水稻microRNA1876功能验证与生物信息学分析

发布时间：2021-05-16 08:39

　　MicroRNA （miRNA）是一类由内源基因组转录的有基因调控功能的非编码短序列RNA,在动植物中参与转录后基因表达调控。为了研究Osa-miRNA1876基因功能,本研究对Osa-miRNA1876进行生物信息学分析,分析出启动子区间有与逆境相关的主要顺式作用元件ARE、GC-motif、GT1-motif、Sp1和LTR,并预测到了靶基因Os02t0476700-01。通过茎环法q RT-PCR,以水稻U6基因为内参基因,对Osa-miRNA1876在水稻分蘖期进行了相对定量。在水稻基因组中,克隆得到Osa-miRNA1876的前体基因,并根据Osa-miRNA1876序列设计了短串联靶标模拟物（short tandem target mimic, STTM）功能片段;将二者整合到植物表达载体pCAMIBA1390,分别获得了过表达载体pOsa-miRNA1876-OE和干扰载体pOsa-miRNA1876-STTM。用于后续的Osa-miRNA1876基因功能研究。 

【文章来源】：分子植物育种. 2020,18(07)北大核心CSCD

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 生物信息学分析
        1.1.1 获得Osa-miRNA1876和Osa-pre-miRNA1876基因序列
        1.1.2 Osa-pre-miRNA1876基因上游500～1 500 nt序列分析
        1.1.3 靶基因预测
    1.2 过表达载体和STTM载体目的片段的获得
    1.3 获得重组质粒及阳性克隆鉴定分析
    1.4 qRT-PCR结果分析
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 试验材料
    3.2 生物信息学分析
    3.3 载体构建
    3.4 荧光定量
    3.5 引物设计
作者贡献


【参考文献】：
期刊论文
[1]Development and Application of CRISPR/Cas System in Rice[J]. REN Jun,HU Xixun,WANG Kejian,WANG Chun.  Rice Science. 2019(02)
[2]抑癌基因miR-195对口腔癌细胞CAL27生物学特性的影响[J]. 程刚,高振.  基因组学与应用生物学. 2018(10)
[3]microRNA响应植物非生物胁迫的研究进展[J]. 肖敏敏,陈信波.  分子植物育种. 2018(10)
[4]烟草microRNA171c的功能分析[J]. 张力,沙爱华.  植物科学学报. 2016(05)



本文编号：3189367