玉米单倍体诱导效应分析与机器学习在DH技术中的应用
发布时间:2021-04-14 14:36
玉米单倍体技术目前已经在生产上得到广泛应用,高效的诱导以及准确快速的单倍体鉴别为规模化生产单倍体提供保障。目前关于单倍体诱导的研究主要集中在诱导系的父本效应,对于母本效应知之甚少;此外如何系统的应用单倍体技术实现工程化育种也是迫切需要解决的问题。本研究从母本可诱导性的QTL定位阐述单倍体诱导的母本效应。利用B73背景的染色体片段代换系分析诱导率QTL qhir8的效应。通过遗传距离分析父母本互作与诱导率的关系。同时探讨机器学习在单倍体鉴别、自然加倍预测以及DH系选择中的应用。这些研究将为单倍体技术的工程化奠定理论基础。本研究主要内容如下:1.利用齐319和昌7-2的F1衍生出包含135个家系的DH群体。在北京、济南、石家庄、三亚四个地点种植DH群体,利用诱导系CHO13进行诱导并统计诱导率。结合DH群体的6KSNP芯片数据构建的遗传连锁图谱,对控制母本可诱导性的QTL进行定位。四个环境下共检测到13个QTL,其中三亚和石家庄两个环境下的QTL效应值较高,表型贡献率分别为22.14%和17.44%。这两个主效QTL在其他环境也被检测,为后续的精细定位提供依据。2.利用B73背景的染色体片...
【文章来源】:中国农业大学北京市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:117 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图1-1在胚和胚乳颜色表达清晰度变异(引自Prasanna等,2012)??Fig.?1-1?Variation?in?Rl-?nj?expression?on?the?embryo?and?endospemi?(cited?from?Prasanna?et?al,?2012)??为了突破颜色抑制基因对单倍体鉴别的限制,陈绍江和宋同明等(2003)根据花粉直感效应??
2.3.2表型数据校正??采用R中的lme4包拟合混合线性分析模型对DH群体的母本可诱导性进行多环境下的BLUP??结果如图2-3A所示。??A??—?-??§1?1?。-?/??f?[?1?^?/??g?「?^?y/??「?1??O?」?J?1?1?■????.…1?*"?.??1
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【参考文献】:
期刊论文
[1]基于近红外光谱的果蔬脆片品质评价方法研究[J]. 刘静,杜广全,管骁. 分析科学学报. 2017(01)
[2]玉米单倍体雄穗自然加倍性轮选遗传修复与高加倍率材料的创制[J]. 才卓,徐国良,任军,代玉仙,于明艳,李淑华,刘小丹,郭琦,王丽娜,张銘堂. 玉米科学. 2016(04)
[3]Genetic dissection of maize seedling root system architecture traits using an ultra-high density bin-map and a recombinant inbred line population[J]. Weibin Song,Baobao Wang,Andrew L Hauck,Xiaomei Dong,Jieping Li,Jinsheng Lai. Journal of Integrative Plant Biology. 2016(03)
[4]基于近红外漫反射与漫透射光谱的玉米单倍体鉴别比较研究(英文)[J]. 覃鸿,马竞一,陈绍江,严衍禄,李卫军,王平,刘金. 光谱学与光谱分析. 2016(01)
[5]玉米单倍体自然二倍化研究[J]. 吴鹏昊,任姣姣,田小龙,王乐乐,李国梁,刘文欣,陈绍江. 中国农业大学学报. 2016(01)
[6]基于机器视觉的玉米单倍体自动分选系统[J]. 李卫军,刘玉梅,陈绍江,覃鸿,刘金,田震. 农机化研究. 2016(01)
[7]应用近红外反射和透射光谱法鉴定玉米杂交种的纯度[J]. 李天昕,贾仕强,刘旭,赵盛毅,冉航,严衍禄,安冬. 光谱学与光谱分析. 2015(12)
[8]基于可见光光谱高效鉴别玉米单倍体籽粒(英文)[J]. 刘金,郭婷婷,李浩川,贾仕强,严衍禄,安冬,张垚,陈绍江. 光谱学与光谱分析. 2015(11)
[9]玉米单倍体诱导系对不同母本资源诱导效果的比较[J]. 苏娟娟,景希强. 玉米科学. 2015(02)
[10]玉米自交系单倍体诱导率的研究[J]. 刘丽,于丽娟,毕亚琪,张培高. 中国农业科技导报. 2014(05)
博士论文
[1]玉米单倍体自动化鉴别与新型诱导系选育研究[D]. 刘金.中国农业大学 2015
[2]玉米单倍体诱导基因qhir1精细定位与新型诱导系选育研究[D]. 董昕.中国农业大学 2014
[3]结合大重组自交系群体和超高密度分子标记进行玉米重要农艺性状的QTL定位[D]. 王宝宝.中国农业大学 2014
硕士论文
[1]基于机器学习的分类算法研究[D]. 裴松年.中北大学 2016
[2]面向近红外光谱药品鉴别的高效机器学习算法研究[D]. 蒋淑洁.桂林电子科技大学 2015
本文编号:3137494
【文章来源】:中国农业大学北京市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:117 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图1-1在胚和胚乳颜色表达清晰度变异(引自Prasanna等,2012)??Fig.?1-1?Variation?in?Rl-?nj?expression?on?the?embryo?and?endospemi?(cited?from?Prasanna?et?al,?2012)??为了突破颜色抑制基因对单倍体鉴别的限制,陈绍江和宋同明等(2003)根据花粉直感效应??
