小麦叶片顺序和非顺序衰老转录组数据分析

发布时间：2021-05-07 16:59

　　非顺序衰老小麦是灌浆后期旗叶早于倒二叶衰老的一类小麦。而顺序衰老小麦是按照叶片发育早晚的顺序从下向上渐次衰老的一类小麦。与顺序衰老小麦相比,非顺序衰老小麦具有较高的产量和抗逆性。论文以顺序衰老小麦（NR9405）和非顺序衰老小麦（温麦19）为材料,应用数字基因表达谱技术对两种衰老类型小麦旗叶在扬花后25d、30d和32d的基因表达量进行检测,筛选花后25d和30d,30d和32d旗叶的差异表达基因,并对差异表达基因进行GO、KEGG富集分析和表达谱的加权基因共表达网络分析,从转录水平揭示小麦叶片顺序和非顺序衰老的形成机制及其在小麦生产中的应用价值。主要取得如下结论:1.顺序衰老小麦NR9405花后30d与25d相比,差异表达基因共计6659个,其中上调表达基因3404个,下调表达基因3255个;花后32d与30d相比,差异表达基因共计4058个,其中上调表达基因3017个,下调表达基因1041个。非顺序衰老小麦温麦19花后30d与25d相比,差异表达基因共计13609个,其中上调表达基因7454个,下调表达基因6155个;花后32d与30d相比,差异表达基因共计6321个,其中上调表达... 

【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：69 页

【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
    1.1 选题背景,目的和意义
    1.2 植物叶片衰老
        1.2.1 植物叶片衰老的内源因素
        1.2.2 植物叶片衰老的外源因素
        1.2.3 植物衰老基因
    1.3 顺序型衰老小麦和非顺序衰老小麦研究
    1.4 RNA-Seq技术
    1.5 基因功能注释
    1.6 加权基因共表达网络分析
第二章 小麦叶片非顺序和顺序衰老数字基因表达谱分析
    2.1 植物材料
    2.2 数据分析
        2.2.1 测序数据处理及比较分析
        2.2.2 差异基因分析
        2.2.3 差异基因富集分析
        2.2.4 差异基因RT-q PCR验证
    2.3 结果与分析
        2.3.1 测序结果评估
        2.3.2 差异基因的分析
        2.3.3 差异表达基因GO富集分析
        2.3.4 差异表达基因KEGG路径富集分析
        2.3.5 差异表达基因的RT-q PCR验证
    2.4 讨论
第三章 非顺序和顺序衰老小麦加权基因共表达网络构建
    3.1 试验材料
    3.2 试验方法
        3.2.1 WGCNA构建两种衰老类型小麦在衰老过程中共表达网络
        3.2.2 基因网络模块可视化及分析
    3.3 结果与分析
        3.3.1 两种衰老类型小麦加权基因共表达网络的构建
        3.3.2 顺序衰老小麦的核心基因
        3.3.3 非顺序衰老小麦核心基因的筛选
    3.4 讨论
        3.4.1 小麦衰老与转运相关基因的关系
        3.4.2 小麦衰老和光合作用相关基因的关系
        3.4.3 小麦衰老和其他相关基因的关系
第四章 结论和展望
    4.1 结论
    4.2 创新点
    4.3 展望
参考文献
致谢
个人简历



本文编号：3173757