基于线粒体基因组探讨紫貂种群遗传结构与进化历史
发布时间:2024-03-24 05:22
紫貂(Martes zibellina)曾是一种广泛分布的鼬科动物,现仅在6个国家有分布。由于人类经济活动的干扰,栖息地环境破坏以及生境分布呈斑块状,国内野外种群数量急剧减少,被中国列为国家Ⅰ级保护动物。紫貂物种起源中心地区一直是紫貂研究的热点问题,俄罗斯南部远东地区及中国东北部多次被认定为紫貂起源的中心地带,目前的研究中,研究的种群多局限于该物种的局部分布区,而缺乏从全局角度的研究,或所研究紫貂种群涉及的分布区域比较广泛,但所用的标记比较单一。鉴于此,本研究通过测定国内大兴安岭、小兴安岭、长白山地区和蒙古以及邻近俄罗斯多个地区44只个体的紫貂种群完整线粒体基因组(除去D-loop)序列及43只个体线粒体部分控制区序列,结合GenBank公布的俄罗斯地区27条紫貂种群完整线粒体基因组(除去D-loop)序列数据,通过对线粒体基因组序列分析来探讨紫貂遗传结构及进化历史。主要研究结果如下:1.紫貂的种内差异主要表现在ND2、ND3、ND5和CYTB以及控制区基因,线粒体基因A+T含量明显大于G+C含量,表明出现了明显的AT偏好。2.中国大兴安岭和小兴安岭地理种群遗传多样性较高且遗传分化较小...
【文章页数】:62 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
abstract
1 绪论
1.1 紫貂种群
1.2 动物线粒体基因组
1.2.1 概述
1.2.2 遗传特点
1.2.3 紫貂线粒体基因组
1.3 线粒体基因组在野生动物遗传学中的应用
1.4 紫貂种群遗传与进化研究现状
1.4.1 种群遗传结构
1.4.2 进化历史
1.5 本论文的研究目的及意义
2 材料与方法
2.1 实验材料
2.1.1 样品信息
2.1.2 实验仪器设备与试剂
2.2 实验方法
2.2.1 基因组DNA提取
2.2.2 紫貂线粒体全基因组测序
2.2.3 紫貂线粒体D-loop区的克隆与测序
2.3 数据分析
3 结果与分析
3.1 实验结果
3.1.1 DNA提取
3.1.2 PCR扩增
3.1.3 控制区克隆
3.2 序列特征与分析
3.2.1 线粒体基因组(除去D-loop)
3.2.2 控制区序列
3.3 种群遗传结构及进化历史的分析
3.3.1 线粒体基因组(除去D-loop)
3.3.2 线粒体DNA控制区
4 讨论
4.1 种群遗传结构
4.2 种群进化历史
4.3 中国紫貂种群保护建议
5 结论
参考文献
附录
攻读学位期间发表的学术论文
致谢
本文编号:3937031
【文章页数】:62 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
abstract
1 绪论
1.1 紫貂种群
1.2 动物线粒体基因组
1.2.1 概述
1.2.2 遗传特点
1.2.3 紫貂线粒体基因组
1.3 线粒体基因组在野生动物遗传学中的应用
1.4 紫貂种群遗传与进化研究现状
1.4.1 种群遗传结构
1.4.2 进化历史
1.5 本论文的研究目的及意义
2 材料与方法
2.1 实验材料
2.1.1 样品信息
2.1.2 实验仪器设备与试剂
2.2 实验方法
2.2.1 基因组DNA提取
2.2.2 紫貂线粒体全基因组测序
2.2.3 紫貂线粒体D-loop区的克隆与测序
2.3 数据分析
3 结果与分析
3.1 实验结果
3.1.1 DNA提取
3.1.2 PCR扩增
3.1.3 控制区克隆
3.2 序列特征与分析
3.2.1 线粒体基因组(除去D-loop)
3.2.2 控制区序列
3.3 种群遗传结构及进化历史的分析
3.3.1 线粒体基因组(除去D-loop)
3.3.2 线粒体DNA控制区
4 讨论
4.1 种群遗传结构
4.2 种群进化历史
4.3 中国紫貂种群保护建议
5 结论
参考文献
附录
攻读学位期间发表的学术论文
致谢
本文编号:3937031
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