大豆种皮色相关基因的图位克隆及功能解析
发布时间：2021-02-18 23:12
大豆种皮色是一个重要的驯化性状和形态标记,同时与种子的外观品质及商品性密切相关,而且种皮颜色形成的主要物质花色苷类对人体有保健功能,因此对大豆种皮颜色进行研究不仅具有重要的理论意义,还具有实用价值。本研究通过关联分析和连锁分析结合的方法,对控制大豆种皮色基因\位点进行鉴定,并通过图位克隆技术克隆目的基因,在此基础上对其进行功能验证及进化分析。主要结果如下:1.通过关联分析和BSA连锁分析共同鉴定出4个种皮色相关位点,并开展了精细定位。通过全基因组关联分析,鉴定出14个与大豆种皮颜色相关的位点,包括9个新位点和5个已报道的位点。利用遗传分离群体,验证了其中4个位点,并对其中3个位点开展了精细定位。明确了该群体种皮颜色的遗传基础,利用这4个位点可以完全解释该群体种皮颜色的所有变化。2.图位克隆控制黄/绿种皮颜色的基因GmSG。在精细定位的基础上,图位克隆qSC1位点的候选基因GmSG,在黄/绿的大豆中由A-G碱基突变造成内含子剪切位置发生改变进而导致基因编码序列提前终止。该基因在大豆驯化过程中进行了人工选择,人们有意选择黄种皮早熟的现代大豆品种。3.GmSG具有叶片和种皮滞绿的功能。通过近...
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：114 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
I、R、T与种皮色关系（Yangetal.,2010）
国农业科学院博士学位论文 第一章 引言缺失。AGO5 是 Argonaute 蛋白家族的一员，该位点可调节 CHS siRNA 在种皮内产生的空间调。独立发生的自发突变也显示出AGO5基因的不同变异对其预测的蛋白质结构有显著影响。ago5功能似乎与CHS siRNAs的空间分布是相关的，从而解释了k1等位基因是如何逆转种子表型的。 等位基因的非功能性 AGO5 导致 CHS siRNA 的分布发生改变，从而解释了 k1 突变如何将种皮域的表型从黄色逆转为色素，甚至在通常占优势的 I 或 ii等位基因存在的情况下也是如此（Cho al., 2017）。
图 1-3 叶绿素降解途径（Schelbert et al., 2009）Fig 1-3. Pathway of chlorophyll degradation（Schelbert et al., 2009）成酶，CAO：叶绿素 a 氧化酶，PPH：脱镁叶绿素水解酶，PAO：脱镁酶，NOL/NYC1：叶绿素 b 还原酶，CLH：叶绿素镁螯合酶 synthase，CAO: Chlorophyll a oxidase，PPH: Pheophytin pheophase，RCCR: Red chlorophyll catabolite reductase，NOL/NYC1: Chlorol chelatase过程相关基因能型突变体的滞绿性状主要受 PAO（pheophorbide a COLORING 1）、NOL（NYC1-LIKE）、PPH（pheophytin phSGR/SGRL（STAYGREEN/SGR-LIKE）等基因调控（Pru al., 2007; Horie et al., 2009; Schelbert et al., 2009; 孙佩光等,芥中，叶绿素 b 还原酶是由 NYC1 和 NOL 编码。研究发现型，而 nyc1 单突变体和 nol nyc1 双突变体的叶绿素降解滞留；拟南芥叶绿素 b 还原酶 NOL 和 NYC1 基因突变时，
本文编号：3040237
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：114 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
I、R、T与种皮色关系（Yangetal.,2010）
国农业科学院博士学位论文 第一章 引言缺失。AGO5 是 Argonaute 蛋白家族的一员，该位点可调节 CHS siRNA 在种皮内产生的空间调。独立发生的自发突变也显示出AGO5基因的不同变异对其预测的蛋白质结构有显著影响。ago5功能似乎与CHS siRNAs的空间分布是相关的，从而解释了k1等位基因是如何逆转种子表型的。 等位基因的非功能性 AGO5 导致 CHS siRNA 的分布发生改变，从而解释了 k1 突变如何将种皮域的表型从黄色逆转为色素，甚至在通常占优势的 I 或 ii等位基因存在的情况下也是如此（Cho al., 2017）。
图 1-3 叶绿素降解途径（Schelbert et al., 2009）Fig 1-3. Pathway of chlorophyll degradation（Schelbert et al., 2009）成酶，CAO：叶绿素 a 氧化酶，PPH：脱镁叶绿素水解酶，PAO：脱镁酶，NOL/NYC1：叶绿素 b 还原酶，CLH：叶绿素镁螯合酶 synthase，CAO: Chlorophyll a oxidase，PPH: Pheophytin pheophase，RCCR: Red chlorophyll catabolite reductase，NOL/NYC1: Chlorol chelatase过程相关基因能型突变体的滞绿性状主要受 PAO（pheophorbide a COLORING 1）、NOL（NYC1-LIKE）、PPH（pheophytin phSGR/SGRL（STAYGREEN/SGR-LIKE）等基因调控（Pru al., 2007; Horie et al., 2009; Schelbert et al., 2009; 孙佩光等,芥中，叶绿素 b 还原酶是由 NYC1 和 NOL 编码。研究发现型，而 nyc1 单突变体和 nol nyc1 双突变体的叶绿素降解滞留；拟南芥叶绿素 b 还原酶 NOL 和 NYC1 基因突变时，
本文编号：3040237
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