序列相似度分别为85%和88%,11个ORFs氨基酸序列同源性为62%-...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1.1苹果扁枝病症状[10]

西南大学硕士学位论文做简要综述。1.1.1苹果肿枝/扁枝病（Appleflatlimbdisease）也被称为扭曲（Twisting）病[8]，分布于世界各苹果产区，澳大利亚[8,9]、加拿大、丹麦、英国、意大利、挪威、瑞典、瑞士、阿拉伯地区、美国、南斯拉夫均有报道[1....

图1.2苹果胶木病症状[18]

第1章文献综述易被果实压弯（图1.2B）。有研究发现，感病的兰蓬王在苗圃育苗期便可产果。显微观察发现，患病树体的木质部导管细胞壁形态发生变化，枝条倒塌部位处的结构与应垃木凝胶纤维类似。目前没有叶片、果实症状的相关报道。胶木病可侵染不同的苹果品种，目前已报道的品种有兰蓬王....

图1.3柑橘鳞皮病症状[32,33]

西南大学硕士学位论文叶斑（图1.3C），并在叶片背面出现棕色粘性侬疱（图1.3D），偶尔会导致果实表面出现环形凹陷斑（图1.3E）[30]。CPsV具有寄主选择性，感染甜橙、葡萄柚和宽皮柑橘后，会导致枝干的树皮开裂[26]，而酸柠檬、粗柠檬和酸橙等大部分柑橘品种往往....

图1.4柑橘囊胶病的表现症状[32]

图1.4柑橘囊胶病的表现症状[32]：树干凹陷（A）、枝干截面同心胶环（BC）和橡树形叶片（D）Fig.1.4Concavitiesassociatedwithconcavegumdiseasesinthetrunkofasweetorangetr....

本文编号：3894949