甘蔗响应赤条病菌侵染的ScPR1基因的鉴定与功能分析

发布时间：2024-02-04 01:46

　　甘蔗赤条病是由燕麦食酸菌燕麦亚种Acidovorax avenae subsp.avenae(Aaa)引起的甘蔗主要细菌性病害之一。为从转录组水平探讨甘蔗应答Aaa侵染的分子机制,本研究以抗赤条病新台糖22号(ROC22)和感赤条病闽糖11-610(MT11-610)品种为实验材料。处理组用剪叶法接种Aaa菌液(SC-026),对照组接种无菌培养基,分别在接种0 h、24 h、48 h、72 h后采集甘蔗叶片(3次生物学重复)。采用RNA-seq技术构建甘蔗响应Aaa侵染的转录组文库,探寻甘蔗应答Aaa侵染的差异表达基因(DEGs)及其代谢和信号通路,并对病程相关蛋白ScPR1基因进行克隆和功能验证。主要研究结果如下:(1)从两个品种中筛选出29,887个显著DEGs,其中从抗病品种ROC22中获得18,689个DEGs(45.5%的DEGs为上调表达),而从感病品种MT11-610中获得15,782个差异基因(55.8%的DEGs为上调表达)。KEGG富集分析显示,共有3,818个DEGs富集在67条通路上,主要是苯丙烷生物合成途径(ko00940)、光合作用天线蛋白途径(ko001...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图3-1两个品种不同时间点的差异基因（DEGs）韦恩图

3结果与分析24（R_AaavsR0_CK）中有18,689个，感病品种MT11-610处理组（S_AaavsS0_CK）中有15,782个。在ROC22处理组鉴定到的上下调DEGs分别有8,498和10,196个；MT11-610处理组中鉴定到的上下调DEGs分别有8,807和....

图3-2抗病品种新台糖22处理组差异基因GO功能注释(A):上调差异基因；(B)：下调差异基因；BP:生物进程；CC:分子组成；MF:分子功能Fig3-2.GeneOntology(GO)annotationofdifferentiallyexpressedgenes(DEGs)intheAaa-resistantcultivarROC22.Up-(A)anddownregulated(B)BP:biologicalprocess,CC:cellularcomponent,...

3结果与分析26图3-2抗病品种新台糖22处理组差异基因GO功能注释(A):上调差异基因；(B)：下调差异基因；BP:生物进程；CC:分子组成；MF:分子功能Fig3-2.GeneOntology(GO)annotationofdifferentiallyexpressedgen....

图3-3感病品种闽糖11-610处理组差异基因GO功能注释(A):上调差异基因；(B)：下调差异基因；BP:生物进程；CC:分子组成；MF:分子功能Fig3-3.GeneOntology(GO)annotationofdifferentiallyexpressedgenes(DEGs)intheAaa-susceptiblecultivarMT11-610.Up-(A)anddownregulated(B).BP:biologicalprocess,CC:cellularc...

甘蔗响应赤条病菌侵染的ScPR1基因的鉴定与功能分析27最多的是催化活性，2,641个，其次是作用于糖基键的水解酶活性，有211个DEGs。图3-3感病品种闽糖11-610处理组差异基因GO功能注释(A):上调差异基因；(B)：下调差异基因；BP:生物进程；CC:分子组成；MF:....

图3-4基于qRT-PCR验证12个差异基因相对表达量（2ΔΔCT）热图

3结果与分析30图3-4基于qRT-PCR验证12个差异基因相对表达量（2ΔΔCT）热图注：星号表示每个时间点相对表达水平的显著性差异（*表示p<0.05;**表示p<0.01）;红色表示上调表达，蓝色表示下调表达。Fig3-4.Heatmapdepictingrelativee....

本文编号：3894992