2.3.2表型数据校正??采用R中的lme4包拟合混合线性分析模型对DH群体的母本可诱导性进行多环境下的BLUP??结果如图2-3A所示。??A??—?-??§1?1?。-?/??f?[?1?^?/??g?「?^?y/??「?1??O?」?J?1?1?■????.…1?*"?.??1
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【参考文献】:
期刊论文
[1]基于近红外光谱的果蔬脆片品质评价方法研究[J]. 刘静,杜广全,管骁. 分析科学学报. 2017(01)
[2]玉米单倍体雄穗自然加倍性轮选遗传修复与高加倍率材料的创制[J]. 才卓,徐国良,任军,代玉仙,于明艳,李淑华,刘小丹,郭琦,王丽娜,张銘堂. 玉米科学. 2016(04)
[3]Genetic dissection of maize seedling root system architecture traits using an ultra-high density bin-map and a recombinant inbred line population[J]. Weibin Song,Baobao Wang,Andrew L Hauck,Xiaomei Dong,Jieping Li,Jinsheng Lai. Journal of Integrative Plant Biology. 2016(03)
[4]基于近红外漫反射与漫透射光谱的玉米单倍体鉴别比较研究(英文)[J]. 覃鸿,马竞一,陈绍江,严衍禄,李卫军,王平,刘金. 光谱学与光谱分析. 2016(01)
[5]玉米单倍体自然二倍化研究[J]. 吴鹏昊,任姣姣,田小龙,王乐乐,李国梁,刘文欣,陈绍江. 中国农业大学学报. 2016(01)
[6]基于机器视觉的玉米单倍体自动分选系统[J]. 李卫军,刘玉梅,陈绍江,覃鸿,刘金,田震. 农机化研究. 2016(01)
[7]应用近红外反射和透射光谱法鉴定玉米杂交种的纯度[J]. 李天昕,贾仕强,刘旭,赵盛毅,冉航,严衍禄,安冬. 光谱学与光谱分析. 2015(12)
[8]基于可见光光谱高效鉴别玉米单倍体籽粒(英文)[J]. 刘金,郭婷婷,李浩川,贾仕强,严衍禄,安冬,张垚,陈绍江. 光谱学与光谱分析. 2015(11)
[9]玉米单倍体诱导系对不同母本资源诱导效果的比较[J]. 苏娟娟,景希强. 玉米科学. 2015(02)
[10]玉米自交系单倍体诱导率的研究[J]. 刘丽,于丽娟,毕亚琪,张培高. 中国农业科技导报. 2014(05)
博士论文
[1]玉米单倍体自动化鉴别与新型诱导系选育研究[D]. 刘金.中国农业大学 2015
[2]玉米单倍体诱导基因qhir1精细定位与新型诱导系选育研究[D]. 董昕.中国农业大学 2014
[3]结合大重组自交系群体和超高密度分子标记进行玉米重要农艺性状的QTL定位[D]. 王宝宝.中国农业大学 2014
硕士论文
[1]基于机器学习的分类算法研究[D]. 裴松年.中北大学 2016
[2]面向近红外光谱药品鉴别的高效机器学习算法研究[D]. 蒋淑洁.桂林电子科技大学 2015
本文编号:3137494
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