文冠果bZIP转录因子家族鉴定和非生物胁迫应答模式分析

发布时间：2024-06-14 19:31

　　文冠果是我国特有的珍稀木本粮油树种,其环境适应能力极强,具有耐寒、耐旱、耐贫瘠、耐盐碱等生理特性。由于文冠果基因组信息不完善,其分子机理方面的研究鲜有报道。碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子家族是真核生物中分布最广泛且最保守的转录因子家族之一,在调节植物的生长发育和响应生物及非生物胁迫中发挥着至关重要的作用。文冠果全基因组测序的完成为从分子层面揭开文冠果抗逆响应机理奠定了基础。本研究首次在文冠果全基因组数据中挖掘bZIP家族基因,并对其进行了系统地分析,得出以下结论:1、根据文冠果全基因组测序信息,从文冠果基因组中鉴定得到64个文冠果bZIP家族转录因子。2、基于XsbZIP与AtbZIP、ZmbZIP和GmbZIP转录因子家族成员的系统发育关系构建进化树,将64个XsbZIP转录因子家族成员分为11个亚家族(A至I,S和U)。3、根据bZIP结构域碱性区和铰链区内含子数量、位置和相位,将XsbZIP基因分为五种模式(a、b、c、d和e)。4、共鉴定出XsbZIP转录因子中的20个保守基序,某些保守基序可能赋予了基因特定的功能。5、相比于串联重复,片段重复在文冠果bZIP基因家族的扩增...

【文章页数】：65 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２４Ａ＾Ｚ／／＞基因ｂＺＩＰ结构域碱性区和铰链区内含子模式??根据内含子数量、位置和相位，文冠果６Ｚ／Ｐ家族基因可被分为五种模式（ａ、６、ｃ、ｄ和ｅ）

?东北林业大学硕士学位论文???碱性区?铰链区??内含子模式内含子数量?＾＾——＾?ＸｓｂＺＩＰ蛋白数目?亚家族??－２５?－２０?－１５?－１０?－５?＋１??Ｐ０??１７?九?Ｇ，Ｕ??｜Ｐ０?｜Ｐ０?？?＾??ｂ?Ｄ??１?１９?Ｃ，Ｅ，Ｈ，Ｉ，Ｕ??｜Ｐ２?．??０?１６....

图３非生物胁迫和ＡＢＡ处理后ｊＭＺ／／５基因表达模式??（ａ）文冠果６Ｚ／尸基因表达模式热图

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本文编号：3994324