哈茨木霉Th-33 GαⅢ基因thga3的功能研究

发布时间:2024-05-13 22:37
  研究生防菌木霉菌(Trichoderma)的信号传递和调控机制,对探索木霉菌生防机制、提高生防效果有重要的意义。G蛋白是一种GTP结合蛋白,介导的细胞跨膜信号传递系统在调控真菌的生长、产孢、代谢、致病性等过程中发挥了重要的作用。典型的丝状真菌G蛋白由α、β和γ3个亚基组成,其中Gα亚基包括GαⅠ、GαⅡ、GαⅢ三个类群。一般认为,GαⅢ亚基的功能主要表现为影响细胞壁结构相关酶的活性、细胞壁结构、菌株致病力等,并可能负调控真菌的产孢。本研究采用基因敲除、回复突变技术,结合转录组测序和分析,研究了哈茨木霉GαⅢ亚基的功能。从哈茨木霉Th-33全基因组序列获得GαⅢ亚基基因thga3序列信息,在基因组中的序列编号为Tha08474,通过PCR扩增获得thga3基因片段并进行生物信息学分析,完整thga3基因的开放阅读框为1068bp,共编码355个氨基酸,GenBank登录号为KY937956。与绿木霉(T.virens XP013955540.1)GαⅢ亚基的相似性为99%,与深绿木霉(T.atroviride XP0139...

【文章页数】:103 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

图1.1G蛋白信号途径的基本组成部分Fig.1ThebasiccomponentsoftheGproteinsignalingsystem

图1.1G蛋白信号途径的基本组成部分Fig.1ThebasiccomponentsoftheGproteinsignalingsystem

游效应因子(Effector)、以及G蛋白信号调控蛋白(RgulatorsofGproteinsignaling,RGS)(Laal.,2006;刘增亮等,2014)如图1.1(李利等,2013)。G蛋白信号调控蛋白是一种GTPase激白(GTPas....


图1.2G蛋白循环Fig.1.2TheGproteincycle

图1.2G蛋白循环Fig.1.2TheGproteincycle

cAMP-PKA途径影响致病因子黑色素和多糖荚膜的产生以及交配virens)作用于酸苷类,对细胞和亚细胞的移动有重要的作用,对产孢的影响未知KH.atroviridis)负调控产孢,影响抗菌肽的形成KT.reesei)参与了细胞壁降解酶的产生,参与重寄生过程,调控细....


图2.1thga3基因的全长DNA以及cDNA的扩增M:250bpDNALadderMarker,1、Th-33基因组DNA,2、Th-33cDNA

图2.1thga3基因的全长DNA以及cDNA的扩增M:250bpDNALadderMarker,1、Th-33基因组DNA,2、Th-33cDNA

第二息学分析,以及NCBI在线工具,ORFfinle分析编码蛋白质的疏水性;利用signal4.1分析翻译后信号肽;用MEGA6.0构建系统进化树。克隆R为引物,以Th-33基因组DN野生菌哈茨木霉Th-33总RNAPCR扩增,目的片段大小为1....


图2.3thga3基因编码氨基酸序列的疏水性预测

图2.3thga3基因编码氨基酸序列的疏水性预测

NAMAN软件以及NCBI在线工具,ORFfinder分析thga3的开放阅读长度为1068bp的完整的开放阅读框。将thga3基因的DNA序列与软件中进行序列比对,结果显示thga3基因序列中共有6个外显子,5长度为1068bp,6个外....



本文编号:3972814

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