油菜种子发育过程中基于动态QTL和时序转录组的含油量遗传解析

发布时间：2021-03-10 01:30

　　我国食用油供应严重不足,油菜作为我国第一大油料作物,提高其含油量是当前研究的主要方向之一。然而油菜种子含油量积累的遗传机制和优良候选基因鉴定的基础研究相对不足。本研究以KN DH群体348个株系为材料,利用芸薹属60K SNP芯片分型,构建了一张覆盖基因组长度3072.7c M（A和C基因组的覆盖长度分别是1398.6 c M和1674.1c M）,包含3207个分子标记（3106个SNP-bin和101个非SNP标记）的高密度SNP遗传连锁图。基于此遗传连锁图,对12个环境中成熟种子含油量进行数量性状位点（Quantitative Trait Loci,QTL）定位,鉴定到67个含油量QTL,其中包括5个新发现的含油量主效QTL。蛋白质和油脂合成存在明显竞争,为了解析其遗传基础,基于高密度遗传连锁图对11个环境中的含油量和蛋白质含量进行QTL共定位分析。11个具有相反加性效应的含油量和蛋白质含量共定位QTL以及位于C03和C05上加性效应相反的QTL热点区,揭示了一因多效和紧密连锁效应共同决定了油和蛋白质较强的竞争性关系。目前为止,油菜含油量QTL定位均是基于成熟种子,但种子不同发育... 

【文章来源】：华中科技大学湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：234 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

甘蓝型油菜基因组复制模式图[147]

华中科技大学博士学位论文24有77个；A03连锁群上最多，多达324个。该图谱标记间平均密度为0.96cM/Marker，且每条连锁群上的标记密度不等，最高的是A04（0.56cM/Marker），156个标记分布在86.8cM的遗传距离内。图2.1KN高密度遗传连锁图及标记在连锁群上的分布Figure2.1theKNhigh-densitylinkagemapanddistributionofmarkersonlinkagegroups.Bandsonthelinkagegrouprepresentmarkers.

华中科技大学博士学位论文26图2.2KN高密度遗传连锁图和参考基因组的线性关系Figure2.2ThecollinearrelationshipoftheKNhigh-densitygeneticmapandthereferencegenome.Theblockswithcolorattheoutermostcirclerepresentthe19linkagegroups,andinnercirclerepresentsthe19chromosomesofB.napus.2.4讨论早期PCR扩增和限制性酶切类型的分子标记，如RFLP、SSR和AFLP等，开发难度大，构建一张遗传连锁图需要花费大量的人力物力。由于传统标记的种种限制，构建的遗传连锁图标记通常比较少，密度较低，其QTL的检测效率和精确度都相对较低。但随着第二代测序技术的发展，以SNP为代表的第三代分子标记因其省时、快捷和高通量等优点，已经在作物遗传育种和基因组学研究中得到了广泛的应用。另外，GoldenGate,Infinium和第二代测序技术平台的应用，使得同时对大量的

【参考文献】：
期刊论文
[1]甘蓝型油菜籽粒含油量、蛋白质、纤维素及半纤维素含量QTL分析[J]. 马珍珍,李加纳,Benjamin WITTKOP,Martin FRAUEN,阎星颖,刘列钊,肖阳.  作物学报. 2013(07)
[2]高通量测序技术在动植物研究领域中的应用[J]. 岳桂东,高强,罗龙海,王军一,许姣卉,尹烨.  中国科学:生命科学. 2012(02)
[3]野生稻高产QTL导入晚稻恢复系的增产效果[J]. 杨益善,邓启云,陈立云,邓化冰,庄文,熊跃东.  分子植物育种. 2006(01)
[4]核磁共振（NMR）测量油菜籽含油量的应用[J]. 王竹云,杨翠玲.  西部粮油科技. 2000(06)



本文编号：3073817