中国部分红树类药用植物叶形态解剖学研究及分子鉴定
发布时间：2020-06-10 22:45
【摘要】：目的:基于23种红树植物的药用记载,分别对所采集红树类药用植物及其相近缘植物进行了叶形态解剖、分子水平DNA条形码鉴别研究,为红树植物的资源开发与进一步的药用研究提供科学依据。方法:调查并采集了不同种的药用红树植物,采用生药学的方法,分别在光学显微镜与扫描电镜下对红树植物叶组织特征进行观察比较;根据分子系统发育学理论,利用DNA条形码鉴别技术,提取植物基因组DNA、选取核基因ITS2和叶绿体psbA-trnH片段,PCR扩增和双向测序,利用软件MEGA6.0计算种间和种内遗传距离,构建邻接法(NJ)系统发育树,对所得各种植物的序列结果进行比对分析。结果:从叶组织结构横切面特征分析,红树植物表皮上均被有角质层,表皮细胞在层数、大小及细胞内所含物质等方面存在较大差异,叶肉发达,主脉维管束较为发达。叶表皮形态特征差异主要集中在表皮细胞的形态,垂周壁的类型,气孔器的类型等。叶扫描电镜下的区别主要是角质层、蜡质、以及气孔器的形状等方面。在分子水平上获得的DNA条形码的鉴定结果与宏观植物学分类结果一致,表明了以ITS2序列为主,psbA-trnH序列作为辅助序列可做为红树植物物种间鉴别的有效方法。结论:本论文为红树植物物种间的显微鉴别、分子鉴别研究提供了新资料,为红树类药用植物进一步的资源开发与更准确的入药提供了参考。
【图文】：
3.3 测序与序列的拼接经电泳检测后的 PCR 扩增产物，送样测序。测序的原理参照参考文献 90。主要测序技术是 Sanger 等的双脱氧末端终止法（酶法）。本研究使用 ABI3730XL测序仪双向测序获得序列文件。3.4 数据处理测序获得的峰图使用 CodonCode Aligner V 2.06（CodonCode Co.,USA）仪器校对拼接，去除质量较低以及引物区序列。ITS2 序列使用基于隐马尔科夫模型的 HMMer 注释方法去除两端的 5.8S 和 28S 区段以获得 ITS2 间隔区序列，图 2-1 红树 ITS2PCR 扩增产物电泳 图 2-2 红树 psbA-trnHPCR 扩增产物电1.白骨壤 2.桐花树 3.红榄李 4.榄李 5.杯萼海桑 1.秋茄 2.白骨壤 3.桐花树 4.杯萼海桑 5.海6.海桑 7.海南海桑 8.卵叶海桑 9.红树 10.红茄傮 6.海南海桑 7.卵叶海桑 8.无瓣海桑 9.拟海11.红海榄 12.木榄 13 海莲 14.尖瓣海莲 15.角果木16.秋茄 17.无瓣海桑 18.拟海桑
3.3 测序与序列的拼接经电泳检测后的 PCR 扩增产物，送样测序。测序的原理参照参考文献 90。主要测序技术是 Sanger 等的双脱氧末端终止法（酶法）。本研究使用 ABI3730XL测序仪双向测序获得序列文件。3.4 数据处理测序获得的峰图使用 CodonCode Aligner V 2.06（CodonCode Co.,USA）仪器校对拼接，去除质量较低以及引物区序列。ITS2 序列使用基于隐马尔科夫模型的 HMMer 注释方法去除两端的 5.8S 和 28S 区段以获得 ITS2 间隔区序列，图 2-1 红树 ITS2PCR 扩增产物电泳 图 2-2 红树 psbA-trnHPCR 扩增产物电1.白骨壤 2.桐花树 3.红榄李 4.榄李 5.杯萼海桑 1.秋茄 2.白骨壤 3.桐花树 4.杯萼海桑 5.海6.海桑 7.海南海桑 8.卵叶海桑 9.红树 10.红茄傮 6.海南海桑 7.卵叶海桑 8.无瓣海桑 9.拟海11.红海榄 12.木榄 13 海莲 14.尖瓣海莲 15.角果木16.秋茄 17.无瓣海桑 18.拟海桑
【学位授予单位】：山东中医药大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：S567.19
本文编号：2706964
【图文】：
3.3 测序与序列的拼接经电泳检测后的 PCR 扩增产物，送样测序。测序的原理参照参考文献 90。主要测序技术是 Sanger 等的双脱氧末端终止法（酶法）。本研究使用 ABI3730XL测序仪双向测序获得序列文件。3.4 数据处理测序获得的峰图使用 CodonCode Aligner V 2.06（CodonCode Co.,USA）仪器校对拼接，去除质量较低以及引物区序列。ITS2 序列使用基于隐马尔科夫模型的 HMMer 注释方法去除两端的 5.8S 和 28S 区段以获得 ITS2 间隔区序列，图 2-1 红树 ITS2PCR 扩增产物电泳 图 2-2 红树 psbA-trnHPCR 扩增产物电1.白骨壤 2.桐花树 3.红榄李 4.榄李 5.杯萼海桑 1.秋茄 2.白骨壤 3.桐花树 4.杯萼海桑 5.海6.海桑 7.海南海桑 8.卵叶海桑 9.红树 10.红茄傮 6.海南海桑 7.卵叶海桑 8.无瓣海桑 9.拟海11.红海榄 12.木榄 13 海莲 14.尖瓣海莲 15.角果木16.秋茄 17.无瓣海桑 18.拟海桑
3.3 测序与序列的拼接经电泳检测后的 PCR 扩增产物，送样测序。测序的原理参照参考文献 90。主要测序技术是 Sanger 等的双脱氧末端终止法（酶法）。本研究使用 ABI3730XL测序仪双向测序获得序列文件。3.4 数据处理测序获得的峰图使用 CodonCode Aligner V 2.06（CodonCode Co.,USA）仪器校对拼接，去除质量较低以及引物区序列。ITS2 序列使用基于隐马尔科夫模型的 HMMer 注释方法去除两端的 5.8S 和 28S 区段以获得 ITS2 间隔区序列，图 2-1 红树 ITS2PCR 扩增产物电泳 图 2-2 红树 psbA-trnHPCR 扩增产物电1.白骨壤 2.桐花树 3.红榄李 4.榄李 5.杯萼海桑 1.秋茄 2.白骨壤 3.桐花树 4.杯萼海桑 5.海6.海桑 7.海南海桑 8.卵叶海桑 9.红树 10.红茄傮 6.海南海桑 7.卵叶海桑 8.无瓣海桑 9.拟海11.红海榄 12.木榄 13 海莲 14.尖瓣海莲 15.角果木16.秋茄 17.无瓣海桑 18.拟海桑
【学位授予单位】：山东中医药大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：S567.19
【参考文献】
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，本文编号：2706964
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